39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2487 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2556  hypothetical protein  92.39 
 
 		 381 aa  717    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2779  hypothetical protein  92.13 
 
 		 381 aa  715    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2487  hypothetical protein  100 
 
 		 377 aa  758    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.867123  normal  0.0497364 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5606  hypothetical protein  71.06 
 
 		 388 aa  512  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.545793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5198  hypothetical protein  56.76 
 
 		 357 aa  387  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0902474  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4453  hypothetical protein  55.41 
 
 		 360 aa  367  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.01877 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3051  hypothetical protein  58.55 
 
 		 435 aa  248  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2678  lytic transglycosylase catalytic  39.36 
 
 		 372 aa  199  5e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.782847 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2905  Lytic transglycosylase catalytic  39.59 
 
 		 372 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.150747 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2800  Lytic transglycosylase catalytic  44.13 
 
 		 371 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3599  lytic transglycosylase catalytic  44.69 
 
 		 406 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000515044 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2292  lytic transglycosylase catalytic  45.41 
 
 		 387 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238503  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0316  Lytic transglycosylase catalytic  41.77 
 
 		 372 aa  152  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0454669  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1844  hypothetical protein  44.63 
 
 		 291 aa  141  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2688  hypothetical protein  40.76 
 
 		 332 aa  137  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2585  hypothetical protein  42.11 
 
 		 372 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171189  normal  0.111269 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2310  hypothetical protein  42.11 
 
 		 372 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0151599 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2267  hypothetical protein  42.69 
 
 		 370 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.325406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7204  hypothetical protein  37.67 
 
 		 336 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5181  hypothetical protein  34.88 
 
 		 339 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.425684 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0268  hypothetical protein  41.18 
 
 		 360 aa  126  6e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3111  hypothetical protein  35.19 
 
 		 339 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.374893 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1659  hypothetical protein  39.33 
 
 		 324 aa  124  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3869  hypothetical protein  37.05 
 
 		 346 aa  122  7e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.649147  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1331  hypothetical protein  36.41 
 
 		 314 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.392241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3244  hypothetical protein  37.56 
 
 		 364 aa  119  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.262677  normal  0.336955 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3574  hypothetical protein  36.17 
 
 		 290 aa  117  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2186  hypothetical protein  36.18 
 
 		 377 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.769638  normal  0.0774004 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1258  hypothetical protein  38.71 
 
 		 289 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2720  hypothetical protein  35.51 
 
 		 361 aa  103  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758469  normal  0.520396 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6296  hypothetical protein  39.89 
 
 		 343 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0362049  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0638  hypothetical protein  33.86 
 
 		 638 aa  100  5e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2904  lytic transglycosylase, catalytic  33.97 
 
 		 276 aa  92  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3770  hypothetical protein  36.51 
 
 		 871 aa  57  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.591886  normal  0.0231351 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0251  hypothetical protein  35.25 
 
 		 783 aa  53.5  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5677  hypothetical protein  33.33 
 
 		 255 aa  52  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.700746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3764  hypothetical protein  36.94 
 
 		 274 aa  52  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0811492  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5452  hypothetical protein  29.31 
 
 		 1096 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3074  hypothetical protein  31.79 
 
 		 237 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.139872  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>