30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3896 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3818  hypothetical protein  84.78 
 
 		 473 aa  810    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0537  hypothetical protein  71 
 
 		 480 aa  676    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3896  hypothetical protein  100 
 
 		 473 aa  948    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.27072  normal  0.662181 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3511  hypothetical protein  84.57 
 
 		 473 aa  806    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2084  hypothetical protein  56.65 
 
 		 463 aa  504  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.446219  normal  0.0261738 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4937  hypothetical protein  41.85 
 
 		 440 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2843  hypothetical protein  40.53 
 
 		 439 aa  298  1e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0220  hypothetical protein  29.38 
 
 		 494 aa  171  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.122145 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3336  hypothetical protein  33.43 
 
 		 407 aa  146  8.000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2204  hypothetical protein  26.78 
 
 		 409 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.843647 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4760  hypothetical protein  27.89 
 
 		 390 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.636154  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3920  hypothetical protein  28.15 
 
 		 418 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.186757  normal  0.0767976 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2052  hypothetical protein  26.74 
 
 		 418 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0611  hypothetical protein  25 
 
 		 427 aa  87.4  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19142  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5128  hypothetical protein  26.14 
 
 		 436 aa  80.1  0.00000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2684  hypothetical protein  24.84 
 
 		 429 aa  76.6  0.0000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3796  hypothetical protein  26.78 
 
 		 439 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5903  hypothetical protein  23.66 
 
 		 417 aa  64.3  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0137  hypothetical protein  24.24 
 
 		 403 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3057  hypothetical protein  27.04 
 
 		 464 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3326  hypothetical protein  28.57 
 
 		 479 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0543  hypothetical protein  31.5 
 
 		 518 aa  48.1  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0811  hypothetical protein  28.76 
 
 		 435 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.563774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4419  hypothetical protein  26.19 
 
 		 303 aa  47  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7591  hypothetical protein  47.92 
 
 		 449 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29036  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3558  hypothetical protein  40.74 
 
 		 455 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4701  aminoacyl-tRNA synthetase class I  22.7 
 
 		 407 aa  44.3  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0319438  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2394  hypothetical protein  37.25 
 
 		 456 aa  44.3  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.600984  normal  0.360592 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0869  hypothetical protein  27.46 
 
 		 477 aa  43.5  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0477  hypothetical protein  25.47 
 
 		 443 aa  43.1  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>