38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_09480 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_09480  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  100 
 
 
244 aa  455  1e-127  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1954  hypothetical protein  37.5 
 
 
247 aa  107  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2904  protein of unknown function DUF164  37.5 
 
 
253 aa  99.4  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0926675 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1497  protein of unknown function DUF164  34.02 
 
 
242 aa  95.5  6e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.551565  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3596  hypothetical protein  37.4 
 
 
245 aa  95.1  9e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000122587 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3356  hypothetical protein  37.2 
 
 
245 aa  92.8  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2312  hypothetical protein  40 
 
 
246 aa  90.9  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.30327 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6816  Zn-ribbon protein possibly nucleic acid-binding- like protein  34.68 
 
 
246 aa  90.5  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  0.0465772 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1674  protein of unknown function DUF164  35.54 
 
 
247 aa  90.9  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2084  protein of unknown function DUF164  35.08 
 
 
245 aa  88.6  9e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0876658  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1437  hypothetical protein  32.18 
 
 
247 aa  86.7  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.133563  normal  0.0750661 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2192  protein of unknown function DUF164  34.71 
 
 
245 aa  85.9  6e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000158316 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0901  hypothetical protein  35.68 
 
 
237 aa  83.2  0.000000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0250071  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07190  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  34.13 
 
 
245 aa  82  0.000000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274676  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5890  protein of unknown function DUF164  34.27 
 
 
255 aa  82  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.498958 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2443  hypothetical protein  30.99 
 
 
245 aa  80.5  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0111287  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2142  protein of unknown function DUF164  36.36 
 
 
244 aa  79.3  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.38876  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5075  hypothetical protein  39.84 
 
 
247 aa  77.4  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409748  normal  0.0143061 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4816  hypothetical protein  33.2 
 
 
245 aa  75.9  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0246614  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1829  hypothetical protein  33.33 
 
 
246 aa  75.1  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.14591  normal  0.0297669 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3619  hypothetical protein  36.67 
 
 
245 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.392544  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2891  hypothetical protein  32.28 
 
 
245 aa  72  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.340776  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3461  protein of unknown function DUF164  36.47 
 
 
246 aa  70.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3275  protein of unknown function DUF164  35.39 
 
 
242 aa  69.3  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000167925  hitchhiker  0.000754758 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3335  protein of unknown function DUF164  35.77 
 
 
247 aa  68.2  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0424877  normal  0.21583 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0880  protein of unknown function DUF164  32.53 
 
 
245 aa  68.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14950  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  30.2 
 
 
249 aa  63.9  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3095  protein of unknown function DUF164  37.17 
 
 
245 aa  63.2  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0336723  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2014  hypothetical protein  33.73 
 
 
234 aa  61.6  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0138572  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3354  hypothetical protein  32 
 
 
245 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3343  hypothetical protein  32 
 
 
245 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3405  hypothetical protein  32 
 
 
245 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.146705 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2711  protein of unknown function DUF164  28.8 
 
 
246 aa  58.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.176281  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12258  hypothetical protein  31.71 
 
 
245 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.779709  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0025  protein of unknown function DUF164  27.73 
 
 
240 aa  47.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06960  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  33.33 
 
 
240 aa  46.2  0.0005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0133584  normal  0.446432 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0064  hypothetical protein  25.71 
 
 
245 aa  43.5  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1350  protein of unknown function DUF164  32.65 
 
 
239 aa  43.5  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000260914  normal  0.479391 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>