More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1501 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1501  hypothetical protein  100 
 
 		 398 aa  791    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.226157 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  43.32 
 
 		 384 aa  331  1e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0406  glutaredoxin  45.43 
 
 		 383 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0240048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3049  glutaredoxin  42.82 
 
 		 391 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0169  glutaredoxin  40.15 
 
 		 402 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3218  glutaredoxin  32.76 
 
 		 395 aa  209  9e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_002950  PG0619  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  34.48 
 
 		 515 aa  192  9e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.633675 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21210  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  32.84 
 
 		 523 aa  189  5.999999999999999e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0675992  normal  0.523116 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  36.89 
 
 		 304 aa  188  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0211  thioredoxin reductase  37.34 
 
 		 343 aa  187  3e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1834  alkyl hydroperoxide reductase, subunit F  34.04 
 
 		 510 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0190333  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03190  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  31.64 
 
 		 560 aa  185  1.0000000000000001e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1964  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.25 
 
 		 509 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_483  thioredoxin reductase  36.89 
 
 		 306 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0542  thioredoxin-disulfide reductase  36.25 
 
 		 306 aa  184  3e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0439  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  35.42 
 
 		 507 aa  183  6e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00965821  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0058  thioredoxin reductase  36.98 
 
 		 317 aa  183  6e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992397  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0428  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  35.42 
 
 		 507 aa  183  6e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.273089  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01775  probable alkyl hydroperoxide reductase subunit F  32.75 
 
 		 529 aa  182  7e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00892  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  38.14 
 
 		 321 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2755  thioredoxin reductase  38.14 
 
 		 321 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000254011  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1050  thioredoxin reductase  38.14 
 
 		 321 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000235297  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00899  hypothetical protein  38.14 
 
 		 321 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0962  thioredoxin reductase  38.14 
 
 		 321 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000099736  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2708  thioredoxin reductase  38.14 
 
 		 321 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000108143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0992  thioredoxin reductase  38.14 
 
 		 321 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000016798  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0058  thioredoxin reductase  36.66 
 
 		 317 aa  182  9.000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0360012  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1754  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.02 
 
 		 547 aa  182  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0325052  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3691  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.62 
 
 		 326 aa  181  2e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0649931  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0709  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.91 
 
 		 314 aa  181  2e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2441  thioredoxin reductase  37.82 
 
 		 321 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000126981  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1512  thioredoxin reductase  37.82 
 
 		 309 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000715153  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3729  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  34.54 
 
 		 520 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2233  thioredoxin reductase  37.82 
 
 		 321 aa  180  4e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000186252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0047  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  34.23 
 
 		 512 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1023  thioredoxin reductase  36.91 
 
 		 322 aa  180  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00170984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0963  thioredoxin reductase  36.91 
 
 		 322 aa  180  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000679645  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1057  thioredoxin reductase  36.91 
 
 		 322 aa  180  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00951777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1072  thioredoxin reductase  36.91 
 
 		 322 aa  179  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00976208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3926  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  34.06 
 
 		 520 aa  179  7e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.763175  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0991  thioredoxin reductase  36.91 
 
 		 322 aa  179  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0860266  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3453  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  35.02 
 
 		 522 aa  178  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.455545  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0626  thioredoxin-disulfide reductase  35.48 
 
 		 320 aa  177  2e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1718  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class-II, active site  34.06 
 
 		 519 aa  177  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1704  thioredoxin-disulfide reductase  35.81 
 
 		 321 aa  178  2e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.473306  normal  0.0188738 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1412  thioredoxin reductase  37.15 
 
 		 322 aa  177  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00718409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3573  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  33.66 
 
 		 520 aa  177  3e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.158044  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3500  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.32 
 
 		 532 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.393361  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2362  thioredoxin reductase  37.82 
 
 		 318 aa  177  4e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1091  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33 
 
 		 535 aa  177  4e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.120571 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0214  thioredoxin-disulfide reductase  37.46 
 
 		 312 aa  176  5e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.136255  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3983  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  34.57 
 
 		 532 aa  176  5e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170234  normal  0.309156 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53290  thioredoxin reductase 2  36.53 
 
 		 316 aa  176  5e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.868588 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4496  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  34.48 
 
 		 532 aa  176  6e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.783992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0321  thioredoxin-disulfide reductase  35.03 
 
 		 319 aa  176  6e-43  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.101036  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0059  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  33.09 
 
 		 507 aa  176  7e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.492285  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0567  thioredoxin reductase  34.84 
 
 		 340 aa  176  7e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3433  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  34.81 
 
 		 533 aa  176  8e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4671  thioredoxin reductase 2  37.26 
 
 		 316 aa  176  8e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445681  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1611  thioredoxin reductase  36.34 
 
 		 320 aa  176  9e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000152855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2687  thioredoxin reductase  36.34 
 
 		 320 aa  176  9e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.643501  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26320  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.07 
 
 		 521 aa  176  9e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2598  thioredoxin-disulfide reductase  36.34 
 
 		 320 aa  176  9e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000212052  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0048  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.26 
 
 		 407 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.282171  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2262  thioredoxin reductase  36.39 
 
 		 319 aa  175  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0017275  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0217  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  33.42 
 
 		 521 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4276  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.81 
 
 		 533 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.63016  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4090  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.81 
 
 		 533 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1150  thioredoxin-disulfide reductase  33.44 
 
 		 299 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1927  alkyl hydroperoxide reductase subunit  35.16 
 
 		 601 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.586969  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1206  AhpF  34.32 
 
 		 530 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000001914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2437  thioredoxin reductase  30.22 
 
 		 442 aa  174  2.9999999999999996e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1324  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.42 
 
 		 518 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0640975  normal  0.811608 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0518  thioredoxin reductase  34.85 
 
 		 306 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  34.85 
 
 		 304 aa  173  5e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2999  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  32.7 
 
 		 525 aa  173  5e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.336504  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01720  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  33.42 
 
 		 521 aa  173  5e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.452845 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2440  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  32.92 
 
 		 520 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0254  thioredoxin reductase  33.33 
 
 		 308 aa  172  5.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0385075  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0040  glucose-inhibited division protein A  33.99 
 
 		 340 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.390106  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1954  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.58 
 
 		 532 aa  172  9e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0428675  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1959  thioredoxin reductase  37.46 
 
 		 317 aa  172  9e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000155114  normal  0.552411 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2017  thioredoxin reductase  37.46 
 
 		 317 aa  172  9e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000213161  normal  0.0579886 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2047  thioredoxin reductase  37.46 
 
 		 317 aa  172  9e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000827938  hitchhiker  0.00204856 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00575  alkyl hydroperoxide reductase, F52a subunit, FAD/NAD(P)-binding  33.74 
 
 		 521 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3018  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  33.74 
 
 		 531 aa  171  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.531369  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00564  hypothetical protein  33.74 
 
 		 521 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0520  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  33.74 
 
 		 531 aa  171  1e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3037  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  33.74 
 
 		 531 aa  171  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0692  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  33.74 
 
 		 531 aa  171  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.766507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3255  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  32.92 
 
 		 520 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0658  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  33.74 
 
 		 531 aa  171  1e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0627  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  33.74 
 
 		 531 aa  171  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2303  thioredoxin reductase  37.14 
 
 		 317 aa  171  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1795  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  32.77 
 
 		 525 aa  171  2e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.114206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5402  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  34.07 
 
 		 530 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000100097  normal  0.196114 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2750  thioredoxin-disulfide reductase  36.69 
 
 		 312 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2436  thioredoxin-disulfide reductase  36.69 
 
 		 312 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0627  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  33.74 
 
 		 531 aa  171  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1985  thioredoxin reductase  35.53 
 
 		 320 aa  171  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.594025  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>