26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1653 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1653  hypothetical protein  100 
 
 		 229 aa  474  1e-133  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000117481  normal  0.338305 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1652  hypothetical protein  36.27 
 
 		 229 aa  135  5e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000202399  normal  0.336802 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0517  hypothetical protein  34.72 
 
 		 231 aa  126  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3022  hypothetical protein  28.18 
 
 		 276 aa  75.1  0.0000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3455  hypothetical protein  25.13 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1336  hypothetical protein  24.61 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0365  hypothetical protein  24.68 
 
 		 242 aa  62.4  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0656462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3903  hypothetical protein  25 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00027123  normal  0.0133719 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1325  transport-associated protein  26.29 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0768925  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3531  hypothetical protein  23.62 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0110536  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0357  hypothetical protein  23.04 
 
 		 234 aa  52.8  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000646753 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0377  hypothetical protein  23.79 
 
 		 234 aa  52.4  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2809  transport-associated protein  26.9 
 
 		 273 aa  49.3  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00612028  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0672  hypothetical protein  24.04 
 
 		 236 aa  47.8  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0471907  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1486  hypothetical protein  25 
 
 		 234 aa  48.1  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1705  hypothetical protein  21.78 
 
 		 209 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.298807 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20820  predicted membrane protein  25 
 
 		 428 aa  46.6  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.716498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0106  cytidylate kinase  25.41 
 
 		 201 aa  47  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0661  transport-associated  24.06 
 
 		 275 aa  46.2  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2837  hypothetical protein  21.54 
 
 		 236 aa  45.8  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000106697  hitchhiker  2.88656e-20 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0288  hypothetical protein  21.99 
 
 		 252 aa  45.8  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.511661  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1957  membrane protein-like protein  20.61 
 
 		 473 aa  43.9  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.217761  hitchhiker  0.00755155 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2398  response regulator receiver protein  22.34 
 
 		 271 aa  43.5  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2391  hypothetical protein  21.03 
 
 		 240 aa  43.1  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0922  hypothetical protein  22.17 
 
 		 209 aa  42.4  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.791137 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0901  putative cytidylate kinase, putative  23.32 
 
 		 214 aa  42.4  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00118892  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>