More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3311 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3311  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  100 
 
 		 274 aa  543  1e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000227592  normal  0.0451288 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  28.68 
 
 		 268 aa  88.6  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4730  Cof-like hydrolase  29.39 
 
 		 270 aa  87.8  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3056  Cof-like hydrolase  26.56 
 
 		 268 aa  85.9  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0296  Cof-like hydrolase  27.82 
 
 		 269 aa  85.9  7e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2883  Cof-like hydrolase  30.39 
 
 		 282 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0257  HAD family hydrolase  29.01 
 
 		 272 aa  83.2  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3191  Cof-like hydrolase  30.34 
 
 		 291 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4173  sugar phosphatase  27.05 
 
 		 269 aa  81.3  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.729204  hitchhiker  0.0085653 
 
 
-
 
NC_002936  DET1218  HAD family hydrolase  26.02 
 
 		 271 aa  80.5  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0511  HAD superfamily hydrolase  24.63 
 
 		 270 aa  80.5  0.00000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.930094  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2987  Cof protein/HAD-superfamily hydrolase  27.92 
 
 		 269 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.50088 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0607  Cof-like hydrolase  29.89 
 
 		 271 aa  80.1  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000496024  normal  0.512599 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3946  HAD family hydrolase  29.63 
 
 		 273 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292051  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4149  sugar phosphatase  26.69 
 
 		 269 aa  79.7  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.680051  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0005  sugar phosphatase  26.69 
 
 		 269 aa  79.7  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16120  Cof-like hydrolase  26.45 
 
 		 267 aa  79.3  0.00000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0036  sugar phosphatase  25.09 
 
 		 271 aa  79.3  0.00000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.148039 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3865  HAD family hydrolase  30.4 
 
 		 273 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2588  Cof protein  30.57 
 
 		 269 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20027 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0140  Cof-like hydrolase  22.88 
 
 		 262 aa  78.6  0.00000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3444  HAD family hydrolase  29.63 
 
 		 273 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.722541  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2869  Cof-like hydrolase  29.63 
 
 		 273 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0086  Cof-like hydrolase  30.48 
 
 		 280 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1675  HAD family hydrolase  29.63 
 
 		 273 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1028  Cof-like hydrolase  26.02 
 
 		 271 aa  78.6  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3106  HAD family hydrolase  29.63 
 
 		 273 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.24744  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2123  Cof-like hydrolase  23.4 
 
 		 266 aa  77.8  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000204309  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4160  Cof-like hydrolase  28.09 
 
 		 272 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183104  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0795  Cof-like hydrolase  25.56 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2136  Cof-like hydrolase  22.56 
 
 		 279 aa  77.4  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4220  putative hydrolase  26.09 
 
 		 244 aa  77  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4042  Cof-like hydrolase  28.62 
 
 		 271 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2032  Cof-like hydrolase  25 
 
 		 278 aa  77  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.201826 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01160  Cof subfamily of IIB subfamily of haloacid dehalogenase superfamily/HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  30.08 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3223  Cof-like hydrolase  26.77 
 
 		 273 aa  76.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1830  Cof-like hydrolase  26.46 
 
 		 260 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3948  Cof-like hydrolase  28.78 
 
 		 274 aa  76.3  0.0000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4000  Cof-like hydrolase  28.25 
 
 		 271 aa  76.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0121  Cof-like hydrolase  31.56 
 
 		 273 aa  75.9  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1001  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  25.28 
 
 		 271 aa  75.9  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0726  HAD superfamily hydrolase  26.17 
 
 		 274 aa  75.9  0.0000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1155  Cof-like hydrolase  30.15 
 
 		 270 aa  75.5  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269988  normal  0.0161592 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1388  Cof-like hydrolase  26.1 
 
 		 267 aa  75.5  0.0000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.323635  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4241  hydrolase, Cof family  26.09 
 
 		 244 aa  75.5  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5125  sugar phosphatase  24.73 
 
 		 270 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.231854 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf524  COF family HAD hydrolase protein  24.29 
 
 		 273 aa  75.1  0.000000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03580  predicted hydrolase  25.09 
 
 		 270 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0006  Cof-like hydrolase  25.09 
 
 		 270 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4062  sugar phosphatase  25.09 
 
 		 270 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03524  hypothetical protein  25.09 
 
 		 270 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4398  Cof family hydrolase  26.09 
 
 		 244 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4206  sugar phosphatase  25.09 
 
 		 270 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2983  Cof-like hydrolase  25.29 
 
 		 273 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.767906  hitchhiker  0.000000295074 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0853  Cof-like hydrolase  28.57 
 
 		 265 aa  74.3  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1111  HAD superfamily hydrolase  25.67 
 
 		 269 aa  74.7  0.000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.609626  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2460  HAD superfamily hydrolase  25.94 
 
 		 257 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00284871  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0006  sugar phosphatase  24.73 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3909  sugar phosphatase  24.73 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4223  sugar phosphatase  25.09 
 
 		 281 aa  73.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2525  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.04 
 
 		 257 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000564566  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4043  sugar phosphatase  25.27 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3733  HAD superfamily hydrolase  23.29 
 
 		 257 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4116  sugar phosphatase  25.09 
 
 		 281 aa  72.8  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0299  Cof-like hydrolase  27.94 
 
 		 259 aa  72.8  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4060  sugar phosphatase  25.27 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0005  sugar phosphatase  25.09 
 
 		 270 aa  72.4  0.000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5654  Cof-like hydrolase  29.55 
 
 		 267 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.166656 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4024  HAD superfamily hydrolase  23.29 
 
 		 257 aa  72  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4095  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  23.29 
 
 		 257 aa  72  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603342  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3120  Cof-like hydrolase family protein  26.67 
 
 		 272 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330489  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0949  Cof-like hydrolase  25.3 
 
 		 258 aa  71.6  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000135628  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3885  HAD superfamily hydrolase  24.4 
 
 		 257 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3424  Cof-like hydrolase  24.63 
 
 		 271 aa  71.6  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.925804  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3717  HAD superfamily hydrolase  24.4 
 
 		 257 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4188  HAD superfamily hydrolase  24.4 
 
 		 257 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3990  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  24.4 
 
 		 257 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0594  HAD family hydrolase  25.09 
 
 		 266 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1446  Cof-like hydrolase  22.02 
 
 		 265 aa  71.6  0.00000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4525  Cof-like hydrolase  27.57 
 
 		 273 aa  71.6  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.992091 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0414  Cof-like hydrolase  23.53 
 
 		 268 aa  71.6  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0522924  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3699  Cof-like hydrolase  27.45 
 
 		 265 aa  71.6  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.143093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf028  COF family HAD hydrolase protein  24.72 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3826  Cof-like hydrolase  27.65 
 
 		 273 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.503819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0365  HAD superfamily hydrolase  20.64 
 
 		 288 aa  70.9  0.00000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.231869  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0732  Cof-like hydrolase  24.18 
 
 		 287 aa  70.9  0.00000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1845  HAD superfamily hydrolase  25.84 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0569  Cof-like hydrolase  23.95 
 
 		 271 aa  70.9  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.122616  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5035  HAD family hydrolase  28.31 
 
 		 273 aa  70.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0548232 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2024  Cof-like hydrolase  29.12 
 
 		 281 aa  71.2  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4946  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0223  Cof-like hydrolase  24.01 
 
 		 273 aa  70.5  0.00000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0606328  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1752  HAD family hydrolase  26.98 
 
 		 271 aa  70.5  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00695054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0746  Cof-like hydrolase  21.07 
 
 		 273 aa  70.5  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0762  Cof-like hydrolase  24.18 
 
 		 277 aa  70.5  0.00000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1064  hydrolase  23.38 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0339  phosphatase  25.74 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0257026  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1392  Cof-like hydrolase  27.47 
 
 		 267 aa  69.7  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000626489  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  21.97 
 
 		 269 aa  69.7  0.00000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0108  HAD family hydrolase  26.89 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126849  normal  0.569654 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1419  Cof-like hydrolase  27.47 
 
 		 267 aa  69.7  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00926207  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>