142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2961 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2961  hypothetical protein  100 
 
 
122 aa  223  5.0000000000000005e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0099  membrane protein of unknown function  68.91 
 
 
117 aa  102  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0671  membrane protein of unknown function  54.17 
 
 
122 aa  87.8  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.17092 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3555  membrane protein of unknown function  40.68 
 
 
115 aa  79.3  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0169629  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2245  membrane protein of unknown function  45.13 
 
 
114 aa  78.2  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000194904  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35940  predicted membrane protein  41.41 
 
 
130 aa  78.2  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.334945  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2723  membrane protein of unknown function  39.5 
 
 
133 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.67205  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3757  membrane protein of unknown function  46.36 
 
 
117 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2917  membrane protein of unknown function  45.45 
 
 
146 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0712  membrane protein of unknown function  41.35 
 
 
115 aa  73.9  0.0000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2195  membrane protein of unknown function  47.66 
 
 
111 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000942046  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0179  hypothetical protein  44.55 
 
 
117 aa  72  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3391  membrane protein of unknown function  41.96 
 
 
117 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3407  membrane protein of unknown function  42.99 
 
 
126 aa  70.9  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2841  hypothetical protein  41.82 
 
 
117 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225789  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0056  YvlD  41.82 
 
 
117 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3416  hypothetical protein  41.82 
 
 
117 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1702  hypothetical protein  41.82 
 
 
117 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3837  hypothetical protein  41.82 
 
 
117 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.974932  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3918  hypothetical protein  41.82 
 
 
117 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3135  hypothetical protein  41.82 
 
 
117 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2280  membrane protein of unknown function  36.59 
 
 
117 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112149  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3164  hypothetical protein  40.91 
 
 
117 aa  70.1  0.000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2178  hypothetical protein  47.17 
 
 
113 aa  70.1  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.71562 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3396  membrane protein of unknown function  42.06 
 
 
126 aa  69.7  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.573144  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3678  membrane protein of unknown function  34.88 
 
 
131 aa  70.1  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4717  membrane protein of unknown function  36.07 
 
 
129 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.559466  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0214  membrane protein of unknown function  50 
 
 
116 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0611076  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0181  membrane protein of unknown function  40.18 
 
 
117 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  normal  0.0333124 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3376  hypothetical protein  40 
 
 
117 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2834  membrane protein of unknown function  40 
 
 
117 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.533371  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0187  membrane protein of unknown function  40 
 
 
117 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0273  membrane protein of unknown function  40 
 
 
117 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.896434  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0255  membrane protein of unknown function  40 
 
 
117 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0200  membrane protein of unknown function  40 
 
 
117 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4312  membrane protein of unknown function  39.13 
 
 
117 aa  67.8  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.753835  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4337  membrane protein of unknown function  35.25 
 
 
129 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00733225  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4423  membrane protein of unknown function  35.25 
 
 
129 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.512548 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4088  hypothetical protein  34.51 
 
 
117 aa  67.4  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2469  membrane protein of unknown function  37.82 
 
 
132 aa  67  0.00000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.978118  normal  0.0141689 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0487  membrane protein of unknown function  37.5 
 
 
131 aa  67  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2988  membrane protein of unknown function  39.05 
 
 
119 aa  67  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.547777  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4653  membrane protein of unknown function  42.86 
 
 
136 aa  66.2  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.330782  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2755  hypothetical protein  38.98 
 
 
123 aa  66.6  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0092  hypothetical protein  46.25 
 
 
113 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0192  membrane protein of unknown function  47.25 
 
 
115 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196121 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3172  membrane protein of unknown function  37.4 
 
 
120 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11932  hypothetical protein  39.02 
 
 
134 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4668  membrane protein of unknown function  37.61 
 
 
117 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0995  membrane protein of unknown function  37.07 
 
 
113 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2051  membrane protein of unknown function  38.6 
 
 
113 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2025  membrane protein of unknown function  38.6 
 
 
113 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1471  membrane protein of unknown function  31.9 
 
 
137 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.260705 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0469  membrane protein of unknown function  36.75 
 
 
113 aa  64.7  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1444  membrane protein of unknown function  36.04 
 
 
113 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2963  hypothetical protein  44.19 
 
 
130 aa  64.3  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000675616  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5883  membrane protein of unknown function  44.58 
 
 
121 aa  63.9  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.431554  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1851  membrane protein of unknown function  34.68 
 
 
195 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1203  membrane protein of unknown function  38.32 
 
 
112 aa  63.9  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4884  membrane protein of unknown function  37.19 
 
 
127 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2213  hypothetical protein  36.13 
 
 
129 aa  63.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.26379 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3080  hypothetical protein  41.38 
 
 
114 aa  62.4  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1137  membrane protein of unknown function  32.5 
 
 
134 aa  62.4  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.278732  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4992  membrane protein of unknown function  52.78 
 
 
138 aa  61.6  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1666  membrane protein of unknown function  38.46 
 
 
116 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.124642 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4516  membrane protein of unknown function  37.6 
 
 
135 aa  61.2  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.127179  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3322  membrane protein of unknown function  35.9 
 
 
123 aa  60.8  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.226283  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4042  membrane protein of unknown function  47.5 
 
 
139 aa  61.2  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.700012  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4030  membrane protein of unknown function  48.05 
 
 
141 aa  59.7  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0790  hypothetical protein  34.43 
 
 
125 aa  58.9  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.180583  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0596  hypothetical protein  37.19 
 
 
118 aa  58.9  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3547  membrane protein of unknown function  39.09 
 
 
146 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5482  membrane protein of unknown function  33.98 
 
 
111 aa  59.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.296215 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3822  membrane protein of unknown function  33.85 
 
 
148 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3918  membrane protein of unknown function  42.31 
 
 
117 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239558  hitchhiker  0.00320816 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0859  membrane protein of unknown function  35.78 
 
 
115 aa  58.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.195504 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5175  membrane protein of unknown function  40.38 
 
 
117 aa  57.8  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1495  hypothetical protein  38.89 
 
 
114 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.184347  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5268  hypothetical protein  29.69 
 
 
126 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5013  hypothetical protein  29.69 
 
 
126 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4842  hypothetical protein  29.69 
 
 
126 aa  55.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4857  hypothetical protein  29.69 
 
 
126 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5393  hypothetical protein  29.69 
 
 
126 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5325  hypothetical protein  29.69 
 
 
126 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5283  hypothetical protein  29.69 
 
 
126 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.309234  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0378  membrane protein of unknown function  41.53 
 
 
115 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5674  hypothetical protein  29.69 
 
 
126 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5249  hypothetical protein  29.69 
 
 
126 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3970  membrane protein of unknown function  34.13 
 
 
129 aa  55.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.401877 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1135  membrane protein of unknown function  48.48 
 
 
66 aa  55.1  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.0708618 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1110  membrane protein of unknown function  38.3 
 
 
113 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1180  membrane protein of unknown function  46.77 
 
 
138 aa  54.7  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7918  membrane protein of unknown function  40.23 
 
 
122 aa  54.7  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.535574 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0809  membrane protein of unknown function  57.38 
 
 
115 aa  54.7  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0338495  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4241  membrane protein of unknown function  39.81 
 
 
111 aa  54.3  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1341  membrane protein of unknown function  36.94 
 
 
146 aa  54.3  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3507  membrane protein of unknown function  44.05 
 
 
111 aa  53.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4675  membrane protein of unknown function  42.72 
 
 
124 aa  52  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2907  membrane protein of unknown function  37.35 
 
 
122 aa  52.4  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6954  membrane protein of unknown function  36.84 
 
 
126 aa  52  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>