More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0336 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0336  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
239 aa  481  1e-135  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0341  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.68 
 
 
246 aa  282  3.0000000000000004e-75  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.85 
 
 
260 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1036  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.6 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1545  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.8 
 
 
258 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1430  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  39.66 
 
 
255 aa  112  4.0000000000000004e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.14 
 
 
262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108232  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0717  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.34 
 
 
258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00240  enoyl-CoA hydratase, putative  33.18 
 
 
283 aa  108  6e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0589051  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1666  short chain enoyl-CoA hydratase  34.92 
 
 
260 aa  108  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  34.88 
 
 
257 aa  107  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0266  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 
265 aa  107  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0235599 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2191  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.52 
 
 
260 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.572895  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.52 
 
 
260 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2195  short chain enoyl-CoA hydratase  32.23 
 
 
257 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000647858  hitchhiker  0.00875803 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0566  methylglutaconyl-CoA hydratase  30.04 
 
 
254 aa  107  2e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.42 
 
 
259 aa  106  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2252  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.82 
 
 
255 aa  105  7e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.832894  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17850  enoyl-CoA hydratase  32 
 
 
265 aa  105  7e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1480  enoyl-CoA hydratase-isomerase  34.82 
 
 
255 aa  105  7e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1578  enoyl-CoA hydratase-isomerase  34.82 
 
 
255 aa  105  7e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0224  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.39 
 
 
254 aa  105  8e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287006  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3101  enoyl-CoA hydratase-isomerase  35.27 
 
 
275 aa  104  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.429404  hitchhiker  0.000105979 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4369  enoyl-CoA hydratase  33.49 
 
 
257 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0156166 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  37.04 
 
 
260 aa  104  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0597  short chain enoyl-CoA hydratase  34.85 
 
 
262 aa  103  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00392493  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2262  enoyl-CoA hydratase-isomerase  35.56 
 
 
255 aa  103  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364403  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35.75 
 
 
260 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2029  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.8 
 
 
269 aa  102  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  38.25 
 
 
261 aa  102  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2475  enoyl-CoA hydratase-isomerase  36.49 
 
 
257 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.932872 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0860  short chain enoyl-CoA hydratase  35.36 
 
 
261 aa  102  7e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  33.49 
 
 
257 aa  102  8e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  33.79 
 
 
257 aa  101  9e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2204  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.36 
 
 
263 aa  101  9e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00482519  normal  0.0288404 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  33.79 
 
 
257 aa  101  9e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3284  enoyl-CoA hydratase-isomerase  35.55 
 
 
257 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.34821  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3052  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  29.8 
 
 
246 aa  101  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.448764 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  36.76 
 
 
257 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.16 
 
 
258 aa  100  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.73 
 
 
256 aa  100  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4819  enoyl-CoA hydratase  39.78 
 
 
263 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.944357  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.6 
 
 
258 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.415627  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  32.88 
 
 
257 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4596  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
255 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115827  normal  0.9625 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.6 
 
 
259 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  30.68 
 
 
257 aa  99.8  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  32.79 
 
 
262 aa  99.4  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05916  enoyl-CoA hydratase (Eurofung)  38.33 
 
 
289 aa  99.4  5e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.295699  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3369  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.8 
 
 
262 aa  99  6e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186723  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2136  enoyl-CoA hydratase  32.71 
 
 
260 aa  99  7e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.259318  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  34.6 
 
 
257 aa  98.6  7e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.31 
 
 
259 aa  98.6  7e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0661339  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1738  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.42 
 
 
259 aa  98.6  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  34.6 
 
 
257 aa  98.6  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  32.65 
 
 
258 aa  98.6  7e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  34.6 
 
 
257 aa  98.6  7e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000379  methylglutaconyl-CoA hydratase  28.33 
 
 
260 aa  98.6  8e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1551  enoyl-CoA hydratase  28.52 
 
 
253 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2866  short chain enoyl-CoA hydratase  31.62 
 
 
257 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18512  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  30.52 
 
 
258 aa  98.2  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1034  short chain enoyl-CoA hydratase  31.13 
 
 
256 aa  98.2  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0524652  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.04 
 
 
265 aa  97.8  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.41 
 
 
259 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.52 
 
 
258 aa  98.2  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.78 
 
 
260 aa  97.8  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  32.07 
 
 
258 aa  97.4  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2591  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.73 
 
 
258 aa  97.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000604766  decreased coverage  0.0000000224287 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4199  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.98 
 
 
245 aa  97.4  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0335602  hitchhiker  0.000324097 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4172  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.23 
 
 
258 aa  97.1  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1306  short chain enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
263 aa  97.1  2e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0288681 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  30.95 
 
 
264 aa  97.4  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.4 
 
 
260 aa  96.7  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  36.11 
 
 
256 aa  96.3  3e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.209168 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.68 
 
 
258 aa  96.3  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0222  enoyl-CoA hydratase  33.01 
 
 
253 aa  96.3  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.41 
 
 
259 aa  96.3  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203643  normal  0.505075 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0122  enoyl-CoA hydratase  38.25 
 
 
264 aa  96.3  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  35.64 
 
 
259 aa  96.3  4e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  36.69 
 
 
663 aa  95.9  5e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3528  enoyl-CoA hydratase  29.52 
 
 
261 aa  95.9  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_55192  hydratase enyol-coa hydratase  33.94 
 
 
269 aa  95.9  5e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0177  enoyl-CoA hydratase  31.58 
 
 
267 aa  95.9  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1034  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.52 
 
 
249 aa  95.5  6e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.749247  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5201  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.26 
 
 
257 aa  95.5  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.492182  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.02 
 
 
260 aa  95.5  6e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3833  enoyl-CoA hydratase  30.33 
 
 
261 aa  95.5  6e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  33.15 
 
 
258 aa  95.5  6e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2905  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
256 aa  95.5  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.433912  normal  0.369863 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3005  short chain enoyl-CoA hydratase  31.7 
 
 
259 aa  95.5  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4763  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.63 
 
 
265 aa  95.1  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254643  normal  0.582812 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  33.96 
 
 
259 aa  95.1  9e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1942  methylglutaconyl-CoA hydratase  36.56 
 
 
275 aa  95.1  9e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3750  short chain enoyl-CoA hydratase  33.18 
 
 
257 aa  95.1  9e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1529  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.05 
 
 
259 aa  95.1  9e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.338476 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  29.86 
 
 
261 aa  94.7  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0461  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.14 
 
 
259 aa  94.7  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.773057  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.75 
 
 
259 aa  94.7  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1789  enoyl-CoA hydratase  36.65 
 
 
261 aa  94.7  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2014  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.02 
 
 
259 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162316  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>