More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3430 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3430  ABC transporter related  100 
 
 		 515 aa  1045    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00425345  hitchhiker  0.000423726 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0887  ABC transporter related  42.35 
 
 		 497 aa  364  2e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.749909 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4186  ABC transporter related  41.55 
 
 		 499 aa  350  2e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000574124 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  38.73 
 
 		 497 aa  323  4e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  38.26 
 
 		 505 aa  311  2e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  37.96 
 
 		 514 aa  308  2.0000000000000002e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0832  ABC transporter related  37.37 
 
 		 520 aa  307  4.0000000000000004e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0809  ABC transporter related  37.37 
 
 		 509 aa  306  6e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2492  ABC transporter related protein  36.07 
 
 		 498 aa  305  9.000000000000001e-82  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  39.35 
 
 		 519 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  36.8 
 
 		 508 aa  303  5.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2010  ABC transporter related  33.68 
 
 		 500 aa  302  1e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  36.12 
 
 		 503 aa  301  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  36.9 
 
 		 510 aa  302  1e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  35.11 
 
 		 507 aa  301  2e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  35.4 
 
 		 513 aa  301  2e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  35.32 
 
 		 501 aa  300  3e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  0.000000993507 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  35.8 
 
 		 497 aa  300  3e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  34.7 
 
 		 496 aa  300  4e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  38.88 
 
 		 495 aa  300  4e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  34.92 
 
 		 501 aa  299  7e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  36.09 
 
 		 513 aa  299  8e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  35.46 
 
 		 501 aa  298  1e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3699  ABC transporter related protein  36.73 
 
 		 510 aa  298  1e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92688  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  36.33 
 
 		 504 aa  299  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  34.76 
 
 		 501 aa  298  1e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1212  ABC transporter related  35.96 
 
 		 511 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2211  ABC transporter-related protein  36.9 
 
 		 535 aa  298  1e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.139274 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  37.35 
 
 		 495 aa  298  2e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  36.72 
 
 		 503 aa  298  2e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  34.76 
 
 		 501 aa  298  2e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  35.05 
 
 		 501 aa  297  4e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  36.23 
 
 		 512 aa  296  4e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3977  D-ribose transporter ATP binding protein  35.12 
 
 		 501 aa  296  4e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3706  ABC transporter related  37.01 
 
 		 506 aa  296  4e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594267  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  34.6 
 
 		 501 aa  296  6e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  35.88 
 
 		 513 aa  296  6e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2595  ABC transporter related  37.7 
 
 		 537 aa  296  8e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.870253  normal  0.943264 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  33.95 
 
 		 504 aa  295  1e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4768  ABC transporter related  38.68 
 
 		 503 aa  295  1e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957059  normal  0.347139 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  35.6 
 
 		 494 aa  295  1e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4608  ABC transporter related  36.96 
 
 		 519 aa  295  2e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1601  ABC transporter related  36.27 
 
 		 525 aa  294  3e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  34.2 
 
 		 501 aa  294  3e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2787  ABC transporter for sugar (aldose) ATP-binding protein  35.26 
 
 		 495 aa  294  3e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0149064  normal  0.48477 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0813  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  35.19 
 
 		 499 aa  294  3e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0813  ABC transporter related  35.19 
 
 		 499 aa  293  4e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1781  ABC transporter related  37.58 
 
 		 503 aa  293  5e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000368661  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  36.44 
 
 		 504 aa  293  7e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6267  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  36.19 
 
 		 511 aa  292  1e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0226  ABC transporter related  36.4 
 
 		 503 aa  291  1e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.973654  normal  0.104566 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0291  ABC transporter related  37.85 
 
 		 514 aa  291  2e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  34.84 
 
 		 503 aa  291  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  36.14 
 
 		 516 aa  290  3e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0157  sugar ABC transporter ATP-binding protein  34.98 
 
 		 499 aa  290  4e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000963677 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  35.71 
 
 		 514 aa  290  4e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4265  D-ribose transporter ATP binding protein  34.96 
 
 		 501 aa  290  4e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06145  D-ribose transporter ATP binding protein  33.81 
 
 		 501 aa  290  4e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0881  ABC transporter related protein  37.53 
 
 		 499 aa  290  4e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.873937  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6711  ABC transporter related  36.69 
 
 		 511 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2447  ABC transporter related protein  34.2 
 
 		 495 aa  290  6e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000548266  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3851  ABC transporter related protein  37.35 
 
 		 521 aa  290  6e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  35.93 
 
 		 512 aa  289  8e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  35.93 
 
 		 512 aa  289  8e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  34.96 
 
 		 501 aa  289  9e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  34.96 
 
 		 501 aa  289  9e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159229 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  34.96 
 
 		 501 aa  289  1e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03580  hypothetical protein  34.96 
 
 		 501 aa  289  1e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550483  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5810  ABC transporter related  36.09 
 
 		 511 aa  289  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.644683  normal  0.0896237 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3965  D-ribose transporter ATP binding protein  34.96 
 
 		 501 aa  289  1e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4109  D-ribose transporter ATP binding protein  34.63 
 
 		 516 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114584  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  37.83 
 
 		 502 aa  288  2e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  36.14 
 
 		 499 aa  288  2e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  35.21 
 
 		 494 aa  288  2e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  36 
 
 		 512 aa  288  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4245  D-ribose transporter ATP binding protein  34.96 
 
 		 501 aa  288  2e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0036959 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  35.62 
 
 		 496 aa  288  2e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4094  D-ribose transporter ATP binding protein  34.63 
 
 		 516 aa  287  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3319  ABC transporter related  36.68 
 
 		 499 aa  287  2.9999999999999996e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.612021  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  37.04 
 
 		 514 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4274  D-ribose transporter ATP binding protein  34.63 
 
 		 516 aa  287  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  34.09 
 
 		 500 aa  287  2.9999999999999996e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2119  ABC transporter related  34.88 
 
 		 504 aa  286  4e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.307687  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3596  ABC transporter related  37.04 
 
 		 509 aa  286  4e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.979323  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4215  D-ribose transporter ATP binding protein  34.63 
 
 		 516 aa  287  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.777457 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4165  D-ribose transporter ATP binding protein  34.63 
 
 		 501 aa  287  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.846402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5185  D-ribose transporter ATP binding protein  34.76 
 
 		 501 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0631054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  34.73 
 
 		 524 aa  286  8e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  33.26 
 
 		 508 aa  286  9e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  34.79 
 
 		 494 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  36.83 
 
 		 514 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  36.83 
 
 		 514 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4850  ABC transporter related  38.62 
 
 		 503 aa  285  1.0000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0808  ABC transporter related  37.99 
 
 		 604 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  35 
 
 		 494 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  35 
 
 		 494 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  35 
 
 		 494 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  37.37 
 
 		 495 aa  285  2.0000000000000002e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0341  D-ribose transporter ATP binding protein  33.06 
 
 		 501 aa  284  2.0000000000000002e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1964  ABC transporter related  36.59 
 
 		 513 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.962291 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>