More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0467 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0467  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
383 aa  795    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.103489  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2700  arylsulfatase regulator  67.11 
 
 
380 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00619293  normal  0.114693 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2090  Radical SAM domain protein  67.19 
 
 
387 aa  556  1e-157  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0893  radical SAM domain-containing protein  66.15 
 
 
385 aa  556  1e-157  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.22841  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0580  radical SAM domain-containing protein  64.18 
 
 
389 aa  538  9.999999999999999e-153  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.185035  normal  0.0438607 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1560  radical SAM family protein  62.34 
 
 
388 aa  527  1e-148  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101502  normal  0.842747 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1525  protein tyrosine phosphatase  58.42 
 
 
381 aa  486  1e-136  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.469946  normal  0.164235 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  49.3 
 
 
800 aa  353  2e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0616  anaerobic sulfatase-maturase  25.77 
 
 
370 aa  134  3e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.512735  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1008  Radical SAM domain protein  25.69 
 
 
370 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0912  Radical SAM domain protein  25.76 
 
 
367 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0100915  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1084  Radical SAM domain protein  26.39 
 
 
444 aa  124  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.316514  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4206  radical SAM domain-containing protein  27.7 
 
 
411 aa  124  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000150338  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4019  arylsulfatase-activating protein AslB  27.44 
 
 
411 aa  122  8e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000197695  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4179  Radical SAM domain protein  27.7 
 
 
411 aa  122  9e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000042782  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  26.36 
 
 
438 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5236  arylsulfatase-activating protein AslB  27.7 
 
 
411 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000331519  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0376  Radical SAM domain protein  25.2 
 
 
368 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03675  predicted regulator of arylsulfatase activity  27.44 
 
 
411 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00136934  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1532  Radical SAM domain protein  23.28 
 
 
405 aa  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.171129  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1687  radical SAM domain-containing protein  24.93 
 
 
385 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000310  arylsulfatase regulator  24.74 
 
 
433 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2110  radical SAM domain protein  24.66 
 
 
385 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73629  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4314  arylsulfatase-activating protein AslB  27.18 
 
 
411 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000133586  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03624  hypothetical protein  27.44 
 
 
411 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00100971  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01455  hypothetical protein  24.66 
 
 
385 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2149  Radical SAM domain protein  24.66 
 
 
385 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.967723  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01468  hypothetical protein  24.66 
 
 
385 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1676  radical SAM domain-containing protein  25.41 
 
 
385 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1582  radical SAM domain-containing protein  24.66 
 
 
385 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28073  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2160  radical SAM domain-containing protein  24.66 
 
 
385 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1479  Radical SAM domain protein  25.85 
 
 
414 aa  116  6e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4246  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  22.34 
 
 
431 aa  116  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.598382  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4165  arylsulfatase-activating protein AslB  26.82 
 
 
411 aa  116  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000104917  normal  0.969874 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3234  radical SAM domain-containing protein  27.35 
 
 
397 aa  116  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4120  arylsulfatase-activating protein AslB  26.91 
 
 
411 aa  116  7.999999999999999e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000574144  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4293  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  22.08 
 
 
431 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4174  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  22.08 
 
 
447 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4353  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  22.08 
 
 
431 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4197  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  22.92 
 
 
431 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2073  radical SAM domain-containing protein  22.19 
 
 
410 aa  113  6e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0151054  normal  0.88541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1902  radical SAM domain-containing protein  22.19 
 
 
410 aa  113  6e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3149  putative sulfatase regulator  26.02 
 
 
391 aa  112  9e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.997665  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1264  putative sulfatase regulator  26.02 
 
 
391 aa  112  9e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0418  radical SAM domain-containing protein  24.56 
 
 
431 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1379  radical SAM domain-containing protein  26.02 
 
 
391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3930  hypothetical protein  24.17 
 
 
414 aa  109  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.298545  normal  0.584174 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2101  Radical SAM domain protein  24.11 
 
 
369 aa  107  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0563  radical SAM domain-containing protein  24.09 
 
 
435 aa  106  6e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0602  arylsulfatase regulator, putative  27.72 
 
 
280 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3390  radical SAM domain-containing protein  23.83 
 
 
435 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.106597 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3365  arylsulfatase-activating protein AtsB  23.55 
 
 
394 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.812959 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3372  arylsulfatase-activating protein AtsB  23.82 
 
 
394 aa  103  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3298  arylsulfatase-activating protein AtsB  23.46 
 
 
394 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3987  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  23.31 
 
 
383 aa  100  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2157  radical SAM domain-containing protein  23.76 
 
 
402 aa  100  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3467  arylsulfatase-activating protein AtsB  23.82 
 
 
394 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.904338  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1414  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.16 
 
 
398 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.634455  normal  0.453788 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1398  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.16 
 
 
398 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00310802 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3560  radical SAM domain-containing protein  23.58 
 
 
435 aa  100  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.291344 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1888  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.16 
 
 
398 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.422634  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2069  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.16 
 
 
398 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000256382 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1381  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.16 
 
 
398 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.238344 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1507  radical SAM domain-containing protein  22.79 
 
 
381 aa  98.6  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.385023 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3282  Radical SAM domain protein  24.04 
 
 
393 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1732  radical SAM domain-containing protein  21.8 
 
 
393 aa  94.4  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0603581  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6683  Radical SAM domain protein  21.85 
 
 
428 aa  93.2  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.630813  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  27.17 
 
 
460 aa  92.8  9e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0763  Radical SAM domain protein  21.83 
 
 
407 aa  90.1  5e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1683  radical SAM family protein  26.12 
 
 
460 aa  90.1  5e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24704  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2595  Radical SAM domain protein  22.97 
 
 
397 aa  90.1  6e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0848982 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0417  radical SAM family protein  26.37 
 
 
457 aa  89.4  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0932  putative sulfatase regulator  23.26 
 
 
408 aa  89  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3367  putative sulfatase regulator  23.26 
 
 
408 aa  89.4  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.917343 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0985  radical SAM domain-containing protein  23.26 
 
 
408 aa  89  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0039  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.85 
 
 
398 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0045  Radical SAM domain protein  20.12 
 
 
374 aa  88.2  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.120726  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2438  Radical SAM domain protein  24.57 
 
 
447 aa  85.9  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0041  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  21.21 
 
 
395 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0039  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  21.21 
 
 
396 aa  84.3  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.499783  hitchhiker  0.00726967 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0040  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  21.21 
 
 
395 aa  84.3  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.295568 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1364  radical SAM domain-containing protein  23.46 
 
 
460 aa  84  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.458082  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  27.32 
 
 
434 aa  83.2  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0041  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  20.94 
 
 
396 aa  82.8  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0795005 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3642  Radical SAM domain protein  22.94 
 
 
402 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003598  arylsulfatase regulator  19.9 
 
 
440 aa  82  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.527576  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3638  Radical SAM domain protein  22.94 
 
 
403 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.775121  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  25.6 
 
 
394 aa  81.3  0.00000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  24.78 
 
 
377 aa  81.3  0.00000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2137  Radical SAM domain protein  25.44 
 
 
401 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344759  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  26.11 
 
 
458 aa  80.5  0.00000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2456  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 
470 aa  80.1  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  24.22 
 
 
450 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  25.29 
 
 
452 aa  79.7  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  25.34 
 
 
473 aa  79.3  0.00000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0575  Radical SAM domain protein  26.13 
 
 
434 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  24.18 
 
 
389 aa  78.6  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1494  Radical SAM domain protein  28.18 
 
 
397 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28204  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2181  radical SAM domain-containing protein  24.48 
 
 
491 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.161056  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1467  Radical SAM domain protein  28.18 
 
 
397 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>