49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3390 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3390  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  291  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.515399  normal  0.0925664 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3930  protein of unknown function DUF1332  59.6 
 
 		 158 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.232156 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3646  hypothetical protein  59.46 
 
 		 216 aa  135  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3939  protein of unknown function DUF1332  59.46 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0663  protein of unknown function DUF1332  56.85 
 
 		 160 aa  116  9e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1856  hypothetical protein  56.12 
 
 		 172 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.827405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3245  hypothetical protein  38.21 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0605  hypothetical protein  34.33 
 
 		 159 aa  67.8  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0275  hypothetical protein  33.08 
 
 		 155 aa  67.4  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0476  hypothetical protein  31.34 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1882  hypothetical protein  32.23 
 
 		 159 aa  62  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1811  hypothetical protein  32.23 
 
 		 159 aa  62  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.828251  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1709  hypothetical protein  32.81 
 
 		 147 aa  62  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0054  hypothetical protein  30.6 
 
 		 170 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2028  hypothetical protein  36.28 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0979  hypothetical protein  30.91 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.145675  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0424  protein of unknown function DUF1332  37.38 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0114  hypothetical protein  29.85 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.544151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0688  hypothetical protein  29.1 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3198  hypothetical protein  28.23 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4149  hypothetical protein  26.92 
 
 		 169 aa  53.9  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.640166  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0076  hypothetical protein  32.81 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.193644  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0318  hypothetical protein  24.16 
 
 		 152 aa  51.6  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.355873  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2294  hypothetical protein  29.46 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000519813  normal  0.553436 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0189  protein of unknown function DUF1332  23.78 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0188  hypothetical protein  23.78 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2970  hypothetical protein  27.48 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4146  hypothetical protein  23.78 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4279  hypothetical protein  23.78 
 
 		 157 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.061664 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1920  hypothetical protein  29.56 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0246  hypothetical protein  22.38 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4024  protein of unknown function DUF1332  30.36 
 
 		 161 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.37493  normal  0.960415 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3703  protein of unknown function DUF1332  29.46 
 
 		 161 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.814089  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1845  hypothetical protein  24.43 
 
 		 150 aa  46.2  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.176164  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0247  hypothetical protein  21.68 
 
 		 150 aa  45.4  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4562  hypothetical protein  22.76 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1136  hypothetical protein  28.18 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.863269  normal  0.342516 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003554  hypothetical protein  26.83 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0508881  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1484  hypothetical protein  22.94 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0056262  normal  0.976718 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3757  hypothetical protein  23.68 
 
 		 153 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3955  hypothetical protein  23.68 
 
 		 153 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0515319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2220  hypothetical protein  29.93 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1840  protein of unknown function DUF1332  35.19 
 
 		 172 aa  43.5  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0425637 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0994  hypothetical protein  31.93 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2014  hypothetical protein  32.76 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0188674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0892  Dna-J like membrane chaperone protein  29.58 
 
 		 257 aa  42.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.448212  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3454  hypothetical protein  23.97 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3830  hypothetical protein  22.76 
 
 		 153 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0370  hypothetical protein  29.46 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>