187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6042 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_6042  Ion transport 2 domain-containing protein  100 
 
 		 256 aa  518  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.985257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5039  Ion transport 2 domain protein  85.04 
 
 		 256 aa  430  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.103655 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4579  Ion transport 2 domain-containing protein  85.04 
 
 		 256 aa  430  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.29628 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1249  Ion transport 2 domain protein  67.48 
 
 		 249 aa  320  9.999999999999999e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.940335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1106  Ion transport 2 domain-containing protein  65.1 
 
 		 256 aa  319  3e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.226548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3161  Ion transport 2 domain protein  61.13 
 
 		 258 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.672229  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2762  Ion transport 2  62.95 
 
 		 258 aa  300  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2765  Ion transport 2  62.65 
 
 		 258 aa  296  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909105  normal  0.293362 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2720  Ion transport protein  61.54 
 
 		 258 aa  294  8e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.56603  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1814  Ion transport 2 domain-containing protein  47.29 
 
 		 266 aa  216  2.9999999999999998e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.176499 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1178  Ion transport 2  41.06 
 
 		 267 aa  192  4e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4869  Ion transport 2 domain-containing protein  44.13 
 
 		 271 aa  191  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3759  Ion transport 2 domain-containing protein  42.8 
 
 		 265 aa  187  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145189  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1838  Ion transport 2 domain protein  43.37 
 
 		 264 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.723897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2729  putative ion transport protein  44.08 
 
 		 288 aa  166  4e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236558  normal  0.0248863 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2446  Ion transport 2 domain protein  29.44 
 
 		 269 aa  93.2  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2030  Ion transport protein  31.4 
 
 		 263 aa  92.8  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3664  Ion transport 2 domain protein  30.05 
 
 		 271 aa  92.8  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.819416 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0564  Ion transport 2 domain protein  29.64 
 
 		 276 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2780  Ion transport protein  26.72 
 
 		 284 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.715663  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1582  Ion transport 2 domain-containing protein  28.86 
 
 		 288 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1557  Ion transport protein  23.46 
 
 		 277 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1491  Ion transport protein  24.43 
 
 		 275 aa  77  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3005  potassium channel protein  31.46 
 
 		 272 aa  75.5  0.0000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318755  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1821  ion transport protein  24.16 
 
 		 279 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3292  Ion transport protein  24.44 
 
 		 290 aa  74.3  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1991  potassium channel protein  27.14 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1824  Ion transport protein  25.24 
 
 		 284 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0249663  normal  0.467552 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2766  Ion transport protein  24.63 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0676384  normal  0.308489 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2527  Ion transport protein  25.24 
 
 		 284 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3630  Ion transport protein  24.26 
 
 		 274 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.334747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2520  Ion transport protein  25.24 
 
 		 284 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2640  Ion transport protein  25.24 
 
 		 284 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.512871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2020  Ion transport protein  29.33 
 
 		 282 aa  72.8  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2209  Ion transport protein  24.14 
 
 		 289 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.427173 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3382  Ion transport protein  24.54 
 
 		 277 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0078085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2286  Ion transport protein  22.87 
 
 		 289 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.630315  normal  0.644367 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2419  Ion transport protein  24.14 
 
 		 289 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0939  VIC family potassium channel protein  27.73 
 
 		 276 aa  72  0.000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.650828  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3624  ion transport protein, putative  24.62 
 
 		 277 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3869  Ion transport protein  25.86 
 
 		 273 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.519934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1566  Ion transport protein  25.76 
 
 		 273 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0452104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03020  hypothetical protein  23.92 
 
 		 282 aa  71.6  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4304  cation transporter, voltage-gated ion channel cation transporter  27.5 
 
 		 273 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2281  Ion transport protein  23.67 
 
 		 289 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87963  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0515  ion transport protein  25.19 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1478  Ion transport protein  27.34 
 
 		 276 aa  70.5  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.870774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0709  Ion transport protein  25.86 
 
 		 295 aa  69.7  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1590  Ion transport protein  23.46 
 
 		 276 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2444  Ion transport protein  27.72 
 
 		 271 aa  68.9  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002929  possible potassium channel VIC family  22.82 
 
 		 287 aa  68.9  0.00000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000118679  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1166  Ion transport protein  24.62 
 
 		 294 aa  68.9  0.00000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1854  putative ion transport protein  23.9 
 
 		 282 aa  68.6  0.00000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.807615  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3452  Ion transport protein  23.94 
 
 		 279 aa  68.2  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.81213  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1014  Ion transport protein  26.95 
 
 		 276 aa  67.4  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000934363  hitchhiker  0.000116097 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3836  putative potassium channel  28.7 
 
 		 283 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122783  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2112  ion transport protein  22.09 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0262  Ion transport 2 domain-containing protein  31.58 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0178  VIC family potassium channel protein  27.14 
 
 		 282 aa  65.9  0.0000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09508  potassium channel protein  22.46 
 
 		 288 aa  65.5  0.0000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.993518  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0040  Ion transport protein  25.48 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1606  ion transporter  25.84 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4286  Ion transport protein  30.63 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.361083  normal  0.259623 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45070  putative potassium channel  28.24 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0600  Ion transport protein  28.05 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.90662  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2375  Ion transport protein  22.28 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2679  putative ion transport protein  24.76 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3225  Ion transport protein  24.36 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2339  Ion transport protein  23.19 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1725  Ion transport protein  21.11 
 
 		 292 aa  62  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0536813  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0132  VIC family potassium channel protein  27.5 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0238536  normal  0.0130464 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0091  Ion transport protein  23.66 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1267  Ion transport protein  25.93 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.905498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2927  Ion transport protein  25.95 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1499  Ion transport 2 domain-containing protein  27.27 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.288718  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0024  Ion transport protein  29.32 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0306194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1082  putative potassium channel protein  29.63 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0288  Ion transport protein  23.41 
 
 		 272 aa  58.9  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1660  potassium channel protein  28.19 
 
 		 277 aa  57  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.819465 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1941  Ion transport protein  27.78 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0124996 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00865  hypothetical protein  31.78 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1869  Ion transport protein  25.45 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.275809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1404  Ion transport protein  25.45 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1932  Ion transport protein  25.45 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595369  normal  0.0211569 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1586  Ion transport protein  25.45 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.580145  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2036  ion transporter  22.33 
 
 		 303 aa  55.5  0.0000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000745091 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1875  Ion transport protein  25.45 
 
 		 278 aa  55.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.354062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3053  Ion transport protein  32.38 
 
 		 288 aa  55.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2923  Ion transport protein  32 
 
 		 271 aa  54.7  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136204  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0129  Ion transport 2 domain protein  34.78 
 
 		 241 aa  54.7  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000177719  hitchhiker  0.0000693343 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0824  Ion transport 2 domain-containing protein  24.12 
 
 		 274 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.978487 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2579  hypothetical protein  28.57 
 
 		 298 aa  54.7  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.932967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0253  Ion transport protein  23.53 
 
 		 273 aa  53.5  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.614768  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1053  Ion transport protein  29.32 
 
 		 325 aa  53.1  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2640  potassium channel protein  27.69 
 
 		 277 aa  53.1  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1592  Ion transport protein  27 
 
 		 274 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0989  Ion transport 2 domain-containing protein  31.25 
 
 		 344 aa  52.8  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.369667 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  37.31 
 
 		 517 aa  52.4  0.000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3117  Ion transport 2 domain-containing protein  23.62 
 
 		 274 aa  52.4  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0962789  normal  0.861695 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0855  Ion transport 2 domain-containing protein  23.62 
 
 		 274 aa  52.4  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.289459  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>