55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1415 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1415  thiamine biosynthesis protein ThiS  100 
 
 		 65 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  64.62 
 
 		 65 aa  87  8e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.153528  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6223  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.69 
 
 		 65 aa  72.8  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392752  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0216  thiamine biosynthesis protein ThiS  52.31 
 
 		 65 aa  71.2  0.000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3651  thiamine biosynthesis protein ThiS  56.92 
 
 		 64 aa  70.5  0.000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2465  ThiS, thiamine-biosynthesis  47.69 
 
 		 65 aa  70.1  0.000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.637315  normal  0.928732 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2892  thiamine biosynthesis protein ThiS  50.77 
 
 		 65 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.502448  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  50.77 
 
 		 65 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433282  normal  0.219669 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0207  thiamine biosynthesis protein ThiS  52.31 
 
 		 65 aa  68.9  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.549071  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5919  sulfur carrier protein ThiS  47.69 
 
 		 65 aa  64.7  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168418  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2563  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.69 
 
 		 65 aa  63.9  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.183271  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4093  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.08 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467775  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0010  thiamine biosynthesis protein ThiS  50.77 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.209764 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1957  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.9 
 
 		 63 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4172  sulfur carrier protein ThiS  43.08 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.455905 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3429  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.26 
 
 		 63 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0040  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.54 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0913  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.15 
 
 		 64 aa  54.7  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.133934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6397  sulfur carrier protein ThiS  40 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0444  sulfur carrier protein ThiS  44.62 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0146  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 69 aa  52  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0283  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.69 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2098  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.03 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.219145  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0615  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.86 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.920589  normal  0.197497 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0021  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 69 aa  47.4  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.71048  normal  0.598538 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5331  sulfur carrier protein ThiS  40.91 
 
 		 71 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.883696  normal  0.241111 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7517  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.71 
 
 		 70 aa  47  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12799  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6770  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.71 
 
 		 70 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1455  hypothetical protein  37.88 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.282408  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0433  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0479  sulfur carrier protein ThiS  40.91 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738565  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4741  sulfur carrier protein ThiS  40.91 
 
 		 66 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.243463 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04970  sulfur carrier protein ThiS  40.91 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0709  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 		 65 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.367637  normal  0.0347852 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02970  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0204  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.98 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0360  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.18682  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0589  hypothetical protein  36.92 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.519327  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1459  hypothetical protein  28.79 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4168  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0988  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0800067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0798  putative ThiS sulfur transfer protein  37.04 
 
 		 58 aa  42.7  0.002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5155  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404683  normal  0.862246 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0578  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.85 
 
 		 70 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0788  sulfur carrier protein ThiS  34.33 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450844  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3504  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169395  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0666  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4978  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5105  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.205609  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0252  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.71 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3147  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  40.4  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.054012  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1317  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  40.4  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1524  hypothetical protein  30.3 
 
 		 67 aa  40  0.01  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3658  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.38 
 
 		 67 aa  40  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1153  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.7 
 
 		 68 aa  40  0.01  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>