More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0290 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0290  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  100 
 
 
206 aa  399  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.713083  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3814  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  54.04 
 
 
210 aa  198  3.9999999999999996e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0399  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  50.25 
 
 
200 aa  184  8e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103709 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1373  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  49.5 
 
 
200 aa  181  6e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.55479  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1840  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  48.74 
 
 
200 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000421483  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0797  hypothetical protein  46.46 
 
 
202 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.340002  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1334  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  44.95 
 
 
202 aa  171  5.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0552137  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0936  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  47.24 
 
 
202 aa  169  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000278236 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3310  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  47.24 
 
 
202 aa  170  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2947  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  47.74 
 
 
197 aa  162  3e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3095  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  47.03 
 
 
200 aa  159  4e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.103088  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4825  MarC membrane protein  41.58 
 
 
198 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.495877 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4700  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  41.58 
 
 
198 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.548338  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3029  hypothetical protein  42.64 
 
 
194 aa  150  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.415744  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4615  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  41.5 
 
 
198 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.446372 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4878  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  41.58 
 
 
198 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0610  multiple antibiotic resistance (MarC)-like proteins  40.59 
 
 
198 aa  150  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4409  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  39.3 
 
 
198 aa  149  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4869  membrane protein, MarC family  38.81 
 
 
198 aa  148  6e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0705  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  39.22 
 
 
198 aa  145  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.561247  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5577  hypothetical protein  40.8 
 
 
197 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64240  MarC family protein  40.8 
 
 
197 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0206769  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1066  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  40.2 
 
 
201 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0142047  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1463  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  39.06 
 
 
200 aa  137  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.894258  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0953  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  33.17 
 
 
207 aa  114  8.999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.838216  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2045  hypothetical protein  32.67 
 
 
207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00255531  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1961  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.62 
 
 
213 aa  108  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0417  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.32 
 
 
202 aa  104  7e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1233  hypothetical protein  30.65 
 
 
208 aa  101  7e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2011  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.96 
 
 
226 aa  101  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2196  hypothetical protein  31.82 
 
 
214 aa  101  8e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2036  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.96 
 
 
226 aa  101  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0819991  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0635  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  35.86 
 
 
201 aa  100  1e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.586575 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0603  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  35.86 
 
 
201 aa  100  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.708242  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2949  hypothetical protein  33.33 
 
 
207 aa  98.6  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.514078  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1125  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31 
 
 
207 aa  98.6  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0974003 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2071  hypothetical protein  30.15 
 
 
214 aa  98.6  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0381177  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1962  hypothetical protein  30.15 
 
 
214 aa  98.6  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2164  hypothetical protein  30.69 
 
 
214 aa  98.2  7e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.033055  normal  0.026113 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1410  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.25 
 
 
231 aa  98.2  9e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2623  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  36.32 
 
 
217 aa  96.7  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1818  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  34.01 
 
 
205 aa  96.3  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2943  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.1 
 
 
205 aa  96.3  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.434605 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3226  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.54 
 
 
207 aa  95.5  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0906  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.99 
 
 
203 aa  95.5  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.201578  normal  0.0510602 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2709  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.79 
 
 
217 aa  94.4  9e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2303  hypothetical protein  30.35 
 
 
215 aa  94  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.45168  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2711  MarC membrane protein  29.33 
 
 
206 aa  94  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3690  hypothetical protein  29.33 
 
 
206 aa  94  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.984937  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2896  multidrug ABC transporter  30.61 
 
 
206 aa  94.4  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3663  MarC membrane protein  29.33 
 
 
206 aa  94  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2990  hypothetical protein  29.33 
 
 
206 aa  94  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.792349  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3242  MarC membrane protein  29.33 
 
 
206 aa  94  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1540  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.61 
 
 
206 aa  94.4  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29956  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2804  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.79 
 
 
217 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0569832  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1791  MarC membrane protein  29.33 
 
 
206 aa  94  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3721  MarC membrane protein  29.33 
 
 
206 aa  94  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596949  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2762  MarC membrane protein  29.33 
 
 
206 aa  94  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2703  hypothetical protein  31.34 
 
 
214 aa  93.6  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000872945  hitchhiker  0.000692167 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2756  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.24 
 
 
206 aa  92.8  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1199  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.57 
 
 
217 aa  92.8  3e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1694  hypothetical protein  30.35 
 
 
210 aa  92.8  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0657108 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2242  hypothetical protein  29.76 
 
 
212 aa  92.4  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.177472  normal  0.0116098 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0374  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.63 
 
 
214 aa  92.4  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.774303 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0331  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.36 
 
 
206 aa  92  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1910  hypothetical protein  29.8 
 
 
207 aa  92  6e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000443138  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2879  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.54 
 
 
207 aa  91.7  7e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0513768 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1880  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.03 
 
 
209 aa  91.7  7e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0187  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.96 
 
 
213 aa  91.3  8e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0346  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  27.5 
 
 
206 aa  91.3  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383588  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3526  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  27.36 
 
 
206 aa  90.9  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303666  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1278  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.5 
 
 
212 aa  90.5  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0407  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.36 
 
 
206 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.190902 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1684  hypothetical protein  28.86 
 
 
210 aa  90.9  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.197685  normal  0.181239 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0355  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.5 
 
 
206 aa  90.9  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.458882 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1789  hypothetical protein  28.86 
 
 
210 aa  90.9  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153384  normal  0.0804929 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2385  hypothetical protein  31.43 
 
 
209 aa  90.5  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0520514  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0401  MarC family multiple antibiotic resistance protein  28.71 
 
 
206 aa  90.1  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1911  hypothetical protein  28.29 
 
 
213 aa  90.1  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0139262  unclonable  0.00000197593 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1759  hypothetical protein  29.29 
 
 
210 aa  90.5  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0131249  normal  0.465228 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1812  hypothetical protein  29.8 
 
 
210 aa  89.7  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0272  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.62 
 
 
214 aa  89.7  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0587  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.58 
 
 
235 aa  89.4  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0123495 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1844  hypothetical protein  30.2 
 
 
207 aa  89.4  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.678437  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1323  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.28 
 
 
204 aa  89  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.199618 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2137  hypothetical protein  29.8 
 
 
210 aa  89  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2476  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.67 
 
 
242 aa  89  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2143  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.73 
 
 
214 aa  89.4  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2679  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  26.87 
 
 
206 aa  89.4  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356849  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0428  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  26.87 
 
 
206 aa  89.4  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1348  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.5 
 
 
208 aa  89  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.160191 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0955  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  35.57 
 
 
205 aa  89  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3108  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  28.43 
 
 
207 aa  88.6  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3913  putative dITP- and XTP- hydrolase  29.59 
 
 
197 aa  88.2  7e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3347  multiple drug resistance protein MarC  29.84 
 
 
217 aa  88.6  7e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.123982 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0280  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.59 
 
 
197 aa  88.2  8e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03239  hypothetical protein  29.59 
 
 
197 aa  88.2  8e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.705152  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3716  putative dITP- and XTP- hydrolase  29.59 
 
 
197 aa  88.2  8e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4746  putative dITP- and XTP- hydrolase  29.59 
 
 
197 aa  88.2  8e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.886657 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0278  putative dITP- and XTP- hydrolase  29.59 
 
 
197 aa  88.2  8e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>