286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0319 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0319  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 
100 aa  201  2e-51  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2187  preprotein translocase, YajC subunit  36.36 
 
 
111 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.548502  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0534  preprotein translocase, YajC subunit  40.2 
 
 
123 aa  83.2  0.000000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  47.73 
 
 
106 aa  82  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2490  preprotein translocase, YajC subunit  36.47 
 
 
111 aa  80.5  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.284595 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1008  preprotein translocase, YajC subunit  42.53 
 
 
125 aa  80.1  0.000000000000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.868301  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1770  preprotein translocase subunit, YajC  38.54 
 
 
133 aa  80.1  0.000000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.131308  decreased coverage  0.00406868 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2618  preprotein translocase, YajC subunit  46.15 
 
 
106 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  41.49 
 
 
106 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1798  preprotein translocase, YajC subunit  38.54 
 
 
133 aa  77.8  0.00000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225845  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2777  preprotein translocase, YajC subunit  37.5 
 
 
144 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.209285  normal  0.314245 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2010  preprotein translocase, YajC subunit  46.25 
 
 
107 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798178  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1173  preprotein translocase, YajC subunit  36.36 
 
 
110 aa  76.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441411  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4407  protein translocase subunit yajC  36.78 
 
 
118 aa  76.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.201974 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1799  preprotein translocase, YajC subunit  44.16 
 
 
107 aa  76.3  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.675653  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  38.27 
 
 
94 aa  75.5  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1622  preprotein translocase, YajC subunit  44.83 
 
 
91 aa  75.5  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  47.44 
 
 
105 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2778  preprotein translocase, YajC subunit  36.14 
 
 
146 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414643  normal  0.627651 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  37.23 
 
 
107 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1274  preprotein translocase, YajC subunit  49.38 
 
 
95 aa  74.7  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  47.44 
 
 
106 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  37.23 
 
 
107 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  37.23 
 
 
107 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  37.23 
 
 
107 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  37.23 
 
 
107 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  37.23 
 
 
107 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  37.23 
 
 
107 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  41.3 
 
 
109 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0727  preprotein translocase subunit YajC  41.67 
 
 
93 aa  73.9  0.0000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0798345  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12280  preprotein translocase, YajC subunit  46.75 
 
 
91 aa  73.6  0.0000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107658  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3173  preprotein translocase, YajC subunit  36.14 
 
 
146 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.407254  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  37.08 
 
 
143 aa  72.8  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2733  preprotein translocase, YajC subunit  34.94 
 
 
142 aa  72.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2891  preprotein translocase subunit YajC  39.53 
 
 
110 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0845715  hitchhiker  0.000439753 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  41.67 
 
 
108 aa  73.2  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  42.5 
 
 
143 aa  72.4  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0157  hypothetical protein  39.36 
 
 
118 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2055  preprotein translocase, YajC subunit  41.38 
 
 
102 aa  72  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.34976  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2458  protein translocase subunit yajC  42.22 
 
 
117 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107187  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2298  preprotein translocase, YajC subunit  43.02 
 
 
118 aa  71.2  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000341875  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0108  hypothetical protein  39.33 
 
 
118 aa  71.2  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2337  preprotein translocase, YajC subunit  34.34 
 
 
113 aa  71.2  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.539902  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0886  preprotein translocase, YajC subunit  34.95 
 
 
113 aa  71.2  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0890  preprotein translocase, YajC subunit  34.34 
 
 
113 aa  70.9  0.000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  38.54 
 
 
103 aa  70.9  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0455  preprotein translocase, YajC subunit  39.24 
 
 
109 aa  70.9  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.0413698 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1471  preprotein translocase subunit YajC  40 
 
 
110 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000169079  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  40.86 
 
 
109 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  38.55 
 
 
108 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  40.86 
 
 
120 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4645  protein translocase subunit yajC  40.96 
 
 
91 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4229  preprotein translocase, YajC subunit  29.29 
 
 
110 aa  68.6  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2112  preprotein translocase, YajC subunit  40.74 
 
 
117 aa  68.9  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000210725  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4599  preprotein translocase, YajC subunit  29.29 
 
 
110 aa  68.6  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0858963  normal  0.19415 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0443  preprotein translocase, YajC subunit  39.24 
 
 
108 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0153138  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0070  preprotein translocase subunit YajC  41.46 
 
 
90 aa  68.6  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1797  protein translocase subunit yajC  39.24 
 
 
108 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188227  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1332  preprotein translocase, YajC subunit  37.08 
 
 
111 aa  68.9  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0235382  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1083  protein translocase subunit yajC  35.8 
 
 
93 aa  68.9  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.452709  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0219  preprotein translocase, YajC subunit  42.5 
 
 
118 aa  68.9  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.780199  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1402  preprotein translocase subunit YajC  40.54 
 
 
91 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000229037  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2336  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 
91 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000343241  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1383  preprotein translocase subunit YajC  38.75 
 
 
110 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000313492  hitchhiker  0.00000720992 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1448  protein translocase subunit yajC  38.75 
 
 
91 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000194286  hitchhiker  0.00984378 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1436  protein translocase subunit yajC  38.75 
 
 
91 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000109142  hitchhiker  0.000636763 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  38.55 
 
 
108 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  38.55 
 
 
108 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1218  preprotein translocase, YajC subunit  46.25 
 
 
109 aa  68.6  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000169115  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  38.55 
 
 
108 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  38.55 
 
 
108 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  38.55 
 
 
108 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  38.55 
 
 
108 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  38.55 
 
 
108 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1237  preprotein translocase subunit YajC  39.77 
 
 
90 aa  67.8  0.00000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.371648  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3112  preprotein translocase subunit YajC  38.75 
 
 
110 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1860  preprotein translocase subunit  36.71 
 
 
105 aa  68.2  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529455  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1112  preprotein translocase subunit YajC  39.77 
 
 
90 aa  67.8  0.00000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.217114  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2058  preprotein translocase, YajC subunit  40.26 
 
 
111 aa  67.8  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.674684  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1000  preprotein translocase, YajC subunit  34.12 
 
 
111 aa  68.2  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.492649  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1716  preprotein translocase, YajC subunit  40.26 
 
 
111 aa  67.8  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.741067 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2348  preprotein translocase, YajC subunit  38.37 
 
 
118 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1757  preprotein translocase subunit YajC  38.75 
 
 
110 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000115206  hitchhiker  0.00353276 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0477  preprotein translocase subunit YajC  36.9 
 
 
90 aa  67.4  0.00000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0839  preprotein translocase, YajC subunit  39.08 
 
 
111 aa  67.4  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4308  preprotein translocase, YajC subunit  37.65 
 
 
115 aa  67  0.00000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2078  protein translocase subunit yajC  45.21 
 
 
106 aa  67  0.00000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.459618  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1900  protein translocase subunit yajC  40.24 
 
 
113 aa  67  0.00000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.743684  normal  0.257956 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2806  preprotein translocase subunit YajC  37.84 
 
 
110 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000242137  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2881  preprotein translocase subunit YajC  37.84 
 
 
110 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000118136  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2483  preprotein translocase subunit YajC  39.19 
 
 
110 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000329003  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1571  preprotein translocase subunit YajC  37.84 
 
 
110 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000298712  hitchhiker  0.0000000623922 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2786  preprotein translocase subunit YajC  37.84 
 
 
110 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000416487  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1715  preprotein translocase, YajC subunit  39.74 
 
 
178 aa  66.6  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0629  preprotein translocase subunit YajC  38.64 
 
 
90 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  38.46 
 
 
110 aa  66.6  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1817  protein translocase subunit yajC  42.5 
 
 
119 aa  65.5  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0910437  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2945  preprotein translocase subunit YajC  40 
 
 
108 aa  65.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1790  preprotein translocase, YajC subunit  38.38 
 
 
108 aa  65.1  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1507  preprotein translocase, YajC subunit  42.5 
 
 
108 aa  65.1  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>