277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_3028 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_3028  NifU domain-containing protein  100 
 
 
187 aa  384  1e-106  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0889  NifU domain-containing protein  59.68 
 
 
186 aa  232  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0368383  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3091  nitrogen-fixing NifU-like  57.75 
 
 
187 aa  231  6e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.758224  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0865  nitrogen-fixing NifU-like  57.75 
 
 
187 aa  225  2e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0779261 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2839  hypothetical protein  57.75 
 
 
187 aa  221  4e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0061746  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2214  nitrogen-fixing NifU  59.68 
 
 
186 aa  221  6e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.731458  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2279  NifU domain-containing protein  59.68 
 
 
186 aa  218  5e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.473385  normal  0.588083 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0019  scaffold protein Nfu/NifU  55.08 
 
 
189 aa  213  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.01661  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0531  NifU domain-containing protein  55.91 
 
 
184 aa  213  9.999999999999999e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241454  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4037  nitrogen-fixing NifU-like  57.07 
 
 
189 aa  208  3e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0024  Scaffold protein Nfu/NifU  53.68 
 
 
188 aa  204  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.419851 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3531  nitrogen-fixing NifU-like  52.66 
 
 
183 aa  204  7e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0153  scaffold protein Nfu/NifU  55.15 
 
 
190 aa  204  9e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0036  scaffold protein Nfu/NifU  53.4 
 
 
188 aa  203  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0881083  hitchhiker  0.0000181724 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0036  Scaffold protein Nfu/NifU  52.63 
 
 
188 aa  203  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.231277 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0430  hypothetical protein  53.97 
 
 
186 aa  202  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.255854  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3611  scaffold protein Nfu/NifU  57.14 
 
 
201 aa  202  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1170  NifU family protein  56.41 
 
 
192 aa  202  2e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.841091  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0134  NifU-related protein  54.4 
 
 
190 aa  197  5e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00825478  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0140  NifU-related protein  54.4 
 
 
190 aa  197  5e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0040  putative nifU protein  53.89 
 
 
189 aa  198  5e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15873  normal  0.567558 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3394  Scaffold protein Nfu/NifU  53.4 
 
 
188 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1823  scaffold protein Nfu/NifU  53.97 
 
 
186 aa  196  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.266684  normal  0.103304 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3198  scaffold protein Nfu/NifU  53.4 
 
 
188 aa  195  3e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.113842  normal  0.941743 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3522  Scaffold protein Nfu/NifU  53.4 
 
 
188 aa  195  3e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.128195  normal  0.0920185 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2071  nitrogen-fixing NifU-like protein  50.52 
 
 
190 aa  193  1e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0389413  normal  0.471165 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2900  Scaffold protein Nfu/NifU  53.61 
 
 
187 aa  192  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.25177 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4429  Scaffold protein Nfu/NifU  51.32 
 
 
187 aa  191  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.021918  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3394  scaffold protein Nfu/NifU  51.85 
 
 
187 aa  190  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.252706 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0247  nitrogen-fixing NifU-like  53.33 
 
 
188 aa  187  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0457  Scaffold protein Nfu/NifU  53.89 
 
 
188 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0463  nitrogen-fixing NifU-like  51.56 
 
 
188 aa  185  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0009  nitrogen-fixing NifU  52.2 
 
 
190 aa  185  4e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.964123  normal  0.198527 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30771  predicted protein  45.36 
 
 
206 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.777457  normal  0.560204 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0585  nitrogen-fixing NifU-like  53.04 
 
 
188 aa  181  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2095  Scaffold protein Nfu/NifU  51.85 
 
 
187 aa  179  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.724202  normal  0.959854 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2380  scaffold protein Nfu/NifU-like protein  48.42 
 
 
192 aa  180  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0016  nitrogen-fixing NifU-like  50.54 
 
 
191 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00443934  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0644  scaffold protein Nfu/NifU  53.16 
 
 
188 aa  177  8e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.728561 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1775  NifU domain-containing protein  53.23 
 
 
185 aa  177  8e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.126577  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0800  nitrogen-fixing NifU, C-terminal  51.06 
 
 
186 aa  173  9.999999999999999e-43  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0988  nitrogen-fixing NifU-like  46.11 
 
 
195 aa  174  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1075  NifU domain-containing protein  46.52 
 
 
191 aa  169  2e-41  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.152457  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00447  NifU-related protein (AFU_orthologue; AFUA_1G04680)  45.32 
 
 
326 aa  168  4e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.215741  normal  0.563754 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0817  NifU-like domain-containing protein  45.26 
 
 
180 aa  168  4e-41  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.946784  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0202  NifU domain-containing protein  46.81 
 
 
186 aa  165  2.9999999999999998e-40  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.419863  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1051  scaffold protein Nfu/NifU  50.53 
 
 
187 aa  161  6e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.906453  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01900  iron ion homeostasis-related protein, putative  44.68 
 
 
309 aa  160  1e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16693  predicted protein  41.88 
 
 
195 aa  152  2.9999999999999998e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0365  thioredoxin-related protein  43.78 
 
 
191 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.299726  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82838  predicted protein  40.21 
 
 
254 aa  147  1.0000000000000001e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0133189  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0722  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.57 
 
 
198 aa  140  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0513742 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2934  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.33 
 
 
183 aa  140  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0974289 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4882  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.47 
 
 
198 aa  140  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.436115  normal  0.113106 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01075  NifU-like domain protein  39.34 
 
 
305 aa  130  7.999999999999999e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76567  predicted protein  39.68 
 
 
242 aa  130  1.0000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000975228 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2479  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.23 
 
 
200 aa  127  9.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40084  normal  0.245689 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1676  NifU domain-containing protein  38.76 
 
 
299 aa  126  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.663631  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1955  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.12 
 
 
299 aa  117  7e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0701  nitrogen-fixing NifU-like  27.87 
 
 
186 aa  81.6  0.000000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1466  nitrogen-fixing NifU domain protein  51.39 
 
 
73 aa  74.7  0.0000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3402  nitrogen-fixing NifU-like  47.5 
 
 
80 aa  74.3  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.168954 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1865  nitrogen-fixing NifU-like  25.68 
 
 
186 aa  72.8  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03110  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.44 
 
 
74 aa  72.8  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1408  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.3 
 
 
73 aa  72.8  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.510061  normal  0.98694 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0723  NifU domain-containing protein  45.95 
 
 
76 aa  72  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.603746 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3484  nitrogen-fixing NifU domain protein  48.61 
 
 
74 aa  71.6  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000024465  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0962  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.44 
 
 
81 aa  70.9  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.626846  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2023  nitrogen-fixing NifU domain protein  46.84 
 
 
81 aa  69.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0333  NifU domain-containing protein  50 
 
 
74 aa  68.2  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000601792  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3614  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.24 
 
 
73 aa  68.2  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187737  normal  0.20097 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3080  nitrogen-fixing NifU-like  44.74 
 
 
74 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0450  putative NifU-like protein  43.9 
 
 
81 aa  67  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2067  NifU domain-containing protein  45.95 
 
 
73 aa  67.4  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000395477  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0889  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.19 
 
 
72 aa  67.8  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000213557  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2331  NifU-like protein  38.16 
 
 
103 aa  66.6  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2796  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.3 
 
 
73 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000131696  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3554  NifU domain-containing protein  41.77 
 
 
78 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1414  nitrogen-fixing NifU domain protein  48.65 
 
 
73 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.68572e-21 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0480  NifU-like domain-containing protein  45.33 
 
 
74 aa  65.5  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0148  nifU domain protein  41.77 
 
 
78 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5086  NifU domain-containing protein  41.77 
 
 
78 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4821  NifU domain-containing protein  41.77 
 
 
78 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4659  NifU domain-containing protein  41.77 
 
 
78 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4678  NifU domain-containing protein  41.77 
 
 
78 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5056  nifU domain protein  41.77 
 
 
78 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5186  NifU domain-containing protein  41.77 
 
 
78 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0260  NifU domain-containing protein  40 
 
 
74 aa  65.5  0.0000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5092  nifU domain protein  41.77 
 
 
78 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4771  NifU domain-containing protein  41.77 
 
 
78 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5094  nifU domain protein  41.77 
 
 
78 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0076  nitrogen-fixing NifU domain protein  50.75 
 
 
73 aa  64.7  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0522  NifU domain-containing protein  43.04 
 
 
80 aa  64.7  0.0000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3034  nitrogen-fixing NifU-like  45.71 
 
 
76 aa  64.7  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0414  NifU-like protein  42.68 
 
 
81 aa  64.7  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.212463  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1119  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.29 
 
 
79 aa  64.7  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04381  NifU-like protein  42.68 
 
 
81 aa  64.7  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.725479  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04691  NifU-like protein  42.68 
 
 
81 aa  64.7  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1148  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.29 
 
 
79 aa  64.7  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.52272 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0074  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.95 
 
 
87 aa  63.9  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>