More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0091 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0091  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 
557 aa  1134    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.114333  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0253  glutamyl-tRNA synthetase  48.93 
 
 
555 aa  522  1e-147  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.672703  normal  0.642946 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1648  glutamyl-tRNA synthetase  48.58 
 
 
555 aa  522  1e-147  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0747  glutamyl-tRNA synthetase  46.54 
 
 
560 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.152581  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0583  glutamyl-tRNA synthetase  48 
 
 
555 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.153403  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1110  glutamyl-tRNA synthetase  48.51 
 
 
561 aa  514  1e-144  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1817  glutamyl-tRNA synthetase  47.53 
 
 
561 aa  513  1e-144  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.183572  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0338  glutamyl-tRNA synthetase  47.26 
 
 
555 aa  505  1e-141  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00104311  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2371  glutamyl-tRNA synthetase  44.97 
 
 
562 aa  488  1e-136  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.512947 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2885  glutamyl-tRNA synthetase  44.29 
 
 
561 aa  486  1e-136  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.59591  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1470  glutamyl-tRNA synthetase  45.71 
 
 
571 aa  478  1e-133  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000234189  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1466  glutamyl-tRNA synthetase  44.35 
 
 
564 aa  465  1e-129  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2335  glutamyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 
569 aa  457  1e-127  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000111665  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2208  glutamyl-tRNA synthetase  48.51 
 
 
634 aa  437  1e-121  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.387382  normal  0.932733 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1756  glutamyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 
570 aa  405  1e-111  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0371  glutamyl-tRNA synthetase  42.53 
 
 
570 aa  401  9.999999999999999e-111  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.1411 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1338  glutamyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 
570 aa  396  1e-109  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.162859  normal  0.450073 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0816  glutamyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 
569 aa  396  1e-109  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1137  glutamyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 
570 aa  394  1e-108  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.215502 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0445  glutamyl-tRNA synthetase  38.3 
 
 
573 aa  382  1e-104  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1069  glutamyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 
574 aa  376  1e-103  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0462045  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1533  glutamyl-tRNA synthetase  41.11 
 
 
588 aa  374  1e-102  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.403992  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2537  glutamyl-tRNA synthetase  38.76 
 
 
574 aa  370  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2131  glutamyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 
566 aa  370  1e-101  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000159948  hitchhiker  0.0000949008 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2071  glutamyl-tRNA synthetase  36.33 
 
 
582 aa  357  1.9999999999999998e-97  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2609  glutamyl-tRNA synthetase  36.94 
 
 
579 aa  357  2.9999999999999997e-97  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2322  glutamyl-tRNA synthetase  35.2 
 
 
590 aa  328  2.0000000000000001e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0311  glutamyl-tRNA synthetase  33.74 
 
 
569 aa  283  6.000000000000001e-75  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.396423 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0267  glutaminyl-tRNA synthetase  29.84 
 
 
587 aa  196  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89978  glutamine-tRNA ligase  28.05 
 
 
720 aa  180  4.999999999999999e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.220095 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00740  glutamine-tRNA ligase, putative  30.03 
 
 
858 aa  179  1e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.344742  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  30.35 
 
 
568 aa  179  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.16998  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00070  glutamate-tRNA ligase, putative  26.95 
 
 
728 aa  176  8e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2188  glutaminyl-tRNA synthetase  28.42 
 
 
816 aa  176  9.999999999999999e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00249648  normal  0.613425 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39738  predicted protein  29.02 
 
 
749 aa  174  5.999999999999999e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1485  glutaminyl-tRNA synthetase  30.46 
 
 
569 aa  173  6.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4549  glutaminyl-tRNA synthetase  31.3 
 
 
569 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1383  glutaminyl-tRNA synthetase  31.12 
 
 
569 aa  172  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.21862 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72287  glutaminyl-tRNA synthetase  29.07 
 
 
799 aa  171  4e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.579144  normal  0.826623 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1596  glutaminyl-tRNA synthetase  31.1 
 
 
557 aa  170  7e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1910  glutaminyl-tRNA synthetase  30.59 
 
 
569 aa  170  8e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.125081  normal  0.474008 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2665  glutaminyl-tRNA synthetase  30.24 
 
 
569 aa  170  8e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0180309  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0923  glutaminyl-tRNA synthetase  30.85 
 
 
569 aa  170  8e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1282  glutaminyl-tRNA synthetase  31.12 
 
 
569 aa  170  8e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1405  glutaminyl-tRNA synthetase  30.85 
 
 
569 aa  170  8e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.681017  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2828  glutaminyl-tRNA synthetase  30.15 
 
 
569 aa  169  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.531779  normal  0.0114243 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0417  glutaminyl-tRNA synthetase  29.24 
 
 
570 aa  169  1e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3799  glutaminyl-tRNA synthetase  31.19 
 
 
565 aa  169  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.105698  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1316  glutaminyl-tRNA synthetase  31.32 
 
 
569 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.110897 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1216  glutaminyl-tRNA synthetase  30.98 
 
 
555 aa  168  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1307  glutaminyl-tRNA synthetase  30.15 
 
 
569 aa  168  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3882  glutaminyl-tRNA synthetase  31.19 
 
 
565 aa  169  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_51430  glutamate-trna ligase  28.72 
 
 
523 aa  167  2.9999999999999998e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0907  glutaminyl-tRNA synthetase  30.21 
 
 
573 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47238  normal  0.116742 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1902  glutaminyl-tRNA synthetase  33.14 
 
 
590 aa  167  4e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000991205  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1300  glutaminyl-tRNA synthetase  32.23 
 
 
794 aa  166  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.91877 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0701  glutaminyl-tRNA synthetase  29.73 
 
 
569 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0459  glutaminyl-tRNA synthetase  29.73 
 
 
569 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.200352  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0892  glutaminyl-tRNA synthetase  29.73 
 
 
569 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.522948  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0850  glutaminyl-tRNA synthetase  30.11 
 
 
565 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.750586 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1812  glutaminyl-tRNA synthetase  29.73 
 
 
596 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0624978  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1845  glutaminyl-tRNA synthetase  28.89 
 
 
559 aa  165  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1633  glutaminyl-tRNA synthetase  29.73 
 
 
569 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0234579  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1419  glutaminyl-tRNA synthetase  29.73 
 
 
569 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1655  glutaminyl-tRNA synthetase  29.73 
 
 
569 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.434975  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1384  glutaminyl-tRNA synthetase  30.11 
 
 
563 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3516  glutaminyl-tRNA synthetase  31.82 
 
 
564 aa  165  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2787  glutaminyl-tRNA synthetase  29.63 
 
 
567 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3743  glutaminyl-tRNA synthetase  29.57 
 
 
569 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0260392  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0917  glutaminyl-tRNA synthetase  31.64 
 
 
580 aa  164  4.0000000000000004e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000234027  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_23867  predicted protein  28.89 
 
 
541 aa  164  5.0000000000000005e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2879  glutaminyl-tRNA synthetase  28.98 
 
 
567 aa  163  6e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3791  glutaminyl-tRNA synthetase  30.21 
 
 
565 aa  163  7e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1734  glutaminyl-tRNA synthetase  29.13 
 
 
564 aa  163  9e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112324  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3294  glutaminyl-tRNA synthetase  31.18 
 
 
565 aa  163  9e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000133432  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2904  glutaminyl-tRNA synthetase  29.63 
 
 
567 aa  163  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.781654 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0101  glutaminyl-tRNA synthetase  31.37 
 
 
572 aa  162  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1595  glutaminyl-tRNA synthetase  30 
 
 
562 aa  162  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000811863  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2516  glutaminyl-tRNA synthetase  30.15 
 
 
556 aa  162  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0318208  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3615  glutaminyl-tRNA synthetase  28.85 
 
 
604 aa  162  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3121  glutaminyl-tRNA synthetase  30.81 
 
 
556 aa  161  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000496067 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0922  glutaminyl-tRNA synthetase  31.02 
 
 
559 aa  161  2e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_16963  glutaminyl-trna synthetase  29.33 
 
 
568 aa  162  2e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4167  glutaminyl-tRNA synthetase  29.32 
 
 
568 aa  161  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2572  glutaminyl-tRNA synthetase  29.35 
 
 
555 aa  162  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0923139  hitchhiker  0.00019462 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0536  glutaminyl-tRNA synthetase  29.69 
 
 
556 aa  161  3e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0818  glutaminyl-tRNA synthetase  30.18 
 
 
582 aa  161  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0602034 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0189  glutaminyl-tRNA synthetase  31.55 
 
 
561 aa  161  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.360973  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2083  glutaminyl-tRNA synthetase  29.55 
 
 
565 aa  161  4e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6655  glutaminyl-tRNA synthetase  28 
 
 
583 aa  161  4e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.204769  normal  0.445852 
 
 
-
 
NC_002950  PG1951  glutaminyl-tRNA synthetase  28.26 
 
 
566 aa  160  6e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1843  glutaminyl-tRNA synthetase  32.13 
 
 
559 aa  160  6e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.311784  normal  0.481089 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1351  glutaminyl-tRNA synthetase  28.5 
 
 
625 aa  160  7e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.22682 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23520  glutaminyl-tRNA synthetase  29.53 
 
 
555 aa  160  8e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0833  glutaminyl-tRNA synthetase  30.45 
 
 
609 aa  160  8e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227422  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0895  glutaminyl-tRNA synthetase  31 
 
 
548 aa  159  1e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1482  glutaminyl-tRNA synthetase  29.38 
 
 
556 aa  159  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348011  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4241  glutaminyl-tRNA synthetase  31.06 
 
 
564 aa  158  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2109  glutaminyl-tRNA synthetase  31.14 
 
 
557 aa  158  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.831991  hitchhiker  0.000255722 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0814  glutaminyl-tRNA synthetase  27.53 
 
 
597 aa  158  3e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000834243  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>