More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0731 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0731  cytochrome P450  100 
 
 		 453 aa  919    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.147171 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6996  cytochrome P450 family protein  37.33 
 
 		 482 aa  268  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633728 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3072  cytochrome P450  37.28 
 
 		 437 aa  253  3e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.341667  normal  0.412442 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2694  cytochrome P450  37.64 
 
 		 452 aa  251  2e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139584  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0451  cytochrome P450  35.63 
 
 		 454 aa  250  4e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.360422  normal  0.928248 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4102  cytochrome P450  37.02 
 
 		 452 aa  249  6e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117897  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0777  cytochrome P450  36.4 
 
 		 466 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2227  cytochrome P450  35.32 
 
 		 454 aa  238  2e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5257  cytochrome P450  33.86 
 
 		 446 aa  237  3e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1475  cytochrome P450 family protein  33.56 
 
 		 1373 aa  237  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2088  cytochrome P450-related protein  33.56 
 
 		 1373 aa  236  7e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2379  cytochrome P450-related protein  33.56 
 
 		 1373 aa  236  7e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.276948  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2347  cytochrome P450-related protein  33.48 
 
 		 1380 aa  236  7e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2324  cytochrome P450  35.17 
 
 		 444 aa  236  7e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950685  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1394  cytochrome P450-related protein  33.56 
 
 		 1373 aa  236  7e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1115  cytochrome P450-related protein  33.56 
 
 		 1373 aa  236  8e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3146  cytochrome P450 family protein  33.03 
 
 		 1373 aa  236  9e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0326  cytochrome P450  33.33 
 
 		 441 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.301346  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3260  cytochrome P450 family protein  32.81 
 
 		 1373 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1952  cytochrome P450  33.04 
 
 		 1365 aa  231  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0554  cytochrome P450  34.57 
 
 		 452 aa  227  3e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6371  cytochrome P450  34.78 
 
 		 455 aa  227  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407318  normal  0.219064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5081  cytochrome P450  33.41 
 
 		 447 aa  226  8e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1255  cytochrome P450  37.1 
 
 		 445 aa  224  3e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4522  cytochrome P450  34.48 
 
 		 462 aa  223  4e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2891  cytochrome P450  34 
 
 		 457 aa  223  7e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00974198  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3045  cytochrome P450  33.75 
 
 		 460 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.192678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3012  cytochrome P450  31.5 
 
 		 459 aa  222  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.278209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4177  cytochrome P450  32.52 
 
 		 459 aa  219  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00497532  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4599  cytochrome P450  33.63 
 
 		 445 aa  216  7e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4464  cytochrome P450  35.36 
 
 		 489 aa  213  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1094  cytochrome P450  34.91 
 
 		 464 aa  212  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00217839 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2272  cytochrome P450  36.09 
 
 		 453 aa  212  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1926  cytochrome P450  36.26 
 
 		 465 aa  211  3e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0696  cytochrome P450  36.61 
 
 		 470 aa  210  4e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129999  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0833  cytochrome P450  33.18 
 
 		 480 aa  209  6e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.116769 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0116  cytochrome P450  31.75 
 
 		 462 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0812  cytochrome P450  31.1 
 
 		 447 aa  208  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2663  cytochrome P450  31.92 
 
 		 466 aa  206  8e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0425  cytochrome P450  32.07 
 
 		 461 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2167  cytochrome P450  32.23 
 
 		 448 aa  204  2e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2890  cytochrome P450  31.7 
 
 		 466 aa  204  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357507  normal  0.363908 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1270  cytochrome P450  36.56 
 
 		 459 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1432  cytochrome P450  36.01 
 
 		 459 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1417  cytochrome P450  32.21 
 
 		 439 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2785  cytochrome P450  33.58 
 
 		 467 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.438082 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1303  cytochrome P450  31.3 
 
 		 432 aa  200  5e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0276  putative cytochrome P450 hydroxylase superfamily protein  34.14 
 
 		 460 aa  200  6e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0687  cytochrome P450  31.94 
 
 		 462 aa  199  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1643  cytochrome P450  29.59 
 
 		 448 aa  198  2.0000000000000003e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0465138  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2727  cytochrome P450  32.51 
 
 		 469 aa  197  4.0000000000000005e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0051  cytochrome P450  31.9 
 
 		 462 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0082  cytochrome P450  33.66 
 
 		 470 aa  195  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0005  cytochrome P450  31.51 
 
 		 433 aa  194  3e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00156979  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2585  cytochrome P450  33.5 
 
 		 459 aa  194  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3754  cytochrome P450  34.75 
 
 		 429 aa  193  6e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.782699  hitchhiker  0.00441352 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6661  cytochrome P450  34.74 
 
 		 463 aa  192  9e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.181447  decreased coverage  0.0065391 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0813  cytochrome P450  29.82 
 
 		 451 aa  191  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2602  cytochrome P450  30.16 
 
 		 445 aa  191  2e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.939146  normal  0.181261 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0140  cytochrome P450  32.03 
 
 		 464 aa  191  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1222  cytochrome P450  36.45 
 
 		 452 aa  190  4e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.310345 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3258  cytochrome P450  31.75 
 
 		 452 aa  189  9e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.502134  normal  0.462712 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4969  cytochrome P450  31.22 
 
 		 473 aa  189  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  0.174544 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1531  cytochrome P450  35.4 
 
 		 471 aa  188  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3268  cytochrome P450  32.94 
 
 		 466 aa  188  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1482  cytochrome P450  31.78 
 
 		 484 aa  188  2e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3371  cytochrome P450  35.54 
 
 		 478 aa  187  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.63756 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0609  cytochrome P450  31.03 
 
 		 468 aa  186  7e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.484343  normal  0.0324915 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1330  cytochrome P450  34.88 
 
 		 471 aa  186  9e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.514675 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3729  cytochrome P450  31.24 
 
 		 446 aa  185  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4920  cytochrome P450  30.66 
 
 		 462 aa  183  7e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0290  cytochrome P450  28.5 
 
 		 431 aa  182  1e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4212  cytochrome P450  36.75 
 
 		 473 aa  181  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.610601 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3190  cytochrome P450 CYP262A1  28.67 
 
 		 461 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.298137  normal  0.521722 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4009  cytochrome P450  30.39 
 
 		 462 aa  179  5.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0741551  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1807  cytochrome P450  29.44 
 
 		 458 aa  177  3e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0665551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30690  predicted protein  32.05 
 
 		 546 aa  176  9.999999999999999e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.221462 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1410  cytochrome P450 family protein  28.1 
 
 		 453 aa  175  1.9999999999999998e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.534609  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1455  cytochrome P450  28.97 
 
 		 452 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.756102  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1744  cytochrome P450 family protein  27.87 
 
 		 453 aa  174  3.9999999999999995e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1598  cytochrome P450 family protein  27.74 
 
 		 453 aa  173  5.999999999999999e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.451985  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3529  cytochrome P450  31.15 
 
 		 479 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5157  cytochrome P450  33.05 
 
 		 474 aa  171  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0481875  hitchhiker  0.00610054 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0744  cytochrome P450  29.79 
 
 		 452 aa  171  3e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.491653  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3985  cytochrome P450  28.92 
 
 		 466 aa  170  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6754  cytochrome P450  35.17 
 
 		 463 aa  170  6e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.139362  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4313  cytochrome P450  27.67 
 
 		 470 aa  169  9e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5133  cytochrome P450  30.72 
 
 		 457 aa  168  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.266361  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0514  cytochrome P450  32.94 
 
 		 463 aa  168  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.234733 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3807  cytochrome P450  29.43 
 
 		 460 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11423  cytochrome P450 132 cyp132  29.52 
 
 		 461 aa  163  7e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000352831  normal  0.140869 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0846  cytochrome P450  30.75 
 
 		 479 aa  162  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.734293 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0823  cytochrome P450  31.31 
 
 		 450 aa  160  3e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.141729 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5060  cytochrome P450  29.9 
 
 		 455 aa  158  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1286  cytochrome P450  29.22 
 
 		 448 aa  158  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.316909  normal  0.0131922 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1972  cytochrome P450  27.37 
 
 		 525 aa  157  4e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0056  cytochrome P450  28.32 
 
 		 453 aa  157  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0286  cytochrome P450  30.41 
 
 		 452 aa  156  8e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2337  putative cytochrome P450  28.6 
 
 		 458 aa  153  5e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.338094 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6421  cytochrome P450  29.57 
 
 		 1055 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.018533 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>