More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0747 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2885  glutamyl-tRNA synthetase  59.54 
 
 		 561 aa  702    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.59591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1817  glutamyl-tRNA synthetase  60.43 
 
 		 561 aa  738    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.183572  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0747  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 560 aa  1156    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.152581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2371  glutamyl-tRNA synthetase  61.61 
 
 		 562 aa  707    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.512947 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2208  glutamyl-tRNA synthetase  57.82 
 
 		 634 aa  596  1e-169  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.387382  normal  0.932733 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0253  glutamyl-tRNA synthetase  47.25 
 
 		 555 aa  535  1e-151  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.672703  normal  0.642946 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1648  glutamyl-tRNA synthetase  47.87 
 
 		 555 aa  538  1e-151  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0583  glutamyl-tRNA synthetase  47.42 
 
 		 555 aa  535  1e-150  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.153403  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0338  glutamyl-tRNA synthetase  46.09 
 
 		 555 aa  520  1e-146  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00104311  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1110  glutamyl-tRNA synthetase  46.99 
 
 		 561 aa  511  1e-143  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0091  glutamyl-tRNA synthetase  45.83 
 
 		 557 aa  488  1e-136  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.114333  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2335  glutamyl-tRNA synthetase  45.63 
 
 		 569 aa  480  1e-134  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000111665  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1470  glutamyl-tRNA synthetase  45.36 
 
 		 571 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000234189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1466  glutamyl-tRNA synthetase  44.96 
 
 		 564 aa  462  9.999999999999999e-129  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0445  glutamyl-tRNA synthetase  39.53 
 
 		 573 aa  410  1e-113  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2071  glutamyl-tRNA synthetase  38.45 
 
 		 582 aa  391  1e-107  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2537  glutamyl-tRNA synthetase  39.82 
 
 		 574 aa  379  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2322  glutamyl-tRNA synthetase  38.65 
 
 		 590 aa  381  1e-104  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0371  glutamyl-tRNA synthetase  39.24 
 
 		 570 aa  382  1e-104  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.1411 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1533  glutamyl-tRNA synthetase  38.9 
 
 		 588 aa  372  1e-102  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.403992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0816  glutamyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 		 569 aa  374  1e-102  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1069  glutamyl-tRNA synthetase  37.59 
 
 		 574 aa  372  1e-101  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0462045  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2609  glutamyl-tRNA synthetase  37.97 
 
 		 579 aa  366  1e-100  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1338  glutamyl-tRNA synthetase  38.08 
 
 		 570 aa  365  1e-100  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.162859  normal  0.450073 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1756  glutamyl-tRNA synthetase  37.37 
 
 		 570 aa  361  2e-98  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1137  glutamyl-tRNA synthetase  38.52 
 
 		 570 aa  359  9e-98  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.215502 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2131  glutamyl-tRNA synthetase  35.21 
 
 		 566 aa  332  1e-89  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000159948  hitchhiker  0.0000949008 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0311  glutamyl-tRNA synthetase  30.56 
 
 		 569 aa  263  4e-69  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.396423 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39738  predicted protein  31.22 
 
 		 749 aa  203  6e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00070  glutamate-tRNA ligase, putative  27.29 
 
 		 728 aa  196  1e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89978  glutamine-tRNA ligase  27.23 
 
 		 720 aa  194  3e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.220095 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09157  Glutaminyl-tRNA synthetase (Eurofung)  30.08 
 
 		 628 aa  193  8e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2188  glutaminyl-tRNA synthetase  29.44 
 
 		 816 aa  183  6e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00249648  normal  0.613425 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72287  glutaminyl-tRNA synthetase  29.03 
 
 		 799 aa  183  7e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.579144  normal  0.826623 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_51430  glutamate-trna ligase  29.81 
 
 		 523 aa  181  2e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0267  glutaminyl-tRNA synthetase  28.14 
 
 		 587 aa  181  4e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0832  glutaminyl-tRNA synthetase  27.84 
 
 		 552 aa  181  4e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.551071  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1195  glutaminyl-tRNA synthetase  26.88 
 
 		 555 aa  181  4.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.068426  decreased coverage  0.0000265755 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0517  glutaminyl-tRNA synthetase  28.18 
 
 		 556 aa  180  5.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0841  glutaminyl-tRNA synthetase  27.02 
 
 		 555 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0805  glutaminyl-tRNA synthetase  27.02 
 
 		 555 aa  179  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.112626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004127  glutaminyl-tRNA synthetase  28.01 
 
 		 556 aa  178  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000085379  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0792  glutaminyl-tRNA synthetase  27.02 
 
 		 555 aa  179  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.674612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0733  glutaminyl-tRNA synthetase  27.02 
 
 		 555 aa  179  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0745  glutaminyl-tRNA synthetase  27.02 
 
 		 555 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.794095  normal  0.613987 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01337  glutaminyl-tRNA synthetase  28.01 
 
 		 556 aa  178  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0326  glutaminyl-tRNA synthetase  27.52 
 
 		 555 aa  177  5e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000088467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2907  glutaminyl-tRNA synthetase  27.52 
 
 		 555 aa  177  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.483628  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2994  glutaminyl-tRNA synthetase  27.52 
 
 		 555 aa  177  6e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  27.17 
 
 		 568 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.16998  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1485  glutaminyl-tRNA synthetase  29.65 
 
 		 569 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0570  glutaminyl-tRNA synthetase  27.08 
 
 		 554 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.011441  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00637  glutaminyl-tRNA synthetase  27.08 
 
 		 554 aa  173  5.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2957  glutaminyl-tRNA synthetase  27.08 
 
 		 554 aa  173  5.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.690706  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0706  glutaminyl-tRNA synthetase  27.08 
 
 		 554 aa  173  5.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000238299  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2976  glutaminyl-tRNA synthetase  27.08 
 
 		 554 aa  173  5.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0725  glutaminyl-tRNA synthetase  27.08 
 
 		 554 aa  173  5.999999999999999e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.769137  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00628  hypothetical protein  27.08 
 
 		 554 aa  173  5.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0702  glutaminyl-tRNA synthetase  26.88 
 
 		 554 aa  172  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0773  glutaminyl-tRNA synthetase  26.88 
 
 		 554 aa  171  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0411639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3799  glutaminyl-tRNA synthetase  30.71 
 
 		 565 aa  171  3e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.105698  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3882  glutaminyl-tRNA synthetase  30.71 
 
 		 565 aa  171  4e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00740  glutamine-tRNA ligase, putative  27.44 
 
 		 858 aa  170  5e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.344742  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0833  glutaminyl-tRNA synthetase  27.74 
 
 		 609 aa  169  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227422  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0850  glutaminyl-tRNA synthetase  28.43 
 
 		 565 aa  169  1e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.750586 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0417  glutaminyl-tRNA synthetase  30.83 
 
 		 570 aa  169  1e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1384  glutaminyl-tRNA synthetase  28.03 
 
 		 563 aa  168  2e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1216  glutaminyl-tRNA synthetase  28.16 
 
 		 555 aa  169  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0791  glutaminyl-tRNA synthetase  27.9 
 
 		 580 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00535923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4167  glutaminyl-tRNA synthetase  29.65 
 
 		 568 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0895  glutaminyl-tRNA synthetase  28.84 
 
 		 548 aa  167  2.9999999999999998e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2128  glutaminyl-tRNA synthetase  27.02 
 
 		 558 aa  167  4e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.116661  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0242  glutaminyl-tRNA synthetase  30.35 
 
 		 555 aa  167  5e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0818  glutaminyl-tRNA synthetase  28.22 
 
 		 582 aa  167  5.9999999999999996e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0602034 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0807  glutaminyl-tRNA synthetase  28.43 
 
 		 576 aa  167  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1902  glutaminyl-tRNA synthetase  30.97 
 
 		 590 aa  166  9e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000991205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0814  glutaminyl-tRNA synthetase  29.2 
 
 		 597 aa  166  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000834243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3121  glutaminyl-tRNA synthetase  27.96 
 
 		 556 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000496067 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2879  glutaminyl-tRNA synthetase  27.87 
 
 		 567 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0737  glutaminyl-tRNA synthetase  28.43 
 
 		 576 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.705767 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0922  glutaminyl-tRNA synthetase  29.03 
 
 		 559 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3294  glutaminyl-tRNA synthetase  28.88 
 
 		 565 aa  165  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000133432  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2615  glutaminyl-tRNA synthetase  27.84 
 
 		 556 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.620395  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0058  glutaminyl-tRNA synthetase  30.08 
 
 		 553 aa  164  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2184  glutaminyl-tRNA synthetase  26.33 
 
 		 558 aa  164  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.213652  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4241  glutaminyl-tRNA synthetase  28.79 
 
 		 564 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2787  glutaminyl-tRNA synthetase  27.56 
 
 		 567 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2904  glutaminyl-tRNA synthetase  27.56 
 
 		 567 aa  163  7e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.781654 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2599  glutaminyl-tRNA synthetase  30.61 
 
 		 778 aa  163  7e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0790772  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2940  glutaminyl-tRNA synthetase  28.76 
 
 		 552 aa  163  7e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0919452  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1270  glutaminyl-tRNA synthetase  25.9 
 
 		 551 aa  162  1e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3509  glutaminyl-tRNA synthetase  27.18 
 
 		 561 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271227  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23520  glutaminyl-tRNA synthetase  28.63 
 
 		 555 aa  161  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1596  glutaminyl-tRNA synthetase  29.57 
 
 		 557 aa  162  2e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1300  glutaminyl-tRNA synthetase  27.35 
 
 		 794 aa  162  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.91877 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01892  glutaminyl-tRNA synthetase  27.1 
 
 		 555 aa  162  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00449379  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3791  glutaminyl-tRNA synthetase  28.99 
 
 		 565 aa  161  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4882  glutaminyl-tRNA synthetase  28.84 
 
 		 540 aa  161  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1269  glutaminyl-tRNA synthetase  25.38 
 
 		 551 aa  161  3e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41380  glutaminyl-tRNA synthetase  27.18 
 
 		 556 aa  161  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.423392 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>