17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3406 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3406  fimbrial biogenesis protein  100 
 
 		 398 aa  793    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0526818 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3038  hypothetical protein  27.04 
 
 		 332 aa  90.1  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0541316  normal  0.15459 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2907  type IV pilus assembly protein PilW  27.47 
 
 		 388 aa  80.5  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.952407 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2520  hypothetical protein  27.91 
 
 		 327 aa  66.2  0.0000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0969  type IV pilin, putative  25.32 
 
 		 377 aa  54.3  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1084  hypothetical protein  25.32 
 
 		 377 aa  54.3  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2666  hypothetical protein  24.81 
 
 		 344 aa  53.9  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2272  type IV pilus assembly protein PilW  22.51 
 
 		 342 aa  51.2  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0212  type IV pilus assembly protein PilW  23.45 
 
 		 344 aa  50.4  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.041624 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1214  hypothetical protein  23.17 
 
 		 322 aa  50.1  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01322  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain protein  25.58 
 
 		 388 aa  48.1  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421524  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1380  hypothetical protein  24.82 
 
 		 385 aa  45.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.175236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2537  hypothetical protein  36.76 
 
 		 303 aa  45.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1296  type IV pilus assembly protein PilW  33.33 
 
 		 326 aa  44.3  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.488119 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3227  hypothetical protein  23.73 
 
 		 341 aa  44.3  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0859  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  36.23 
 
 		 212 aa  43.5  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3012  hypothetical protein  37.7 
 
 		 195 aa  42.7  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>