97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0683 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0683  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  100 
 
 
258 aa  502  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.440789 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5101  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  60.16 
 
 
267 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1675  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  36.48 
 
 
253 aa  124  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1609  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  35.59 
 
 
254 aa  93.2  4e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0262553  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12080  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  29.85 
 
 
241 aa  87.4  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024847  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2212  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  35.53 
 
 
233 aa  85.5  7e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.576042  normal  0.0812259 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0382  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  30.41 
 
 
242 aa  84.7  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00459549  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2284  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  36.06 
 
 
326 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0915  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  28 
 
 
241 aa  83.6  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0114255  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3951  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  30.63 
 
 
331 aa  79  0.00000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0893  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  31.52 
 
 
241 aa  79  0.00000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.272819  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0935  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  28.16 
 
 
254 aa  71.2  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0873  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  29.8 
 
 
253 aa  69.7  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000846498 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1783  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  30.05 
 
 
253 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3449  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  30.87 
 
 
172 aa  64.7  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.339859  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5155  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  30.82 
 
 
172 aa  63.9  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.982935  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1044  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  30.12 
 
 
253 aa  63.5  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0676  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30 
 
 
958 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.685359  normal  0.485202 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3282  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  29.96 
 
 
345 aa  63.2  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000131968  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3857  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.67 
 
 
958 aa  62.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0953  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  28.39 
 
 
177 aa  61.6  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0751622  normal  0.115987 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0669  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  31.65 
 
 
155 aa  61.6  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1130  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.29 
 
 
943 aa  61.2  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2861  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  33.33 
 
 
154 aa  60.5  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.76956 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4836  hypothetical protein  27.27 
 
 
334 aa  59.3  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.422259  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3664  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  29.18 
 
 
334 aa  58.9  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.182615  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1441  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.78 
 
 
930 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.963541 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0557  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  31.82 
 
 
139 aa  58.5  0.0000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3805  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.5 
 
 
969 aa  58.2  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.761799 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3715  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.95 
 
 
952 aa  58.2  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.593151  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1355  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  29.32 
 
 
272 aa  58.2  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.252936  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1121  putative NADH dehydrogenase  28.77 
 
 
891 aa  57  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.49523  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1744  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  31.33 
 
 
241 aa  55.5  0.0000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1035  hypothetical protein  29.44 
 
 
313 aa  55.5  0.0000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0509685 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1100  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.85 
 
 
953 aa  54.7  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0546017  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0903  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  27.62 
 
 
932 aa  54.3  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0217477  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0697  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.45 
 
 
946 aa  54.3  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.156614  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0842  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  34.78 
 
 
231 aa  52.8  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.800499  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50730  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.17 
 
 
933 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.284613  normal  0.0126871 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2484  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.56 
 
 
931 aa  52.8  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4324  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.17 
 
 
933 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1678  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.41 
 
 
941 aa  52.4  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04209  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.97 
 
 
938 aa  52.4  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2584  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  35.64 
 
 
159 aa  52  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000418  Na(+) H(+) antiporter subunit A/Na(+) H(+) antiporter subunit B  29.02 
 
 
889 aa  52  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1800  NADH dehydrogenase (quinone)  31.89 
 
 
941 aa  51.2  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.80302  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2849  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.26 
 
 
933 aa  51.6  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0992  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.19 
 
 
949 aa  51.6  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0063  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  26.73 
 
 
947 aa  51.2  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0148  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.03 
 
 
961 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.525301  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1637  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  32.62 
 
 
138 aa  50.8  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.948453  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1538  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.23 
 
 
953 aa  50.8  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0170317 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2652  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.19 
 
 
949 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3729  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.85 
 
 
943 aa  50.4  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.552072  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26930  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit  35.45 
 
 
964 aa  50.4  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0148586  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0232  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.19 
 
 
949 aa  50.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475  normal  0.778843 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1214  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  31.93 
 
 
239 aa  49.3  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1842  hypothetical protein  28.36 
 
 
304 aa  49.3  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2230  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  25.54 
 
 
971 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5214  NADH dehydrogenase (quinone)  31.54 
 
 
980 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282248  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1853  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  24.68 
 
 
971 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.126065 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3510  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  25.54 
 
 
971 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00329797 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3443  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  24.68 
 
 
971 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.462693  normal  0.274222 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0586  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.94 
 
 
966 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.768018  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0598  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.94 
 
 
966 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.581873  normal  0.957162 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0576  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.94 
 
 
966 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0046  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.65 
 
 
937 aa  47  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.504541 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0582  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.26 
 
 
966 aa  47  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.041044 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3128  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.63 
 
 
975 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3982  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.57 
 
 
932 aa  46.2  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.728427 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2806  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.15 
 
 
997 aa  45.8  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.448623 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1591  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  25.91 
 
 
1024 aa  45.4  0.0009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156246  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0865  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  31.97 
 
 
138 aa  44.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19530  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.6 
 
 
931 aa  44.7  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.571752  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0162  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  25.67 
 
 
968 aa  45.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0030  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.08 
 
 
973 aa  44.7  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1289  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  27.56 
 
 
959 aa  44.7  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2969  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  30.08 
 
 
145 aa  45.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.198722 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3471  monovalent cation:proton antiporter, putative  29.41 
 
 
972 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.665295  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3252  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30 
 
 
972 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.295044  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0888  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  33.33 
 
 
152 aa  43.9  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.176778  normal  0.107899 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2928  NADH dehydrogenase (quinone)  31.53 
 
 
948 aa  44.3  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.284391  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05150  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit  32.62 
 
 
978 aa  43.9  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11050  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.5 
 
 
957 aa  44.3  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.217743  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0875  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  34.62 
 
 
139 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.33031  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3310  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  26.44 
 
 
966 aa  44.3  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.90946  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1359  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.82 
 
 
931 aa  44.3  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.472017  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0505  hypothetical protein  34.12 
 
 
93 aa  43.5  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000123307  hitchhiker  0.0000653225 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2583  membrane bound hydrogenase, MbhE subunit  36.36 
 
 
94 aa  43.9  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0578  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  25 
 
 
229 aa  43.5  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3909  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.6 
 
 
975 aa  43.9  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0864607 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0744  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.66 
 
 
969 aa  43.9  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1284  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  30.88 
 
 
139 aa  42.7  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0494  NADH dehydrogenase (quinone)  29.63 
 
 
958 aa  42.7  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5269  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.3 
 
 
967 aa  42.4  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1001  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  32.03 
 
 
139 aa  42  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0768278  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0815  hypothetical protein  30.77 
 
 
321 aa  42  0.01  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.991152  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>