19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1503 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1503  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 521 aa  1018    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0929  amino acid permease-associated region  59.77 
 
 		 515 aa  603  1.0000000000000001e-171  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0109  amino acid transporter, putative  57.23 
 
 		 512 aa  588  1e-167  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1269  amino acid permease-associated region  47.28 
 
 		 501 aa  456  1e-127  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0358  amino acid permease-associated region  44.77 
 
 		 499 aa  402  1e-111  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.762419  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0817  amino acid permease-associated region  44.02 
 
 		 506 aa  370  1e-101  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0017  hypothetical protein  33.46 
 
 		 508 aa  258  2e-67  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0205  amino acid transporter, putative  34.07 
 
 		 500 aa  253  4.0000000000000004e-66  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1708  amino acid permease-associated region  28.96 
 
 		 522 aa  173  5.999999999999999e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0873  hypothetical protein  26.41 
 
 		 528 aa  105  2e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.237291 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0189  hypothetical protein  25.99 
 
 		 504 aa  99.4  1e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.106496  normal  0.619029 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0540  amino acid permease-associated region  24.16 
 
 		 519 aa  94.4  4e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0391  amino acid transporter-like protein  25.13 
 
 		 529 aa  90.9  5e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.445572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0129  amino acid permease-associated region  22.57 
 
 		 546 aa  80.1  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0834  amino acid permease-associated region  24.64 
 
 		 544 aa  67.8  0.0000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1121  amino acid permease-associated region  24.07 
 
 		 490 aa  60.1  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0304101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4340  hypothetical protein  34.74 
 
 		 148 aa  57  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0513206  decreased coverage  0.000823038 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0773  amino acid permease-associated region  24.57 
 
 		 534 aa  54.7  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.23887  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0992  hypothetical protein  34.34 
 
 		 535 aa  52.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>