40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4981 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4981  hypothetical protein  100 
 
 
418 aa  802    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000575205 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2598  hypothetical protein  54.79 
 
 
554 aa  226  8e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1413  hypothetical protein  52.25 
 
 
360 aa  223  4e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.328656  normal  0.0564528 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1691  hypothetical protein  52.49 
 
 
360 aa  223  4e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.10741  normal  0.517365 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1417  hypothetical protein  51.58 
 
 
360 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.237583  normal  0.104082 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2013  hypothetical protein  55.25 
 
 
555 aa  205  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6575  hypothetical protein  55.25 
 
 
555 aa  205  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576123  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7311  hypothetical protein  55.25 
 
 
555 aa  205  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1994  hypothetical protein  51.14 
 
 
544 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2767  hypothetical protein  48.42 
 
 
455 aa  200  3.9999999999999996e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4297  hypothetical protein  53.88 
 
 
555 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2123  hypothetical protein  52.75 
 
 
455 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.140853  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3078  hypothetical protein  50.45 
 
 
358 aa  192  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.183188 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3457  hypothetical protein  52.17 
 
 
611 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.801555  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1825  hypothetical protein  52.53 
 
 
608 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.949516  normal  0.422245 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1182  hypothetical protein  45.66 
 
 
640 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.964915  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1427  hypothetical protein  45.25 
 
 
476 aa  170  5e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0509  hypothetical protein  44.55 
 
 
278 aa  164  3e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0512  hypothetical protein  44.09 
 
 
278 aa  163  6e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3921  hypothetical protein  46.82 
 
 
433 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4090  hypothetical protein  46.82 
 
 
433 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.150292 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3522  hypothetical protein  40.89 
 
 
336 aa  135  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.136391  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3719  IS66 Orf2 family protein  52.73 
 
 
423 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0269  hypothetical protein  50.91 
 
 
117 aa  113  7.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3627  hypothetical protein  46.67 
 
 
246 aa  108  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0920  hypothetical protein  49.56 
 
 
238 aa  101  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0791  hypothetical protein  45.79 
 
 
232 aa  90.9  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.749366 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3172  hypothetical protein  50.89 
 
 
233 aa  85.1  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0267646 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1121  hypothetical protein  45 
 
 
243 aa  84  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.666751  normal  0.104737 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2162  hypothetical protein  41.07 
 
 
235 aa  82.4  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.683012 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1989  hypothetical protein  42.98 
 
 
150 aa  77.8  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.0000737355  normal  0.0314361 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1647  hypothetical protein  43.22 
 
 
235 aa  73.2  0.000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.816874 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0299  hypothetical protein  35.48 
 
 
443 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3837  hypothetical protein  34.17 
 
 
441 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3133  hypothetical protein  41.11 
 
 
152 aa  58.5  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0163555  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3059  hypothetical protein  38.82 
 
 
307 aa  56.2  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2886  hypothetical protein  36.27 
 
 
240 aa  51.6  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0470567  normal  0.128421 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0745  hypothetical protein  26.21 
 
 
118 aa  47.8  0.0004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0294492  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0324  hypothetical protein  26.21 
 
 
117 aa  46.2  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00000000426021  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2380  Phage-related tail fibre protein-like  43.86 
 
 
590 aa  44.3  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.335162  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>