79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6286 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6286  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 195 aa  380  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.969042  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6972  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  95.9 
 
 		 195 aa  368  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3527  two component response regulator  42.68 
 
 		 233 aa  61.2  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2605  two component transcriptional regulator  42.68 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1026  two component transcriptional regulator  45.21 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3336  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.04 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.523001 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2174  two component transcriptional regulator  43.84 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.77199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3488  two component transcriptional regulator  43.84 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.487721  normal  0.120653 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3079  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.04 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.457382 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0784  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.84 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.182528 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0824  response regulator receiver  43.84 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.788002  normal  0.224481 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2621  two component transcriptional regulator  40.7 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.75303  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1903  two component transcriptional regulator  40.7 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1279  two component transcriptional regulator  40.7 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.461363  normal  0.257738 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1508  cell cycle transcriptional regulator ctrA  42.47 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.469708  normal  0.710734 
 
 
-
 
NC_002978  WD0732  cell cycle transcriptional regulator  45.31 
 
 		 256 aa  58.2  0.00000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1019  cell cycle transcriptional regulator CtrA  38.82 
 
 		 233 aa  58.2  0.00000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.736916  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1830  two component transcriptional regulator  39.19 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2213  two component transcriptional regulator / cell cycle transcriptional regulator CtrA  40.96 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0669  transcription regulator CtrA  43.84 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.7626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6127  two component transcriptional regulator  42.11 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0747  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.47 
 
 		 233 aa  57  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.485257  normal  0.934966 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3622  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.47 
 
 		 233 aa  57  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0114155  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0344  two component transcriptional regulator  42.47 
 
 		 233 aa  57  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.348132 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3946  two component transcriptional regulator  42.47 
 
 		 233 aa  57  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.26309  normal  0.0241191 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5573  two component transcriptional regulator  42.47 
 
 		 233 aa  57  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0303  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2529  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.47 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2505  two component transcriptional regulator  41.77 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.791438  normal  0.178168 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3912  two component transcriptional regulator  42.47 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0525  transcriptional regulatory protein  42.47 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.369528  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6533  cell cycle transcriptional regulator CtrA  42.47 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.1191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1822  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.47 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.077619  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0563  two component transcriptional regulator  42.47 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.621979  normal  0.422433 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3371  two component transcriptional regulator  42.47 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.442318  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3672  winged helix family two component transcriptional regulator  42.47 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4233  two component transcriptional regulator  42.47 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0736222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4854  two component transcriptional regulator  41.43 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0525  two component transcriptional regulator / cell cycle transcriptional regulator CtrA  42.86 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1399  two component transcriptional regulator  38.96 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.365128 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1569  two component transcriptional regulator  39.51 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5319  cell cycle transcriptional regulator CtrA  43.94 
 
 		 233 aa  53.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0983847 
 
 
-
 
NC_004310  BR1599  cell cycle transcriptional regulator CtrA  39.51 
 
 		 232 aa  53.1  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0123641  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1542  cell cycle transcriptional regulator CtrA  39.51 
 
 		 232 aa  53.1  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.774151  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0574  two component transcriptional regulator  34.72 
 
 		 250 aa  52.8  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.821306  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0234  DNA-binding response regulator  42.37 
 
 		 265 aa  51.6  0.000007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1202  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.66 
 
 		 244 aa  50.1  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0817  response regulator receiver: C terminal  35.9 
 
 		 266 aa  48.9  0.00004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0415499  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1012  DNA-binding response regulator  35.9 
 
 		 265 aa  48.9  0.00005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0213425  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3447  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.36 
 
 		 266 aa  47.4  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.652082 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1393  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.55 
 
 		 223 aa  46.6  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0533398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2647  response regulator receiver domain-containing protein  41.89 
 
 		 224 aa  47  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.629356 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3142  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.11 
 
 		 245 aa  46.6  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.237256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4084  response regulator receiver protein  53.85 
 
 		 57 aa  44.3  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579034  normal  0.574637 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1059  two component transcriptional regulator  35.29 
 
 		 242 aa  44.3  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.346912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0977  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.29 
 
 		 242 aa  44.3  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3187  two component transcriptional regulator  41.98 
 
 		 229 aa  43.5  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0003  response regulator receiver  35.38 
 
 		 235 aa  43.5  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1494  response regulator receiver domain-containing protein  39.51 
 
 		 227 aa  43.1  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6599  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.83 
 
 		 224 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000657401 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0242  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.79 
 
 		 238 aa  43.5  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.206504  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0630  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 223 aa  42.7  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000549408  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0545  two component transcriptional regulator  42.5 
 
 		 250 aa  43.1  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0496  two component transcriptional regulator  38.96 
 
 		 225 aa  42.4  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.569564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4036  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.96 
 
 		 225 aa  42.4  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41260  putative two-component response regulator  36.71 
 
 		 235 aa  42.4  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.923976 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2746  two component transcriptional regulator  41.89 
 
 		 233 aa  42.4  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.396444  normal  0.898138 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3060  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 223 aa  42.4  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1083  two component transcriptional regulator  41.89 
 
 		 233 aa  42.4  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1754  two component transcriptional regulator, winged helix family  34 
 
 		 226 aa  42.7  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1953  two component transcriptional regulator  34 
 
 		 226 aa  42.7  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2208  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.19 
 
 		 232 aa  42  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3498  putative two-component response regulator  36.71 
 
 		 235 aa  42.4  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0401889  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49450  response regulator TctD  39.13 
 
 		 223 aa  42  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.537816  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1408  two component transcriptional regulator  34.18 
 
 		 232 aa  41.6  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3274  transcriptional regulator OmpR, putative  35.9 
 
 		 245 aa  41.6  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0331967  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2872  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.9 
 
 		 245 aa  41.6  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000541059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5286  two component transcriptional regulator  39.19 
 
 		 240 aa  41.6  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2259  response regulator protein  37.66 
 
 		 288 aa  41.2  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625515  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>