More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3094 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1103  glucose-6-phosphate isomerase  63.79 
 
 		 520 aa  646    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3385  glucose-6-phosphate isomerase  69.81 
 
 		 545 aa  753    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0675  glucose-6-phosphate isomerase  61.96 
 
 		 538 aa  656    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.270569  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1127  glucose-6-phosphate isomerase  62.96 
 
 		 522 aa  657    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0753  glucose-6-phosphate isomerase  63.75 
 
 		 525 aa  673    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.64368 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3094  glucose-6-phosphate isomerase  100 
 
 		 545 aa  1098    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0944  glucose-6-phosphate isomerase  62.98 
 
 		 532 aa  664    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876261 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0655  glucose-6-phosphate isomerase  63.57 
 
 		 521 aa  657    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0621546  decreased coverage  0.00285419 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0697  glucose-6-phosphate isomerase  62.63 
 
 		 538 aa  667    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000815409 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4222  glucose-6-phosphate isomerase  59.74 
 
 		 944 aa  613  9.999999999999999e-175  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5598  glucose-6-phosphate isomerase  59.15 
 
 		 520 aa  603  1.0000000000000001e-171  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.885182  normal  0.434558 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5674  glucose-6-phosphate isomerase  56.42 
 
 		 540 aa  582  1.0000000000000001e-165  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26291 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1339  glucose-6-phosphate isomerase  50.36 
 
 		 548 aa  531  1e-150  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0803183  unclonable  0.00000158602 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2986  Glucose-6-phosphate isomerase  51.55 
 
 		 541 aa  532  1e-150  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1140  glucose-6-phosphate isomerase  50.82 
 
 		 547 aa  533  1e-150  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.279922  normal  0.256164 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0612  glucose-6-phosphate isomerase  50.92 
 
 		 548 aa  526  1e-148  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000038742  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1095  glucose-6-phosphate isomerase  49.82 
 
 		 559 aa  526  1e-148  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0975  glucose-6-phosphate isomerase  50.27 
 
 		 549 aa  519  1e-146  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.307999  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1515  glucose-6-phosphate isomerase  49.63 
 
 		 562 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.447812  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1325  glucose-6-phosphate isomerase  50.28 
 
 		 531 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0252663  normal  0.710455 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0472  glucose-6-phosphate isomerase  47.36 
 
 		 567 aa  518  1.0000000000000001e-145  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0710  glucose-6-phosphate isomerase  52.66 
 
 		 543 aa  516  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0210645  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1048  glucose-6-phosphate isomerase  49.27 
 
 		 545 aa  513  1e-144  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000131328  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0285  glucose-6-phosphate isomerase  52.82 
 
 		 549 aa  513  1e-144  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.542029  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0871  Glucose-6-phosphate isomerase  50 
 
 		 548 aa  511  1e-144  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.881777  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2367  glucose phosphate isomerase  49.64 
 
 		 548 aa  512  1e-144  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000694926  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0378  glucose-6-phosphate isomerase  53.11 
 
 		 536 aa  513  1e-144  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.419467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0299  glucose-6-phosphate isomerase  53.01 
 
 		 549 aa  513  1e-144  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.921042  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1247  glucose-6-phosphate isomerase  50 
 
 		 546 aa  510  1e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237953  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0369  glucose-6-phosphate isomerase  52.46 
 
 		 549 aa  511  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0974  glucose-6-phosphate isomerase  52.01 
 
 		 550 aa  508  1e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0649451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2947  glucose-6-phosphate isomerase  53.52 
 
 		 547 aa  509  1e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0280  Glucose-6-phosphate isomerase  47.56 
 
 		 548 aa  508  1e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0655697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1161  glucose-6-phosphate isomerase  49.08 
 
 		 552 aa  508  9.999999999999999e-143  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.149944  normal  0.283638 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1304  glucose-6-phosphate isomerase  53.17 
 
 		 649 aa  505  9.999999999999999e-143  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0385  glucose-6-phosphate isomerase  47.54 
 
 		 550 aa  505  9.999999999999999e-143  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0412831  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0912  glucose-6-phosphate isomerase  49.34 
 
 		 545 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.283196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0819  glucose-6-phosphate isomerase  46.25 
 
 		 539 aa  506  9.999999999999999e-143  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2785  glucose-6-phosphate isomerase  47.91 
 
 		 550 aa  503  1e-141  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0501561  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1110  glucose-6-phosphate isomerase  48.18 
 
 		 545 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00275432  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0070  glucose-6-phosphate isomerase  51.78 
 
 		 545 aa  502  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2968  glucose-6-phosphate isomerase  48.18 
 
 		 545 aa  502  1e-141  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000175964  normal  0.301061 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3050  glucose-6-phosphate isomerase  48.18 
 
 		 545 aa  502  1e-141  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0740985  normal  0.178291 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3148  glucose-6-phosphate isomerase  48.18 
 
 		 545 aa  503  1e-141  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000357068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5494  Glucose-6-phosphate isomerase  46.08 
 
 		 550 aa  499  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0138523 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3246  glucose-6-phosphate isomerase  48 
 
 		 545 aa  501  1e-140  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000866912  decreased coverage  0.000837728 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1940  glucose-6-phosphate isomerase  51.1 
 
 		 540 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.478064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1043  glucose-6-phosphate isomerase  48.18 
 
 		 545 aa  501  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00018254  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4356  glucose-6-phosphate isomerase  51.64 
 
 		 543 aa  501  1e-140  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1144  glucose-6-phosphate isomerase  48.18 
 
 		 545 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0343286  normal  0.608954 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1905  glucose-6-phosphate isomerase  50.92 
 
 		 556 aa  498  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.139815  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0324  glucose-6-phosphate isomerase  46.73 
 
 		 550 aa  500  1e-140  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3547  glucose-6-phosphate isomerase  48 
 
 		 545 aa  497  1e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2063  glucose-6-phosphate isomerase  48.91 
 
 		 560 aa  496  1e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0137  glucose-6-phosphate isomerase  49.81 
 
 		 541 aa  496  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.574148 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002341  glucose-6-phosphate isomerase  46.64 
 
 		 550 aa  496  1e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6162  glucose-6-phosphate isomerase  51.1 
 
 		 556 aa  497  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1917  glucose-6-phosphate isomerase  51.1 
 
 		 556 aa  497  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0173524  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1835  glucose-6-phosphate isomerase  50.92 
 
 		 540 aa  498  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.312318 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1073  glucose-6-phosphate isomerase  46.8 
 
 		 545 aa  496  1e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1231  Glucose-6-phosphate isomerase  45.29 
 
 		 549 aa  493  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89106  hitchhiker  0.000628963 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5218  glucose-6-phosphate isomerase  50.55 
 
 		 556 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4018  glucose-6-phosphate isomerase  45.99 
 
 		 548 aa  493  9.999999999999999e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.732321 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2132  glucose-6-phosphate isomerase  52.49 
 
 		 615 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.163418  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1914  glucose-6-phosphate isomerase  50.37 
 
 		 540 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.572285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00012  glucose-6-phosphate isomerase  46.81 
 
 		 550 aa  493  9.999999999999999e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0143  glucose-6-phosphate isomerase  49.72 
 
 		 541 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03322  glucose-6-phosphate isomerase  47.52 
 
 		 549 aa  492  9.999999999999999e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.345026  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0481  Glucose-6-phosphate isomerase  47.71 
 
 		 552 aa  489  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.734703 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2347  glucose-6-phosphate isomerase  51.93 
 
 		 540 aa  491  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11339  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1808  glucose-6-phosphate isomerase  47.43 
 
 		 554 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.339602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4701  glucose-6-phosphate isomerase  47.7 
 
 		 554 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101931 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1019  glucose-6-phosphate isomerase  50.56 
 
 		 540 aa  490  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3594  glucose-6-phosphate isomerase  46.47 
 
 		 554 aa  489  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1449  glucose-6-phosphate isomerase  51.93 
 
 		 540 aa  491  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.446361  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0826  glucose-6-phosphate isomerase  47.62 
 
 		 554 aa  489  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000464975 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2308  glucose-6-phosphate isomerase  51.75 
 
 		 540 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764178  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1649  glucose-6-phosphate isomerase  52.47 
 
 		 542 aa  490  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.614391  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2466  glucose-6-phosphate isomerase  51.93 
 
 		 540 aa  491  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0903  glucose-6-phosphate isomerase  47.88 
 
 		 549 aa  491  1e-137  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144639  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4566  glucose-6-phosphate isomerase  47.7 
 
 		 554 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.489818  normal  0.0824899 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3363  glucose-6-phosphate isomerase  51.93 
 
 		 540 aa  491  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383524  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2589  Glucose-6-phosphate isomerase  50.27 
 
 		 569 aa  489  1e-137  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0431757  normal  0.0153093 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2901  glucose-6-phosphate isomerase  46.82 
 
 		 545 aa  491  1e-137  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1215  glucose-6-phosphate isomerase  51.93 
 
 		 540 aa  491  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0732  glucose-6-phosphate isomerase  47.33 
 
 		 554 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.309434  hitchhiker  0.0000815529 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3591  glucose-6-phosphate isomerase  48.73 
 
 		 550 aa  488  1e-137  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1935  glucose-6-phosphate isomerase  48.81 
 
 		 547 aa  490  1e-137  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4700  glucose-6-phosphate isomerase  47.88 
 
 		 554 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0570543  hitchhiker  0.00570528 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1942  glucose-6-phosphate isomerase  51.93 
 
 		 540 aa  491  1e-137  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0302  glucose-6-phosphate isomerase  46.51 
 
 		 548 aa  485  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.19722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0373  glucose-6-phosphate isomerase  46.51 
 
 		 548 aa  485  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0735  glucose-6-phosphate isomerase  44.51 
 
 		 547 aa  486  1e-136  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1386  glucose-6-phosphate isomerase  51.63 
 
 		 545 aa  485  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214201  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3918  glucose-6-phosphate isomerase  46.51 
 
 		 548 aa  485  1e-136  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2539  Glucose-6-phosphate isomerase  48.37 
 
 		 539 aa  486  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0534  glucose-6-phosphate isomerase  50.55 
 
 		 541 aa  488  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42740  glucose-6-phosphate isomerase  47.24 
 
 		 554 aa  486  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967363  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1279  glucose-6-phosphate isomerase  46.28 
 
 		 545 aa  486  1e-136  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000145573  normal  0.0332252 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2924  glucose-6-phosphate isomerase  48.37 
 
 		 539 aa  486  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>