More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0527 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0527  lipoyl synthase  100 
 
 
296 aa  613  9.999999999999999e-175  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.550501 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1281  lipoyl synthase  55.8 
 
 
311 aa  333  2e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2857  lipoyl synthase  55.2 
 
 
319 aa  331  1e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3136  lipoyl synthase  55.64 
 
 
321 aa  331  1e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.732613 
 
 
-
 
NC_002978  WD0392  lipoyl synthase  54.35 
 
 
287 aa  330  2e-89  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2888  lipoyl synthase  54.84 
 
 
319 aa  328  8e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2584  lipoyl synthase  54.84 
 
 
319 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510234 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2572  lipoyl synthase  55.2 
 
 
319 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.085231  normal  0.78924 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3949  lipoyl synthase  55.8 
 
 
319 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.331367 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1439  lipoyl synthase  54.91 
 
 
319 aa  325  6e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.115253  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1921  lipoyl synthase  54.71 
 
 
310 aa  325  6e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0537683  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0490  lipoyl synthase  53.99 
 
 
297 aa  323  2e-87  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5924  lipoyl synthase  56.78 
 
 
320 aa  323  2e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.848601  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1624  lipoyl synthase  54.91 
 
 
322 aa  323  3e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686327  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0537  lipoyl synthase  53.26 
 
 
299 aa  322  5e-87  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.587235  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1831  lipoyl synthase  54.18 
 
 
319 aa  321  8e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377575  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0554  lipoyl synthase  55.43 
 
 
373 aa  321  9.000000000000001e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.86018  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2824  lipoyl synthase  56.2 
 
 
320 aa  320  9.999999999999999e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6533  lipoyl synthase  56.41 
 
 
320 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0432658  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1436  lipoyl synthase  54.18 
 
 
325 aa  320  1.9999999999999998e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00922055  hitchhiker  0.00000261266 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2065  lipoyl synthase  53.45 
 
 
321 aa  319  3e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1083  lipoyl synthase  54.91 
 
 
323 aa  319  3e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0241  lipoyl synthase  53.68 
 
 
312 aa  318  5e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.395057  normal  0.45798 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0538  lipoyl synthase  54.18 
 
 
317 aa  318  5e-86  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0149329  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0599  lipoyl synthase  55.07 
 
 
373 aa  318  7.999999999999999e-86  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0992056  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1509  lipoyl synthase  56 
 
 
325 aa  318  1e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.499062  normal  0.4257 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1376  lipoyl synthase  55.43 
 
 
315 aa  317  1e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1124  lipoyl synthase  53.09 
 
 
322 aa  317  2e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2123  lipoyl synthase  55.27 
 
 
323 aa  317  2e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0274  lipoyl synthase  56.62 
 
 
311 aa  316  2e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.99023 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2176  lipoyl synthase  54.77 
 
 
327 aa  317  2e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.349481  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04289  lipoyl synthase  54.35 
 
 
327 aa  316  3e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1611  lipoyl synthase  54.55 
 
 
323 aa  315  5e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  52.07 
 
 
318 aa  315  8e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1804  lipoyl synthase  54.55 
 
 
323 aa  315  9e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00544633  hitchhiker  0.00579604 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1583  lipoyl synthase  54.35 
 
 
316 aa  314  9.999999999999999e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.681458  normal  0.0313019 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3897  lipoyl synthase  54.55 
 
 
317 aa  314  9.999999999999999e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal  0.576703 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2501  lipoyl synthase  54.91 
 
 
325 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.698153  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  53.62 
 
 
321 aa  313  9.999999999999999e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1082  lipoyl synthase  52.73 
 
 
322 aa  314  9.999999999999999e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.721061  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0523  lipoyl synthase  54.91 
 
 
325 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1041  lipoyl synthase  55.8 
 
 
320 aa  312  3.9999999999999997e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.456596  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1877  lipoyl synthase  56.73 
 
 
314 aa  312  4.999999999999999e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.329271  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01649  lipoyl synthase  52.35 
 
 
320 aa  312  4.999999999999999e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00769873  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1252  lipoyl synthase  54.26 
 
 
328 aa  311  5.999999999999999e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2629  lipoyl synthase  54.91 
 
 
324 aa  311  6.999999999999999e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2923  lipoyl synthase  54.91 
 
 
334 aa  311  7.999999999999999e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.790522  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3027  lipoyl synthase  54.55 
 
 
339 aa  311  1e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.282591  normal  0.443203 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2783  lipoyl synthase  54.71 
 
 
320 aa  310  1e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1425  lipoyl synthase  54.71 
 
 
320 aa  310  1e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0392901 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2799  lipoyl synthase  54.55 
 
 
339 aa  310  2e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3442  lipoyl synthase  53.43 
 
 
336 aa  309  2.9999999999999997e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.725492  normal  0.582796 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0293  lipoyl synthase  53.6 
 
 
326 aa  309  4e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0298  lipoyl synthase  53.6 
 
 
326 aa  309  4e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132518 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0165  lipoyl synthase  52.92 
 
 
329 aa  309  4e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0827434  hitchhiker  0.00380091 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6230  lipoyl synthase  53.74 
 
 
330 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2226  lipoyl synthase  54.68 
 
 
315 aa  308  6.999999999999999e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0487133  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  53.71 
 
 
303 aa  308  8e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  53.71 
 
 
303 aa  308  8e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1639  lipoyl synthase  53.96 
 
 
337 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00216295  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2751  lipoyl synthase  53.09 
 
 
351 aa  307  2.0000000000000002e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.0114913 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3934  lipoyl synthase  53.38 
 
 
338 aa  306  3e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.521126  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1371  lipoyl synthase  52.9 
 
 
330 aa  306  3e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.113855  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0346  lipoyl synthase  54.91 
 
 
309 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0315  lipoyl synthase  50.52 
 
 
314 aa  306  4.0000000000000004e-82  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2799  lipoyl synthase  53.38 
 
 
330 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0788526  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2937  lipoyl synthase  53.38 
 
 
330 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4963  lipoyl synthase  51.06 
 
 
340 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0386  lipoyl synthase  53.38 
 
 
329 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86797  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0417  lipoyl synthase  53.38 
 
 
330 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.297091  normal  0.190566 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4881  lipoyl synthase  52.16 
 
 
327 aa  303  3.0000000000000004e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0362  lipoyl synthase  52.88 
 
 
332 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.297178 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0052  lipoyl synthase  53.02 
 
 
329 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0218  lipoyl synthase  53.02 
 
 
329 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1375  lipoyl synthase  53.02 
 
 
329 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3186  lipoyl synthase  53.02 
 
 
329 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1553  lipoyl synthase  50.9 
 
 
320 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.108222  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0470  lipoyl synthase  52.71 
 
 
332 aa  302  5.000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0410  lipoyl synthase  52.16 
 
 
326 aa  301  6.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0628  lipoyl synthase  53.02 
 
 
329 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.931315  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0464  lipoyl synthase  53.02 
 
 
329 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.104715  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0313  lipoyl synthase  51.8 
 
 
357 aa  301  7.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108375  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0444  lipoyl synthase  53.02 
 
 
329 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2272  lipoyl synthase  52.67 
 
 
330 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2887  lipoyl synthase  52.67 
 
 
330 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0316  lipoyl synthase  52.71 
 
 
339 aa  301  9e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0479875  normal  0.0232399 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2897  lipoyl synthase  52.67 
 
 
330 aa  301  9e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0242  lipoyl synthase  51.26 
 
 
332 aa  301  9e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1598  lipoyl synthase  52.71 
 
 
318 aa  301  1e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0217  lipoyl synthase  53.05 
 
 
334 aa  301  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1086  lipoyl synthase  51.45 
 
 
321 aa  300  2e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0504  lipoyl synthase  52.46 
 
 
335 aa  299  4e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0591731 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0792  lipoyl synthase  51.81 
 
 
321 aa  298  6e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.351097  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0734  lipoyl synthase  51.81 
 
 
321 aa  298  6e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1709  lipoyl synthase  51.62 
 
 
328 aa  298  6e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0748  lipoyl synthase  51.81 
 
 
321 aa  298  6e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.392718  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0688  lipoyl synthase  51.81 
 
 
321 aa  298  6e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0674  lipoyl synthase  51.81 
 
 
321 aa  298  6e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00338135  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4212  lipoyl synthase  52.31 
 
 
334 aa  298  7e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.740031 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0610  lipoyl synthase  52.54 
 
 
283 aa  298  9e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>