24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2139 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2139  methanogenesis marker protein 11  100 
 
 		 297 aa  610  9.999999999999999e-175  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0431917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0595  hypothetical protein  65.44 
 
 		 298 aa  385  1e-106  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.183466 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0630  hypothetical protein  64.31 
 
 		 297 aa  382  1e-105  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00298214  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1804  hypothetical protein  62.67 
 
 		 296 aa  348  8e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0229  hypothetical protein  55.75 
 
 		 295 aa  317  2e-85  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0403  hypothetical protein  47.02 
 
 		 303 aa  258  7e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000000299403  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0536  hypothetical protein  43.69 
 
 		 302 aa  226  4e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2301  hypothetical protein  41.34 
 
 		 303 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0840  hypothetical protein  34.81 
 
 		 301 aa  159  7e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.156191  normal  0.850594 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1486  hypothetical protein  35.64 
 
 		 306 aa  159  8e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1816  hypothetical protein  34.13 
 
 		 301 aa  155  8e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0905  hypothetical protein  35.92 
 
 		 301 aa  155  9e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1077  methanogenesis marker protein 11  34.13 
 
 		 301 aa  154  2e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0594  hypothetical protein  30.77 
 
 		 338 aa  101  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.184211 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0629  hypothetical protein  29.55 
 
 		 318 aa  94  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.110279  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0236  hypothetical protein  33.06 
 
 		 318 aa  91.7  1e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2138  hypothetical protein  31.72 
 
 		 318 aa  86.7  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00938098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1994  hypothetical protein  27.55 
 
 		 368 aa  67  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1355  hypothetical protein  26.76 
 
 		 368 aa  65.5  0.0000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0680221  normal  0.056831 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0480  ribosomal protein L15-like protein  25.91 
 
 		 375 aa  62.4  0.000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.774721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1562  hypothetical protein  22.29 
 
 		 450 aa  44.7  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0100  hypothetical protein  32.72 
 
 		 413 aa  44.3  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000405594 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2319  hypothetical protein  24.16 
 
 		 428 aa  43.1  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0159  hypothetical protein  27.59 
 
 		 415 aa  42.7  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>