More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1064 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1064  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 
112 aa  214  2.9999999999999998e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0883  nitrogen regulatory protein P-II  91.07 
 
 
112 aa  200  5e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.386299  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0884  nitrogen regulatory protein P-II  81.25 
 
 
112 aa  179  1e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.275382  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1611  nitrogen regulatory protein P-II  80.36 
 
 
112 aa  176  8e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1063  nitrogen regulatory protein P-II  79.46 
 
 
112 aa  174  5e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.403176  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1061  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 
112 aa  165  2e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.102544  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1613  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  163  8e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1079  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  160  5.0000000000000005e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.908178  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0881  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
112 aa  158  3e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.24631  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1066  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
112 aa  156  9e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.775357  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0886  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  152  1e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.812939  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1610  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  152  1e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1081  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 
113 aa  147  4e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.630739  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1480  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 
112 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1481  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 
112 aa  133  9e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  118  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1695  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  119  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.596367 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0014  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0394648 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4404  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
117 aa  116  9e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795902  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4381  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
117 aa  116  9e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.647425  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_942  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1124  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  114  5e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0770383  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  114  5e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1300  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  113  7.999999999999999e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00561712  normal  0.201127 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1481  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  113  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.19711 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1685  nitrogen regulatory protein P-II  56.31 
 
 
107 aa  112  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.483809  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3243  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  112  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.669306  normal  0.422234 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0552  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524059  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  111  3e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2783  nitrogen regulatory protein P-II  50.46 
 
 
109 aa  110  5e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  110  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000414961 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  110  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000004264  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1351  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  110  6e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000771293  hitchhiker  0.0000000000923382 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  110  7.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4461  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  110  8.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188449  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1065  nitrogen regulatory protein P-II  55.56 
 
 
112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3917  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  110  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1885  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  55.36 
 
 
112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.614675  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0953  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4574  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0564  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000717962  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0146  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220304  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2237  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.694402  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4832  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03014  GlnB  50.89 
 
 
112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000337232  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1779  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.903734 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0485  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.65619  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1359  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
121 aa  108  3e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.202328  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  108  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1507  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  108  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  108  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  108  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0195  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  108  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.863029 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1830  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
115 aa  108  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.579927  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1110  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  108  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000614062  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0193  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  108  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1206  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1063  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.710847  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0935  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000154174  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  107  5e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2085  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  52.68 
 
 
112 aa  107  5e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0428  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  107  5e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0085  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  107  5e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2376  nitrogen regulatory protein PII  53.57 
 
 
112 aa  107  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0285666  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  107  6e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0935  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  107  6e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0360863  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0472  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0800  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  107  7.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1388  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  107  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258506  normal  0.939142 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1345  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.934318 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3223  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  106  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.808026  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2709  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000195324 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1737  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595912  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1133  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  106  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2525  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 
112 aa  106  9.000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.720129  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0148  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  106  9.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1227  nitrogen regulatory protein P-II 1  50 
 
 
112 aa  106  9.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2550  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  106  9.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0188103  normal  0.0743791 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3267  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  106  9.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3519  nitrogen regulatory protein P-II 1  52.68 
 
 
112 aa  106  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0694  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  106  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.804518  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2310  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  51.79 
 
 
112 aa  106  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0255165  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0591  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  106  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1071  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  106  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1921  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1168  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0110  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  105  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0179377 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2945  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  106  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0214654  normal  0.391037 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3027  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  106  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2357  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  106  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1303  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  106  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.539571 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3124  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  106  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.473866  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0429  nitrogen regulatory protein P-II 1  51.79 
 
 
112 aa  106  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.398049  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1262  nitrogen regulatory protein P-II 1  50 
 
 
112 aa  105  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297918  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1069  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.607168  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2387  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.344208 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  105  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5130  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  105  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.179689  normal  0.884639 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>