More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1987 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_1987  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 
214 aa  434  1e-121  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1144  alcohol dehydrogenase  67.32 
 
 
333 aa  275  5e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.257229  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1400  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  61.46 
 
 
346 aa  246  2e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2398  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  56.93 
 
 
333 aa  243  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.732037  normal  0.947201 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2975  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  59.42 
 
 
339 aa  235  3e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2347  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  61.46 
 
 
343 aa  231  9e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1375  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  60.2 
 
 
334 aa  230  1e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3746  alcohol dehydrogenase  61.46 
 
 
343 aa  229  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5216  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  53.43 
 
 
335 aa  219  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132977 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02580  zinc-containing alcohol dehydrogenase family protein  57.21 
 
 
333 aa  219  3e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.338069  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2391  zinc-binding alcohol dehydrogenase  53.23 
 
 
333 aa  214  5.9999999999999996e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1449  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  51.96 
 
 
333 aa  209  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1475  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  51.96 
 
 
333 aa  209  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2208  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  52.45 
 
 
338 aa  206  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000773394 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3956  zinc-containing alcohol dehydrogenase family protein  54.23 
 
 
334 aa  205  4e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.762904 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4834  hypothetical protein  53.96 
 
 
339 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809336  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4871  hypothetical protein  53.96 
 
 
339 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0380128 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4890  hypothetical protein  53.96 
 
 
339 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.436401  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4771  hypothetical protein  53.96 
 
 
339 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.243247  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04135  predicted alcohol dehydrogenase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  54.46 
 
 
339 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3728  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  54.46 
 
 
339 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3748  alcohol dehydrogenase  54.46 
 
 
339 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0358178  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4741  hypothetical protein  53.96 
 
 
339 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0435984 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04099  hypothetical protein  54.46 
 
 
339 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4750  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  54.46 
 
 
339 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5786  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  53.96 
 
 
339 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00778522  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4837  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  53.96 
 
 
339 aa  196  3e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000190992  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4525  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  54.46 
 
 
339 aa  196  3e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0564298  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3652  alcohol dehydrogenase  53.96 
 
 
339 aa  195  4.0000000000000005e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.158229 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4816  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  53.47 
 
 
339 aa  194  1e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.140966  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1292  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  53.47 
 
 
339 aa  191  9e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2982  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  52.97 
 
 
339 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2974  alcohol dehydrogenase  40.69 
 
 
350 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3605  alcohol dehydrogenase  38.16 
 
 
348 aa  167  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2756  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.65 
 
 
348 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.706145 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0765  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.12 
 
 
354 aa  160  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442865  normal  0.472906 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2575  alcohol dehydrogenase  37.2 
 
 
347 aa  158  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal  0.37434 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3275  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.39 
 
 
346 aa  156  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2499  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.3 
 
 
348 aa  156  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0546184  normal  0.455818 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0255  alcohol dehydrogenase  38.92 
 
 
347 aa  154  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2121  alcohol dehydrogenase  42.51 
 
 
359 aa  154  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5962  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0114  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.49 
 
 
348 aa  152  2.9999999999999998e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.537568  normal  0.0906479 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0345  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.95 
 
 
347 aa  150  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253238  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3208  alcohol dehydrogenase  43.14 
 
 
352 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3348  NADP-dependent alcohol dehydrogenase  35.27 
 
 
348 aa  150  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.596659  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2709  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  38.16 
 
 
348 aa  149  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.95991 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6441  alcohol dehydrogenase  36.67 
 
 
343 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1689  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.81 
 
 
349 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.458756  normal  0.196927 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6148  alcohol dehydrogenase  36.67 
 
 
343 aa  146  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3293  alcohol dehydrogenase  37.86 
 
 
352 aa  145  4.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.566343  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4586  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.78 
 
 
347 aa  144  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0208069  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1817  alcohol dehydrogenase  37.44 
 
 
350 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.304058  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1836  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  37.44 
 
 
350 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1883  alcohol dehydrogenase  37.44 
 
 
350 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3048  alcohol dehydrogenase  36.23 
 
 
348 aa  143  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0632  putative NADP-dependent alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  39.13 
 
 
352 aa  142  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.2 
 
 
347 aa  142  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.050298 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5027  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.54 
 
 
344 aa  141  7e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1694  alcohol dehydrogenase  34.78 
 
 
348 aa  141  8e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5515  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.54 
 
 
353 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146746  normal  0.174034 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19290  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  37.07 
 
 
348 aa  140  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112396  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4279  alcohol dehydrogenase  35.47 
 
 
348 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.371426  normal  0.362219 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2715  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.32 
 
 
351 aa  140  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0771  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.5 
 
 
353 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000114333 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4120  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  39.81 
 
 
350 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113493  normal  0.906294 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2018  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.48 
 
 
348 aa  139  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3166  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.12 
 
 
352 aa  139  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0836  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.19 
 
 
351 aa  139  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2666  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.58 
 
 
347 aa  139  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.435861  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3848  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.56 
 
 
350 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.12634  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3357  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.14 
 
 
352 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2965  putative alcohol dehydrogenase  43.2 
 
 
353 aa  138  7e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.182482  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3125  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  39.02 
 
 
352 aa  137  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3359  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.54 
 
 
330 aa  137  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0964587  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6150  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.83 
 
 
351 aa  137  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2182  oxidoreductase, zinc-binding protein  39.32 
 
 
350 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.312998  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13061  NADP-dependent alcohol dehydrogenase adhC  35.12 
 
 
346 aa  136  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0701661 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4802  alcohol dehydrogenase  41.92 
 
 
349 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3207  alcohol dehydrogenase  39.72 
 
 
384 aa  135  5e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35150  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  42.72 
 
 
353 aa  135  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30246  predicted protein  37.93 
 
 
358 aa  135  6.0000000000000005e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1992  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  38.83 
 
 
350 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0872348  normal  0.100769 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0772  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.22 
 
 
351 aa  134  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2080  alcohol dehydrogenase  34.48 
 
 
348 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.266825  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10033  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  38.54 
 
 
349 aa  133  1.9999999999999998e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.763939  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1946  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.67 
 
 
351 aa  133  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.101054  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0478  NADP-alcohol dehydrogenase  37.62 
 
 
352 aa  133  3e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3283  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.93 
 
 
352 aa  131  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8883  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.07 
 
 
346 aa  130  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3964  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.95 
 
 
348 aa  130  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.454784  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0400  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.76 
 
 
352 aa  129  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.654367 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0418  alcohol dehydrogenase  36.67 
 
 
352 aa  129  3e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.820032  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3071  alcohol dehydrogenase  38.83 
 
 
350 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.989548  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_41988  predicted protein  40.69 
 
 
408 aa  128  5.0000000000000004e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.491145  normal  0.172268 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1375  alcohol dehydrogenase  34.3 
 
 
342 aa  128  6e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1631  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.25 
 
 
335 aa  128  7.000000000000001e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205329  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3742  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.33 
 
 
349 aa  128  7.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0633  alcohol dehydrogenase  42.11 
 
 
349 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.731757  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2741  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.93 
 
 
390 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0360  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.27 
 
 
347 aa  127  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.912483  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>