231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2671 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2671  cytochrome c assembly protein  100 
 
 		 274 aa  538  9.999999999999999e-153  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000343586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0521  cytochrome c assembly protein  38.94 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.312653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1017  cytochrome c assembly protein  34.88 
 
 		 270 aa  110  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235741  normal  0.587271 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1177  cytochrome c assembly protein  38.82 
 
 		 276 aa  107  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.262716  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4159  cytochrome c assembly protein  37.36 
 
 		 269 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.25819  normal  0.436154 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2133  cytochrome c assembly protein  39.46 
 
 		 275 aa  103  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.324766  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1149  cytochrome c assembly protein  38.38 
 
 		 264 aa  101  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1065  cytochrome c assembly protein  40.82 
 
 		 269 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1460  cytochrome c assembly protein  41.61 
 
 		 283 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.164878 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4261  cytochrome c assembly protein  41.61 
 
 		 283 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.99902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2262  cytochrome c assembly protein  43.15 
 
 		 282 aa  97.4  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.262308  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0641  cytochrome c assembly protein  36.36 
 
 		 279 aa  97.1  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0591  cytochrome c assembly protein  39.61 
 
 		 263 aa  96.3  5e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0445  cytochrome c assembly protein  30.43 
 
 		 289 aa  96.3  5e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3018  cytochrome c assembly protein  42.18 
 
 		 266 aa  95.9  6e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00647598  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0997  cytochrome c assembly protein  31.22 
 
 		 269 aa  95.9  7e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2810  hypothetical protein  38.1 
 
 		 303 aa  94  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.443588  normal  0.1588 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1150  cytochrome C assembly family protein  38.34 
 
 		 299 aa  94  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2937  cytochrome c assembly protein  37.91 
 
 		 266 aa  94  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.390266  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3627  cytochrome c assembly protein  37.91 
 
 		 266 aa  94  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.470506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1669  cytochrome c assembly protein  36.31 
 
 		 262 aa  94  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0504  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.77 
 
 		 271 aa  93.6  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000138241  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2312  cytochrome c assembly protein  38.18 
 
 		 268 aa  92.8  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002534  CcsA-related protein  35.81 
 
 		 264 aa  92  8e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0672  cytochrome c assembly protein  33.51 
 
 		 269 aa  92  9e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2513  cytochrome C assembly family protein  37.17 
 
 		 299 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3514  cytochrome C assembly family protein  37.17 
 
 		 299 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3269  cytochrome C assembly family protein  37.17 
 
 		 299 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0435  cytochrome C assembly family protein  37.17 
 
 		 299 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.75155  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1294  cytochrome C assembly family protein  37.17 
 
 		 290 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3478  cytochrome C assembly family protein  37.17 
 
 		 299 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.213677  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3516  cytochrome C assembly family protein  37.17 
 
 		 299 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3403  cytochrome c assembly protein  40.14 
 
 		 266 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.887838  normal  0.688779 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0843  cytochrome c assembly protein  40.69 
 
 		 269 aa  90.9  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1939  cytochrome c assembly protein  34.13 
 
 		 280 aa  90.1  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.664487 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3378  cytochrome c assembly protein  30.58 
 
 		 268 aa  89.4  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00167911  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0127  cytochrome c assembly protein  36.3 
 
 		 280 aa  89.4  6e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.496419  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0046  cytochrome c assembly protein  36.3 
 
 		 263 aa  89  7e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.975637  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01689  cytochrome c assembly protein  37.41 
 
 		 265 aa  89  8e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000413644  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0517  cytochrome c assembly protein  36.22 
 
 		 305 aa  88.6  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.416062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1501  cytochrome c assembly protein  39.38 
 
 		 224 aa  88.6  9e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0144  hypothetical protein  36.3 
 
 		 265 aa  88.2  1e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.772264  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3439  cytochrome c assembly protein  35.71 
 
 		 309 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00951271  hitchhiker  0.000487073 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0056  hypothetical protein  36.3 
 
 		 265 aa  88.2  1e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.046398  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1986  cytochrome c assembly protein  37.13 
 
 		 268 aa  88.2  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3093  cytochrome c assembly protein  34.34 
 
 		 312 aa  88.2  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.349808  normal  0.865657 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1708  hypothetical protein  37.59 
 
 		 268 aa  87.4  3e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.61279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0202  cytochrome c assembly protein  33.87 
 
 		 282 aa  87  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.848267  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0377  cytochrome c assembly protein  40.37 
 
 		 255 aa  86.7  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.015203 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1201  metal dependent phosphohydrolase  36.65 
 
 		 261 aa  86.3  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3219  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like protein  39.35 
 
 		 274 aa  86.3  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.368672 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3343  cytochrome c assembly protein  35.9 
 
 		 267 aa  85.9  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2642  cytochrome c assembly protein  36.53 
 
 		 314 aa  86.3  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02262  putative cytochrome C assembly protein  37.5 
 
 		 263 aa  85.9  7e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0961  cytochrome c assembly protein  36.81 
 
 		 270 aa  85.1  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1506  cytochrome c assembly protein  40.88 
 
 		 271 aa  85.1  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1371  hypothetical protein  41.83 
 
 		 266 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0220  cytochrome c assembly protein  31.87 
 
 		 282 aa  84.7  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.141329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  26.87 
 
 		 271 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0600631  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1471  hypothetical protein  35.07 
 
 		 270 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.250309  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3676  cytochrome c assembly protein  36.65 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.438967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15940  hypothetical protein  41.83 
 
 		 266 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.182655  normal  0.371616 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2946  cytochrome c assembly protein  33 
 
 		 315 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0561  cytochrome c assembly protein  38.99 
 
 		 297 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0577846  hitchhiker  0.000678361 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0109  cytochrome c assembly protein  38.99 
 
 		 297 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0591  cytochrome c assembly protein  38.99 
 
 		 297 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  27.23 
 
 		 271 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2372  transmembrane protein  42.25 
 
 		 262 aa  83.2  0.000000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.34584 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1280  cytochrome c assembly protein  34.6 
 
 		 284 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0519  cytochrome c assembly protein  38.36 
 
 		 297 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.328689  normal  0.474671 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0494  cytochrome c assembly protein  38.36 
 
 		 297 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2792  cytochrome c assembly protein  38.36 
 
 		 298 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.18001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3232  cytochrome c assembly protein  29.92 
 
 		 271 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00268584  normal  0.260264 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3772  cytochrome c assembly protein  36.09 
 
 		 255 aa  80.9  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0034021  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39590  Cytochrome c assembly-like protein  39.46 
 
 		 266 aa  80.5  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.208055  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1428  permease  35.46 
 
 		 265 aa  79.3  0.00000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.219034  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3369  cytochrome c assembly protein  33.33 
 
 		 263 aa  79.3  0.00000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0361  cytochrome c assembly protein  25.44 
 
 		 271 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000960033  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3283  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  29.61 
 
 		 271 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3237  cytochrome c assembly protein  31.25 
 
 		 279 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.30961  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0093  hypothetical protein  36.49 
 
 		 267 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000700922  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0869  cytochrome c assembly protein  39.24 
 
 		 265 aa  77.8  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03482  hypothetical protein  35.14 
 
 		 264 aa  77  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0647  inner membrane protein, putative cytochrome c assembly protein  38.1 
 
 		 264 aa  77  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.650824  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1589  cytochrome c assembly protein  25.29 
 
 		 240 aa  75.5  0.0000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3065  cytochrome c biogenesis protein  32.61 
 
 		 278 aa  75.1  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253378  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1373  cytochrome c assembly protein  29.31 
 
 		 283 aa  73.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0756163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1113  cytochrome c assembly protein  35.62 
 
 		 266 aa  72.4  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3055  cytochrome c assembly protein  38.17 
 
 		 302 aa  72.4  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2645  cytochrome c assembly protein  38.17 
 
 		 302 aa  72.4  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3366  cytochrome c assembly protein  31.11 
 
 		 263 aa  72  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0757452  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0885  hypothetical protein  31.11 
 
 		 263 aa  72  0.000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.215466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3231  putative cytochrome C assembly protein  31.11 
 
 		 263 aa  72  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00112943  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1337  hypothetical protein  38.46 
 
 		 273 aa  72  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2862  cytochrome c assembly protein  34.93 
 
 		 264 aa  71.2  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2922  cytochrome c assembly protein  34.23 
 
 		 262 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1122  cytochrome c assembly protein  34.25 
 
 		 264 aa  68.9  0.00000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0765442  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1063  cytochrome c assembly protein  35.81 
 
 		 288 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000502411  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2763  putative cytochrome C assembly protein  35.81 
 
 		 288 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0166622  normal  0.110636 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1072  cytochrome c assembly protein  35.81 
 
 		 288 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00835827  normal  0.0177644 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>