36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4982 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1948  hypothetical protein  38.99 
 
 		 2487 aa  994    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0909817 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4468  hypothetical protein  83.99 
 
 		 2797 aa  4167    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6067  hypothetical protein  37.91 
 
 		 3296 aa  768    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6604  hypothetical protein  42.61 
 
 		 2955 aa  671    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4932  Apolipoprotein A1/A4/E  84.16 
 
 		 2797 aa  4183    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4982  hypothetical protein  100 
 
 		 2665 aa  5045    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425549 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3548  Apolipoprotein A1/A4/E  28.24 
 
 		 2327 aa  362  4e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.808301 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1538  chemotaxis sensory transducer  25.98 
 
 		 2052 aa  323  3e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4123  hypothetical protein  28.47 
 
 		 1411 aa  315  1e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.520835  normal  0.453877 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2348  hypothetical protein  25.26 
 
 		 2016 aa  307  2.0000000000000002e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.357816 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1408  hypothetical protein  26.76 
 
 		 1652 aa  303  4e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1975  Apolipoprotein A1/A4/E  24.71 
 
 		 2335 aa  299  5e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320272  normal  0.712803 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2239  hypothetical protein  24.89 
 
 		 2252 aa  296  3e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0990  hypothetical protein  33.93 
 
 		 1582 aa  284  2e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1024  hypothetical protein  33.93 
 
 		 1557 aa  283  5e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.171459  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2187  hypothetical protein  24.48 
 
 		 2331 aa  280  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0475107 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1455  hypothetical protein  31.97 
 
 		 1993 aa  278  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.529974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4480  conserved hypothetical protein; putative methyl-accepting chemotaxis protein  30.82 
 
 		 2025 aa  276  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5554  hypothetical protein  30.82 
 
 		 1874 aa  273  4e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1641  hypothetical protein  31.17 
 
 		 2115 aa  270  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3845  hypothetical protein  31.34 
 
 		 1981 aa  265  8e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1086  hypothetical protein  31.39 
 
 		 1799 aa  263  2e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0392577  normal  0.564005 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1318  hypothetical protein  30.63 
 
 		 1850 aa  261  9e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2111  hypothetical protein  27.76 
 
 		 1587 aa  186  4.0000000000000006e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0623  hypothetical protein  20.58 
 
 		 1543 aa  157  2.9999999999999998e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0275717  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2516  hypothetical protein  29.84 
 
 		 764 aa  130  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.134134  normal  0.0151219 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3216  hypothetical protein  33.94 
 
 		 1099 aa  64.3  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3207  hypothetical protein  31.48 
 
 		 810 aa  58.2  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.306587 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2038  hypothetical protein  29.36 
 
 		 864 aa  57.8  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2000  hypothetical protein  28.03 
 
 		 691 aa  51.6  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0150  Apolipoprotein A1/A4/E  17.95 
 
 		 7659 aa  50.1  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1789  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.3 
 
 		 729 aa  48.9  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000025801 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0008  hypothetical protein  20.54 
 
 		 520 aa  49.3  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.556224  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1251  Apolipoprotein A1/A4/E  22.67 
 
 		 1197 aa  48.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0137  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.3 
 
 		 732 aa  47  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3505  Chromosome segregation ATPase-like protein  24.68 
 
 		 1153 aa  46.2  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.293824  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>