More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1554 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1554  30S ribosomal protein S10P  100 
 
 		 102 aa  205  2e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0698  30S ribosomal protein S10P  97.06 
 
 		 102 aa  199  9e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.135544 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0729  30S ribosomal protein S10P  93.14 
 
 		 102 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000150109  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1593  30S ribosomal protein S10P  91.18 
 
 		 102 aa  192  2e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1440  30S ribosomal protein S10P  90.2 
 
 		 102 aa  190  5e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0822  30S ribosomal protein S10P  76.47 
 
 		 102 aa  167  5e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3684  30S ribosomal protein S10P  74.51 
 
 		 102 aa  160  4.0000000000000004e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.273762 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1169  30S ribosomal protein S10P  73.27 
 
 		 103 aa  159  1e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0074  ribosomal protein S10  72.55 
 
 		 104 aa  157  5e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0042171  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0810  30S ribosomal protein S10P  72.28 
 
 		 102 aa  156  1e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0157  30S ribosomal protein S10P  71.29 
 
 		 102 aa  153  6e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0496  30S ribosomal protein S10P  72 
 
 		 103 aa  153  9e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.629628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2517  ribosomal protein S10  74.26 
 
 		 102 aa  150  4e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3065  ribosomal protein S10  74.26 
 
 		 102 aa  150  4e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0781  30S ribosomal protein S10P  57.84 
 
 		 102 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.510542  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0681  30S ribosomal protein S10P  55.88 
 
 		 102 aa  130  3.9999999999999996e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0616  30S ribosomal protein S10P  58 
 
 		 102 aa  130  5e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1302  30S ribosomal protein S10P  58 
 
 		 102 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0207  30S ribosomal protein S10P  57 
 
 		 102 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.271258  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1195  ribosomal protein S10  58.16 
 
 		 102 aa  119  9.999999999999999e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1033  30S ribosomal protein S10  50.51 
 
 		 102 aa  115  3e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0648  30S ribosomal protein S10P  52.58 
 
 		 109 aa  113  6.9999999999999995e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000577267  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0097  30S ribosomal protein S10P  51.55 
 
 		 121 aa  113  8.999999999999998e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.718504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0042  30S ribosomal protein S10P  53.54 
 
 		 102 aa  108  2.0000000000000002e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000120116  normal  0.273764 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0987  30S ribosomal protein S10P  52.53 
 
 		 106 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000883744 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0304  30S ribosomal protein S10P  52.53 
 
 		 106 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1817  30S ribosomal protein S10P  51.52 
 
 		 106 aa  107  6e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00457841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0354  30S ribosomal protein S10P  50.51 
 
 		 106 aa  105  3e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_51291  predicted protein  35.64 
 
 		 121 aa  83.2  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00204375  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30430  Ribosomal protein S20, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  39 
 
 		 125 aa  82.8  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0524251  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01410  ribosomal protein S20, putative  38.24 
 
 		 119 aa  82  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04594  40S ribosomal protein S10a (AFU_orthologue; AFUA_2G02150)  37.25 
 
 		 115 aa  81.6  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85261  ribosomal protein S20  34.31 
 
 		 119 aa  76.3  0.0000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.827129  normal  0.0953381 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1484  30S ribosomal protein S10  41 
 
 		 102 aa  75.9  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000272811  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1525  ribosomal protein S10  43 
 
 		 102 aa  75.5  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.651999  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0193  SSU ribosomal protein S10P  41 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000113928  normal  0.060255 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0421  30S ribosomal protein S10  41 
 
 		 102 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000238297  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1163  ribosomal protein S10  41 
 
 		 102 aa  73.9  0.0000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000940072  hitchhiker  0.000000509949 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2688  30S ribosomal protein S10  41 
 
 		 102 aa  73.6  0.0000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.832571 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2976  30S ribosomal protein S10  41 
 
 		 102 aa  73.6  0.0000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.430962  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3144  ribosomal protein S10  41 
 
 		 102 aa  73.2  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0968346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0285  ribosomal protein S10  42 
 
 		 102 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0119984  hitchhiker  0.00531479 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0214  ribosomal protein S10  41 
 
 		 102 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114911  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17170  30S ribosomal protein S10  40 
 
 		 102 aa  72  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0484484  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0626  ribosomal protein S10  41 
 
 		 102 aa  72.4  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0195  30S ribosomal protein S10  39 
 
 		 102 aa  72  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00451174  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0305  30S ribosomal protein S10  42 
 
 		 102 aa  72.4  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170298 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2902  30S ribosomal protein S10  41 
 
 		 103 aa  72  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945352  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2660  ribosomal protein S10  40 
 
 		 102 aa  72  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4322  ribosomal protein S10  41 
 
 		 102 aa  71.6  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2334  ribosomal protein S10  40 
 
 		 103 aa  71.6  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000521962  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0586  ribosomal protein S10  40 
 
 		 102 aa  71.6  0.000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.114557  normal  0.306746 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20880  SSU ribosomal protein S10P  40 
 
 		 102 aa  71.6  0.000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0503549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29750  SSU ribosomal protein S10P  40 
 
 		 102 aa  71.6  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.2403 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6050  30S ribosomal protein S10  41 
 
 		 102 aa  71.2  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0825788  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1706  30S ribosomal protein S10  40 
 
 		 102 aa  71.2  0.000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00186428  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5123  ribosomal protein S10  41 
 
 		 102 aa  71.2  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.971498 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0930  30S ribosomal protein S10  41 
 
 		 102 aa  70.9  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0581  30S ribosomal protein S10  40 
 
 		 102 aa  70.9  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0594  SSU ribosomal protein S10P  37 
 
 		 102 aa  70.9  0.000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000677882  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1184  30S ribosomal protein S10  42 
 
 		 102 aa  70.5  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0592971 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0224  ribosomal protein S10  39 
 
 		 102 aa  70.5  0.000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01160  ribosomal protein S10  39 
 
 		 103 aa  70.5  0.000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000349687  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0687  30S ribosomal protein S10  40 
 
 		 102 aa  70.1  0.000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.38034 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2647  30S ribosomal protein S10  40 
 
 		 102 aa  69.7  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.186933  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1085  30S ribosomal protein S10  40 
 
 		 102 aa  69.7  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1746  30S ribosomal protein S10  36.63 
 
 		 106 aa  70.1  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000231589  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0757  30S ribosomal protein S10  38 
 
 		 103 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515165  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23820  SSU ribosomal protein S10P  39 
 
 		 102 aa  69.7  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3906  30S ribosomal protein S10  40 
 
 		 102 aa  69.7  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3865  30S ribosomal protein S10  37.62 
 
 		 103 aa  70.1  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1073  30S ribosomal protein S10  37 
 
 		 106 aa  68.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16301  30S ribosomal protein S10  37 
 
 		 106 aa  69.3  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19481  30S ribosomal protein S10  37 
 
 		 106 aa  68.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2023  30S ribosomal protein S10  37 
 
 		 106 aa  68.9  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.532021  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4027  30S ribosomal protein S10  39 
 
 		 102 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000005274 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1012  30S ribosomal protein S10  38.78 
 
 		 101 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0866  30S ribosomal protein S10  39 
 
 		 102 aa  69.3  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000610931  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5050  30S ribosomal protein S10  38.78 
 
 		 101 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.38543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1039  30S ribosomal protein S10  38.78 
 
 		 101 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1029  30S ribosomal protein S10  38.78 
 
 		 101 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.632906 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03970  30S ribosomal protein S10  38.78 
 
 		 101 aa  68.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.914635 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1304  30S ribosomal protein S10  38.78 
 
 		 101 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.155802  normal  0.101468 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0561  30S ribosomal protein S10  40 
 
 		 102 aa  68.2  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10714  30S ribosomal protein S10  38.78 
 
 		 101 aa  68.2  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.193361 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1395  30S ribosomal protein S10  39 
 
 		 102 aa  68.6  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00721101  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1291  30S ribosomal protein S10  39 
 
 		 102 aa  68.6  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000123252  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1185  ribosomal protein S10  40.21 
 
 		 101 aa  68.6  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000082912  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6615  30S ribosomal protein S10  38.78 
 
 		 101 aa  67.8  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0109  30S ribosomal protein S10  39 
 
 		 102 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000428723  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23661  30S ribosomal protein S10  37 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.09836 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1122  30S ribosomal protein S10  38.78 
 
 		 101 aa  68.2  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0109  30S ribosomal protein S10  39 
 
 		 102 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000209715  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2461  30S ribosomal protein S10  40 
 
 		 102 aa  67.8  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.043315 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3759  ribosomal protein S10  38.78 
 
 		 101 aa  67.8  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.542492  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0961  ribosomal protein S10  40 
 
 		 102 aa  68.2  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000260411  hitchhiker  0.000000000152054 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3436  ribosomal protein S10  38.78 
 
 		 101 aa  67.8  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16250  SSU ribosomal protein S10P  39 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00216069  hitchhiker  0.00000702102 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10030  SSU ribosomal protein S10P  40 
 
 		 102 aa  68.2  0.00000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000017716  hitchhiker  0.00000000188362 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16981  30S ribosomal protein S10  36 
 
 		 106 aa  67.8  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>