More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3540 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_3613  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
273 aa  558  1e-158  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.263625  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3545  enoyl-CoA hydratase/isomerase  99.63 
 
 
273 aa  557  1e-158  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.86718  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3540  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
273 aa  558  1e-158  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37784  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  91.01 
 
 
271 aa  486  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4157  enoyl-CoA hydratase/isomerase  76.84 
 
 
275 aa  451  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.70127  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4569  enoyl-CoA hydratase/isomerase  68.91 
 
 
277 aa  357  1.9999999999999998e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572506  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6258  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.54 
 
 
265 aa  246  3e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.434452  normal  0.442264 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6335  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.55 
 
 
266 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  35.86 
 
 
257 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  32.27 
 
 
257 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  32.27 
 
 
257 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  32.27 
 
 
257 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4034  carnitinyl-CoA dehydratase  36.15 
 
 
261 aa  123  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3355  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.85 
 
 
797 aa  122  6e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0866397  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0038  carnitinyl-CoA dehydratase  33.46 
 
 
261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1825  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.59 
 
 
261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0326098  normal  0.27038 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1036  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.47 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3225  carnitinyl-CoA dehydratase  35.69 
 
 
261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0077  carnitinyl-CoA dehydratase  34.57 
 
 
261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0076  carnitinyl-CoA dehydratase  34.57 
 
 
261 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0040  carnitinyl-CoA dehydratase  33.46 
 
 
261 aa  120  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0266  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
265 aa  119  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0235599 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 
259 aa  119  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00040  carnitinyl-CoA dehydratase  33.46 
 
 
297 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3563  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 
261 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0074  carnitinyl-CoA dehydratase  34.2 
 
 
261 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3619  carnitinyl-CoA dehydratase  33.46 
 
 
261 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.291673 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00039  hypothetical protein  33.46 
 
 
297 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0040  carnitinyl-CoA dehydratase  33.46 
 
 
297 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0037  carnitinyl-CoA dehydratase  33.46 
 
 
261 aa  119  6e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0078  carnitinyl-CoA dehydratase  34.2 
 
 
261 aa  118  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0074  carnitinyl-CoA dehydratase  34.2 
 
 
261 aa  118  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.86 
 
 
261 aa  116  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.4 
 
 
258 aa  116  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  29.69 
 
 
260 aa  116  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1865  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 
259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0130428  normal  0.177822 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  29.69 
 
 
260 aa  115  6e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2195  short chain enoyl-CoA hydratase  29.84 
 
 
257 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000647858  hitchhiker  0.00875803 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.19 
 
 
257 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509119  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06235  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G03410)  36.68 
 
 
240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0989568  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.47 
 
 
259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  29.32 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2662  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.47 
 
 
259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  29.55 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1795  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.14 
 
 
256 aa  113  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2115  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.03 
 
 
254 aa  113  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1480  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.43 
 
 
271 aa  113  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2187  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.47 
 
 
266 aa  112  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000608326  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  30 
 
 
257 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3602  enoyl-CoA hydratase  32.05 
 
 
259 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1962  enoyl-CoA hydratase  31.5 
 
 
259 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2921  enoyl-CoA hydratase  30.5 
 
 
259 aa  112  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253673  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1806  enoyl-CoA hydratase  30.83 
 
 
262 aa  112  6e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.595083  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2953  1,4-dihydroxy-2-naphthoate synthase  30.65 
 
 
259 aa  112  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  30.83 
 
 
260 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1545  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.12 
 
 
258 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0932  hypothetical protein  30.96 
 
 
258 aa  112  9e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0901  hypothetical protein  30.96 
 
 
258 aa  112  9e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 
258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2213  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.6 
 
 
257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0591948  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0351  naphthoate synthase  32.41 
 
 
274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.621273  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05916  enoyl-CoA hydratase (Eurofung)  32 
 
 
289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.295699  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.99 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.684552  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0717  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.62 
 
 
258 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1746  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.5 
 
 
270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82012  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.16 
 
 
259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0661339  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.27 
 
 
259 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  28.8 
 
 
259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1765  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.5 
 
 
270 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04650  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  32.34 
 
 
278 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2014  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.27 
 
 
259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162316  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1812  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.5 
 
 
270 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.578699 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.97 
 
 
269 aa  110  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2672  carnitinyl-CoA dehydratase  35 
 
 
261 aa  110  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.539378  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1743  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  30 
 
 
663 aa  110  3e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.987316  normal  0.330149 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1675  enoyl-CoA hydratase  31.76 
 
 
259 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.65 
 
 
267 aa  110  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.21 
 
 
265 aa  110  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.8 
 
 
266 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.64 
 
 
258 aa  109  5e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.08 
 
 
259 aa  109  6e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203643  normal  0.505075 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4588  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.83 
 
 
268 aa  109  6e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.61629  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.85 
 
 
260 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.23 
 
 
261 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.409112 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  32.26 
 
 
257 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02840  short chain enoyl-CoA hydratase  29.3 
 
 
265 aa  108  9.000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.480651  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  29.05 
 
 
262 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4155  short chain enoyl-CoA hydratase  31.58 
 
 
249 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  30 
 
 
259 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1794  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.58 
 
 
270 aa  108  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.836656 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2206  enoyl-CoA hydratase  32.82 
 
 
263 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.196867 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4309  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.58 
 
 
249 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184062  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3107  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  31.3 
 
 
657 aa  108  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.89 
 
 
269 aa  108  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4079  short chain enoyl-CoA hydratase  31.58 
 
 
249 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.95 
 
 
259 aa  108  1e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  30.38 
 
 
260 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1462  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.34 
 
 
259 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0876  enoyl-CoA hydratase  30.77 
 
 
258 aa  106  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.44 
 
 
260 aa  106  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>