169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2734 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2734  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  100 
 
 		 425 aa  853    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0111  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  56.71 
 
 		 430 aa  436  1e-121  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.726642  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2977  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  50.82 
 
 		 422 aa  402  1e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.717482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3541  L-threonine synthase  50.95 
 
 		 416 aa  398  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0314915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0503  L-threonine synthase  53.55 
 
 		 412 aa  391  1e-107  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2116  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  55.11 
 
 		 424 aa  387  1e-106  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0680  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  48.56 
 
 		 431 aa  335  7.999999999999999e-91  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1454  L-threonine synthase  46.47 
 
 		 417 aa  333  4e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.199227  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2716  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  29.82 
 
 		 427 aa  97.1  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1998  L-threonine synthase  28.4 
 
 		 414 aa  95.1  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2049  threonine synthase  25.89 
 
 		 405 aa  92.8  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0346  threonine synthase  24.74 
 
 		 404 aa  91.3  3e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.159817  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1218  response regulator receiver protein  29.31 
 
 		 545 aa  90.1  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1140  threonine synthase  26.01 
 
 		 404 aa  89.4  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0713  threonine synthase  26.97 
 
 		 401 aa  87.8  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0941717  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1541  threonine synthase  24.87 
 
 		 403 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1134  threonine synthase  25.13 
 
 		 404 aa  85.5  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0683  threonine synthase  26.72 
 
 		 401 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.761513 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0817  threonine synthase  25.19 
 
 		 404 aa  83.6  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1619  threonine synthase  25.65 
 
 		 402 aa  82  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.944932 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1420  threonine synthase  26.45 
 
 		 399 aa  79.7  0.00000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.673193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1560  threonine synthase  26.26 
 
 		 401 aa  76.6  0.0000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.77266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1728  threonine synthase  24.82 
 
 		 421 aa  76.3  0.0000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4028  threonine synthase  26.32 
 
 		 432 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4066  threonine synthase  26.32 
 
 		 432 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0219584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0107  threonine synthase  27.34 
 
 		 403 aa  73.6  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4152  threonine synthase  27.47 
 
 		 361 aa  72.8  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.231513  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4952  threonine synthase  24.24 
 
 		 454 aa  70.9  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.403318 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5014  threonine synthase  25.37 
 
 		 441 aa  70.5  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4348  threonine synthase  24.44 
 
 		 437 aa  70.5  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0192799  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2960  threonine synthase  25 
 
 		 434 aa  68.6  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0549181  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2423  threonine synthase  24.64 
 
 		 354 aa  68.2  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5545  threonine synthase  25.43 
 
 		 351 aa  67.8  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.127458 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2252  threonine synthase  26.36 
 
 		 345 aa  68.2  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0353523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19330  L-threonine synthase  26.33 
 
 		 352 aa  67.8  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2299  threonine synthase  26.63 
 
 		 359 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1782  threonine synthase  25 
 
 		 430 aa  67.4  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0319  threonine synthase  25.51 
 
 		 352 aa  67.4  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.147741 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3191  threonine synthase  25.41 
 
 		 411 aa  67.4  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0891215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0324  threonine synthase  22.83 
 
 		 352 aa  67  0.0000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0884  threonine synthase  23.98 
 
 		 352 aa  65.1  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4347  threonine synthase  26.64 
 
 		 359 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0583666  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3987  threonine synthase  25.7 
 
 		 424 aa  64.7  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0874528  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1253  threonine synthase  26.24 
 
 		 363 aa  63.9  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.310608 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2719  threonine synthase  25.65 
 
 		 427 aa  63.9  0.000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.767894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0374  threonine synthase  24.13 
 
 		 348 aa  63.5  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0391  threonine synthase  24.13 
 
 		 348 aa  63.5  0.000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0595  threonine synthase  25.42 
 
 		 437 aa  63.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3186  threonine synthase  26.16 
 
 		 346 aa  63.2  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000625844  normal  0.196815 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2573  threonine synthase  26.21 
 
 		 405 aa  63.2  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0592  threonine synthase  22.37 
 
 		 351 aa  62.8  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0615  threonine synthase  24.72 
 
 		 403 aa  62.4  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3938  threonine synthase  24.28 
 
 		 352 aa  62.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1259  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  27.91 
 
 		 356 aa  61.6  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1306  threonine synthase  24.34 
 
 		 348 aa  62  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.331219 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0631  threonine synthase  25.14 
 
 		 365 aa  62  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345787  hitchhiker  0.00263749 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3080  threonine synthase  26.17 
 
 		 346 aa  62  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0615422  hitchhiker  0.00256944 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1006  threonine synthase  26.15 
 
 		 374 aa  62.4  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3724  threonine synthase  26.96 
 
 		 377 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0780152  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4338  threonine synthase  25.36 
 
 		 362 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.575682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4507  threonine synthase  24.65 
 
 		 357 aa  61.2  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.871265  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0319  threonine synthase  25.65 
 
 		 419 aa  60.5  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3895  threonine synthase  24.85 
 
 		 360 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.997938  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3969  threonine synthase  24.85 
 
 		 360 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.431917  normal  0.774018 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1839  threonine synthase  25.07 
 
 		 406 aa  60.5  0.00000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3881  threonine synthase  24.85 
 
 		 360 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3040  threonine synthase  26.5 
 
 		 353 aa  60.5  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1971  threonine synthase  24.05 
 
 		 352 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0621925  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1800  threonine synthase  23.45 
 
 		 352 aa  60.1  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0158602  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2003  threonine synthase  23.45 
 
 		 352 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1677499999999998e-42 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2074  threonine synthase  23.16 
 
 		 352 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759353  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1783  threonine synthase  23.45 
 
 		 352 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3356  threonine synthase  23.75 
 
 		 352 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000444618  hitchhiker  0.0000000000000127983 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1826  threonine synthase  23.16 
 
 		 352 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00172769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1969  threonine synthase  23.16 
 
 		 352 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0589292  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1497  threonine synthase  23.91 
 
 		 352 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0143366  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1834  threonine synthase  21.54 
 
 		 352 aa  58.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.199659  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0596  threonine synthase  24.93 
 
 		 380 aa  58.2  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1549  threonine synthase  24.75 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.738086 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2052  threonine synthase  23.73 
 
 		 352 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.412659  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11322  threonine synthase  24.85 
 
 		 360 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18541  threonine synthase  22.54 
 
 		 368 aa  57.4  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.210401  normal  0.0322921 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0909  L-threonine synthase  22.45 
 
 		 349 aa  57.4  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000973951 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1200  threonine synthase  25.07 
 
 		 351 aa  57  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.887008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1848  threonine synthase  26.65 
 
 		 414 aa  57  0.0000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0806  threonine synthase  24.11 
 
 		 408 aa  57  0.0000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1493  threonine synthase  24.13 
 
 		 423 aa  56.6  0.0000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.221995  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1480  L-threonine synthase  23.86 
 
 		 408 aa  56.2  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0274  threonine synthase  23.98 
 
 		 403 aa  56.2  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1649  L-threonine synthase  23.61 
 
 		 352 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1229  threonine synthase  24.69 
 
 		 416 aa  55.8  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1395  threonine synthase  24.29 
 
 		 395 aa  55.5  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0100  threonine synthase  26.46 
 
 		 418 aa  55.8  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1745  L-threonine synthase  24.31 
 
 		 365 aa  55.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0188218  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4205  threonine synthase  26.7 
 
 		 419 aa  55.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2310  threonine synthase  24.13 
 
 		 351 aa  55.1  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0378  threonine synthase  22.03 
 
 		 356 aa  54.7  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1367  threonine synthase  24.87 
 
 		 346 aa  54.7  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0140  threonine synthase  23.78 
 
 		 371 aa  54.7  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.052405 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4032  threonine synthase  25.37 
 
 		 349 aa  54.3  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.969378  hitchhiker  0.000421032 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>