174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5113 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_5113  urease, beta subunit  100 
 
 		 136 aa  280  7.000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.755356 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1308  urease, beta subunit  90.44 
 
 		 136 aa  261  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.321935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1470  urease, beta subunit  90.44 
 
 		 136 aa  261  2e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1357  urease subunit beta  64 
 
 		 159 aa  170  7.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.4189  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1313  urease subunit beta  63.2 
 
 		 164 aa  167  3e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3555  urease subunit beta  53.44 
 
 		 158 aa  144  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.417484  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1132  urease subunit beta  53.44 
 
 		 158 aa  144  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.273178  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1078  urease subunit beta  53.44 
 
 		 144 aa  144  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1870  urease subunit beta  56.48 
 
 		 133 aa  135  2e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.646669  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3054  urease subunit beta  66.67 
 
 		 101 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.612969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2066  urease, beta subunit  63.16 
 
 		 147 aa  132  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000367697  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1054  urease subunit beta  62.24 
 
 		 106 aa  132  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19251  urease subunit beta  62.24 
 
 		 106 aa  132  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3310  urease subunit beta  66.67 
 
 		 101 aa  131  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3482  urease subunit beta  63.54 
 
 		 101 aa  128  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2313  urease subunit beta  54.63 
 
 		 136 aa  129  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2356  urease subunit beta  54.63 
 
 		 136 aa  129  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0269  urease subunit beta  61.46 
 
 		 101 aa  127  6e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2256  urease subunit beta  57.14 
 
 		 106 aa  127  6e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0283  urease subunit beta  61.46 
 
 		 101 aa  127  6e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.209152  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2626  urease subunit beta  61.8 
 
 		 106 aa  127  7.000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.531681 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3620  urease subunit beta  62.38 
 
 		 108 aa  126  8.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0334  urease subunit beta  61.46 
 
 		 101 aa  126  9.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1026  urease, beta subunit  65.59 
 
 		 103 aa  125  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.447798 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00888  probable urease (beta subunit) protein  61.22 
 
 		 102 aa  125  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2270  urease, beta subunit  67.42 
 
 		 113 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.196186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2714  Urease  52.42 
 
 		 217 aa  124  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29801  urease subunit beta  60.42 
 
 		 105 aa  123  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4836  urease, beta subunit  51.69 
 
 		 122 aa  122  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0921761  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1961  bifunctional urease subunit gamma/beta  48.78 
 
 		 231 aa  120  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2386  urease subunit beta  59.38 
 
 		 101 aa  120  9e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.692731  normal  0.33076 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08921  urease subunit beta  57.14 
 
 		 106 aa  119  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2198  bifunctional urease subunit gamma/beta  48.18 
 
 		 231 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.116358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0581  urease subunit beta  65.17 
 
 		 101 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2683  urease, beta subunit  58.33 
 
 		 101 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.171584  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0398  urease, gamma subunit  60.2 
 
 		 206 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2411  urease, beta/gamma subunit  49.59 
 
 		 231 aa  118  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1428  urease, beta subunit  63.74 
 
 		 101 aa  118  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.767872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1747  urease, beta subunit  61.46 
 
 		 101 aa  117  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.641327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6190  bifunctional urease subunit gamma/beta  55.45 
 
 		 231 aa  117  7e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0272769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0747  urease subunit beta  56.84 
 
 		 102 aa  117  7.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0881  urease subunit beta  56.84 
 
 		 111 aa  116  9e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.590043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2772  urease subunit beta  57.14 
 
 		 111 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0835  urease subunit beta  56.12 
 
 		 106 aa  115  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2012  urease, beta subunit  58.33 
 
 		 104 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6440  urease, beta subunit  64.29 
 
 		 122 aa  115  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290036  normal  0.299528 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3208  urease, gamma subunit  60.2 
 
 		 206 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2845  urease subunit beta  54.81 
 
 		 117 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.68752  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3663  urease subunit beta  53.92 
 
 		 109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.334015  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2368  urease subunit beta  61.54 
 
 		 101 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.569035 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1559  urease, beta subunit  61.05 
 
 		 142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1356  bifunctional urease subunit gamma/beta  55.21 
 
 		 231 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4155  urease, gamma subunit  60.42 
 
 		 206 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.877974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2259  urease, beta subunit  59.38 
 
 		 101 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.972861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7011  urease subunit beta  60.42 
 
 		 101 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.63705  normal  0.92315 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1801  urease subunit beta  60.42 
 
 		 101 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27877 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2993  urease, beta subunit  54.17 
 
 		 101 aa  114  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1686  bifunctional urease subunit gamma/beta  45.19 
 
 		 234 aa  114  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.641705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2416  urease subunit beta  58.16 
 
 		 105 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.417471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2881  urease  58.24 
 
 		 101 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1135  bifunctional urease subunit gamma/beta  55.21 
 
 		 231 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.380732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3503  urease subunit beta  60.42 
 
 		 104 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0960  urease subunit beta  60.44 
 
 		 101 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.657667  normal  0.124248 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2213  urease, gamma subunit  58.16 
 
 		 206 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0025871 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2844  urease subunit beta  57.14 
 
 		 105 aa  114  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1196  bifunctional urease subunit gamma/beta  56.99 
 
 		 231 aa  114  5e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.113473 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1817  urease, beta subunit  50 
 
 		 122 aa  114  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2936  urease subunit beta  57.14 
 
 		 105 aa  114  5e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3103  urease, beta subunit  58.33 
 
 		 112 aa  114  6e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08941  urease subunit beta  54.08 
 
 		 106 aa  114  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.349786  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3695  urease subunit beta  59.38 
 
 		 104 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1260  bifunctional urease subunit gamma/beta  50 
 
 		 248 aa  113  8.999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1240  urease, beta subunit  57.29 
 
 		 113 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3244  urease, gamma subunit  58.33 
 
 		 206 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.502966 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4184  urease subunit beta  59.38 
 
 		 101 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3019  urease, gamma subunit  58.33 
 
 		 206 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0792777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2185  urease, beta subunit  61.8 
 
 		 101 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.108548 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0726  urease, beta subunit  47.27 
 
 		 127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3465  urease subunit beta  62.22 
 
 		 106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00430973  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0693  urease subunit beta  62.92 
 
 		 101 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09890  urease subunit beta  64.04 
 
 		 101 aa  112  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.807213  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5588  urease subunit beta  64.04 
 
 		 101 aa  111  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0308  urease subunit beta  61.8 
 
 		 101 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.441813  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0386  urease, beta subunit  55.21 
 
 		 101 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1953  urease subunit beta  61.8 
 
 		 101 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0688  urease subunit beta  52.08 
 
 		 106 aa  111  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0929  urease, beta subunit  57.29 
 
 		 101 aa  110  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3938  urease, beta subunit  59.38 
 
 		 117 aa  110  5e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0888  bifunctional urease subunit gamma/beta  57.29 
 
 		 215 aa  110  5e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2442  urease, beta subunit  58.24 
 
 		 101 aa  110  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.549938  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0507  urease, beta subunit  60 
 
 		 103 aa  110  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0324  urease subunit beta  56.67 
 
 		 103 aa  110  7.000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00761079  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1862  urease, beta subunit  60.67 
 
 		 101 aa  110  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.779138  normal  0.418463 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64370  urease subunit beta  64.04 
 
 		 101 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0786003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1473  urease, beta subunit  47.5 
 
 		 126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.515544 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0986  urease subunit beta  58.33 
 
 		 101 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0582515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0056  urease, beta subunit  57.14 
 
 		 228 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4435  urease subunit beta  60.67 
 
 		 101 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.635744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0833  urease subunit beta  58.89 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3307  urease, gamma subunit  60 
 
 		 206 aa  108  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0704884  normal  0.481457 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>