34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0191 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_0191  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  100 
 
 
236 aa  481  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0876048  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3649  hypothetical protein  86.02 
 
 
236 aa  417  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0137828 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2879  hypothetical protein  58.02 
 
 
241 aa  280  2e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3105  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  58.02 
 
 
241 aa  280  2e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.163127  normal  0.170192 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3002  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  58.02 
 
 
241 aa  278  5e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5406  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  56.25 
 
 
238 aa  259  3e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4723  hypothetical protein  41.54 
 
 
259 aa  167  9e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4123  hypothetical protein  41.02 
 
 
257 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.40781 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3193  hypothetical protein  38.29 
 
 
260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2571  hypothetical protein  39 
 
 
259 aa  159  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.352522  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1674  hypothetical protein  46.24 
 
 
237 aa  157  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1840  hypothetical protein  38.85 
 
 
260 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0085031 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1335  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  36.47 
 
 
263 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3212  hypothetical protein  42.93 
 
 
256 aa  122  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0365  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  41.48 
 
 
183 aa  108  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0207321  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1735  hypothetical protein  33.47 
 
 
254 aa  105  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.9552  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4931  hypothetical protein  40.15 
 
 
288 aa  102  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154084  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4959  hypothetical protein  38.67 
 
 
294 aa  99  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.096287  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1950  hypothetical protein  34.31 
 
 
440 aa  98.6  8e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.309179 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0815  hypothetical protein  41.41 
 
 
435 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.872238  normal  0.105867 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0849  hypothetical protein  36.25 
 
 
399 aa  95.5  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00517849 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0889  hypothetical protein  36.25 
 
 
399 aa  95.5  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.135602 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2377  hypothetical protein  36.99 
 
 
174 aa  93.6  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.388128 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0609  chemotaxis protein  38.1 
 
 
229 aa  86.7  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.147414 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0211  hypothetical protein  31.64 
 
 
253 aa  86.3  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.730473  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2836  hypothetical protein  33.15 
 
 
259 aa  78.6  0.00000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0884  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  35.71 
 
 
177 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156124  hitchhiker  0.002075 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2224  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  33.94 
 
 
197 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.659574  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0451  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  33.58 
 
 
178 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.149721  normal  0.211219 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0418  chemotaxis protein  33.58 
 
 
178 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.499236  normal  0.280148 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0488  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  34.59 
 
 
159 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal  0.531435 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0387  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  34.78 
 
 
196 aa  52  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0192  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  26.47 
 
 
186 aa  43.5  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00264382  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1621  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  32.71 
 
 
248 aa  42  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>