174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1054 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1054  hypothetical protein  100 
 
 
99 aa  195  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0863  hypothetical protein  95.96 
 
 
99 aa  191  2e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.162032  hitchhiker  0.0095547 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1793  hypothetical protein  93.94 
 
 
99 aa  184  2e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0925  hypothetical protein  87.88 
 
 
99 aa  175  2e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0029  hypothetical protein  65.66 
 
 
100 aa  131  3e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.150772  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0746  protein of unknown function DUF59  35.16 
 
 
94 aa  65.5  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2569  hypothetical protein  32.22 
 
 
132 aa  59.7  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0448  hypothetical protein  38.67 
 
 
102 aa  59.7  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0433  hypothetical protein  38.67 
 
 
102 aa  59.7  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1551  protein of unknown function DUF59  38.67 
 
 
100 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2348  hypothetical protein  39.19 
 
 
120 aa  59.3  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.537169 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0721  protein of unknown function DUF59  34.62 
 
 
100 aa  58.2  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0641  hypothetical protein  41.1 
 
 
111 aa  57.4  0.00000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1749  hypothetical protein  38.89 
 
 
119 aa  57.4  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0711062  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0657  hypothetical protein  39.73 
 
 
111 aa  56.6  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2523  hypothetical protein  37.66 
 
 
120 aa  56.6  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0088034  normal  0.292683 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2441  hypothetical protein  38.89 
 
 
126 aa  56.6  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2102  FeS assembly SUF system protein  37.33 
 
 
126 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.120389 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0118  protein of unknown function DUF59  38.46 
 
 
99 aa  56.6  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1895  FeS assembly SUF system protein  38.36 
 
 
126 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166707  hitchhiker  0.00465404 
 
 
-
 
NC_004310  BR0935  hypothetical protein  37.84 
 
 
139 aa  55.8  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.861252  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0929  FeS assembly SUF system protein  37.84 
 
 
139 aa  55.8  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2251  FeS assembly SUF system protein  36.49 
 
 
139 aa  55.1  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.908211  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1459  hypothetical protein  38.03 
 
 
106 aa  54.7  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226744  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0972  hypothetical protein  40 
 
 
102 aa  54.3  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.530657  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0991  hypothetical protein  40 
 
 
102 aa  54.3  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.110893  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0388  hypothetical protein  32.95 
 
 
157 aa  53.9  0.0000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.793437 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0141  hypothetical protein  40.54 
 
 
124 aa  53.9  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00350528  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1777  hypothetical protein  36.49 
 
 
131 aa  53.9  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.716432  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4378  hypothetical protein  32.86 
 
 
105 aa  53.9  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0562  hypothetical protein  38.67 
 
 
102 aa  53.9  0.0000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2594  FeS assembly SUF system protein  37.5 
 
 
119 aa  52.8  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.426933  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0766  hypothetical protein  41.43 
 
 
120 aa  53.5  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.36517  normal  0.611735 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2422  protein of unknown function DUF59  40.54 
 
 
112 aa  53.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1464  FeS assembly SUF system protein  35.14 
 
 
126 aa  53.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26453  normal  0.0454458 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0127  hypothetical protein  32.61 
 
 
131 aa  53.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3981  FeS assembly SUF system protein  36.99 
 
 
127 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.954909 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4349  FeS assembly SUF system protein  36.99 
 
 
127 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0896  hypothetical protein  37.33 
 
 
110 aa  52.4  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000151915  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2291  protein of unknown function DUF59  32.39 
 
 
109 aa  52.4  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0318532  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4465  FeS assembly SUF system protein  32.95 
 
 
124 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.596089 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0255  hypothetical protein  34.25 
 
 
108 aa  51.6  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.45321  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0231  hypothetical protein  34.25 
 
 
108 aa  51.6  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1281  hypothetical protein  39.19 
 
 
118 aa  51.2  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.654013 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1674  hypothetical protein  36 
 
 
101 aa  50.8  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0498751  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6280  hypothetical protein  31.94 
 
 
97 aa  51.2  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0596965  normal  0.273868 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0351  protein of unknown function DUF59  33.77 
 
 
163 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0339  protein of unknown function DUF59  33.77 
 
 
163 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0466  protein of unknown function DUF59  37.84 
 
 
100 aa  50.8  0.000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000420765  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5819  ATPase-like, ParA/MinD  33.77 
 
 
391 aa  50.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.294299  normal  0.0147747 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4070  protein of unknown function DUF59  34.12 
 
 
353 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3473  hypothetical protein  33.33 
 
 
135 aa  50.1  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.642924  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0699  FeS assembly SUF system protein  36.49 
 
 
127 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.777618  normal  0.0436318 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1949  hypothetical protein  36.11 
 
 
120 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2608  hypothetical protein  39.47 
 
 
196 aa  49.7  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0327  hypothetical protein  33.77 
 
 
162 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4461  FeS assembly SUF system protein  35.62 
 
 
127 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.148381 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1755  hypothetical protein  37.18 
 
 
101 aa  49.7  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000415321  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0600  hypothetical protein  36.11 
 
 
120 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.575149  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1951  hypothetical protein  37.5 
 
 
135 aa  50.1  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.655053  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4109  protein of unknown function DUF59  34.12 
 
 
353 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1665  protein of unknown function DUF59  36 
 
 
132 aa  48.9  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.670958  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5105  FeS assembly SUF system protein  36.49 
 
 
117 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0151148 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5844  FeS assembly SUF system protein  36.49 
 
 
123 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0896  hypothetical protein  35.71 
 
 
102 aa  48.9  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00569977  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0200  hypothetical protein  36.11 
 
 
160 aa  48.5  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1320  hypothetical protein  34.72 
 
 
138 aa  48.5  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0203207  normal  0.743383 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1833  protein of unknown function DUF59  38.04 
 
 
99 aa  48.5  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3055  protein of unknown function DUF59  35.8 
 
 
353 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.325814 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0345  hypothetical protein  34.29 
 
 
120 aa  47.8  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.206617  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2530  hypothetical protein  41.43 
 
 
105 aa  48.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4281  hypothetical protein  33.33 
 
 
112 aa  47.8  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5784  FeS assembly SUF system protein  34.25 
 
 
112 aa  47.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0794322  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37610  predicted protein  37.04 
 
 
462 aa  47.8  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00176951  normal  0.0190501 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0900  hypothetical protein  36.71 
 
 
108 aa  47.8  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2597  protein of unknown function DUF59  30.95 
 
 
356 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0491781 
 
 
-
 
NC_002950  PG1777  hypothetical protein  28.42 
 
 
105 aa  47  0.00008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0909  protein of unknown function DUF59  35.9 
 
 
99 aa  47  0.00008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0748991  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0960  hypothetical protein  39.58 
 
 
110 aa  47  0.00009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000488551  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0075  hypothetical protein  36.05 
 
 
370 aa  46.2  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1425  hypothetical protein  43.75 
 
 
113 aa  46.6  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00404545  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0711  hypothetical protein  31.08 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223396  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1590  chromosome partitioning ATPase  30.21 
 
 
347 aa  46.6  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01362  predicted metal-sulfur cluster enzyme  38.16 
 
 
177 aa  46.6  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.731864  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2989  hypothetical protein  34.25 
 
 
122 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0927837 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2460  hypothetical protein  34.25 
 
 
122 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0123184  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1805  hypothetical protein  31.71 
 
 
108 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.752163  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2392  protein of unknown function DUF59  34.72 
 
 
238 aa  46.6  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1447  hypothetical protein  43.75 
 
 
121 aa  46.6  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.399108  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2151  protein of unknown function DUF59  48 
 
 
107 aa  46.6  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1420  hypothetical protein  36 
 
 
101 aa  46.6  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.095066  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0601  putative metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  40 
 
 
197 aa  46.2  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0348  protein of unknown function DUF59  31.52 
 
 
96 aa  46.6  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000101094  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2027  FeS assembly SUF system protein  32.86 
 
 
113 aa  46.2  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1234  hypothetical protein  33.33 
 
 
370 aa  47  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1191  hypothetical protein  29.76 
 
 
103 aa  45.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.945975  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2676  ATPase-like, ParA/MinD  34.12 
 
 
365 aa  45.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0710053  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2643  hypothetical protein  30.23 
 
 
256 aa  46.2  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0544073  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0998  hypothetical protein  30.67 
 
 
108 aa  45.8  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.239725 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1220  serine O-acetyltransferase  32 
 
 
323 aa  45.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0992498 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>