31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2417 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2417  putative TolA  100 
 
 
271 aa  525  1e-148  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3513  putative TolA  27.27 
 
 
314 aa  89.4  7e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613542  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3172  TolA, TolA protein  27.65 
 
 
351 aa  71.2  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00152494  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2718  hypothetical protein  32.35 
 
 
350 aa  70.9  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.822326  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1811  putative TolA  34.96 
 
 
320 aa  69.7  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.33266  normal  0.207811 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1310  protein TolA  30.92 
 
 
327 aa  69.3  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4148  putative TolA  32.24 
 
 
325 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.347109  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6882  putative TonB protein  22.49 
 
 
336 aa  65.5  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.060115 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1217  TolA protein  26.09 
 
 
356 aa  62.4  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4788  hypothetical protein  29.34 
 
 
294 aa  53.9  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3057  putative TolA  24.22 
 
 
317 aa  53.5  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0784767  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2134  hypothetical protein  26.04 
 
 
270 aa  53.5  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2429  hypothetical protein  28.93 
 
 
287 aa  51.2  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.370619  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4752  putative TolA  25.4 
 
 
314 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1698  tolA protein  25.45 
 
 
356 aa  50.1  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2323  hypothetical protein  25.36 
 
 
414 aa  50.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0566369  normal  0.3392 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1640  tolA protein  25.45 
 
 
356 aa  50.1  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.639472  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0561  hypothetical protein  26.58 
 
 
416 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  37.5 
 
 
3409 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3497  outer membrane protein  21.67 
 
 
379 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.103237 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2628  putative signal peptide protein  25.23 
 
 
356 aa  45.8  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  32.67 
 
 
2449 aa  45.4  0.0008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4659  cell surface protein  39.78 
 
 
3472 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0403  hypothetical protein  31.65 
 
 
938 aa  44.7  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.879706  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4428  hypothetical protein  25.54 
 
 
270 aa  44.3  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.471865 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4640  cell surface anchor  39.78 
 
 
3471 aa  44.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  29.49 
 
 
1088 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2366  TonB domain-containing protein  29.81 
 
 
383 aa  43.1  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.858133 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5303  protein TolA  26.03 
 
 
458 aa  42.7  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.477296  normal  0.671035 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0921  TolA protein  25.76 
 
 
394 aa  42.7  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.214208 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  37.36 
 
 
3521 aa  42  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>