More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1891 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_1825  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
288 aa  544  1e-154  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1844  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
288 aa  544  1e-154  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
288 aa  544  1e-154  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.544788  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.36 
 
 
292 aa  248  9e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300023  normal  0.0662243 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.93 
 
 
278 aa  210  3e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0864933  normal  0.0870735 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2324  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.66 
 
 
319 aa  203  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.98941 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0391  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.67 
 
 
295 aa  202  6e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3739  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.47 
 
 
300 aa  199  5e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146994  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0036  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.47 
 
 
305 aa  198  7e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0186771  normal  0.317689 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.86 
 
 
310 aa  193  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.373123  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3965  hypothetical protein  40.07 
 
 
300 aa  193  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.16334 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3991  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.24 
 
 
300 aa  191  9e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.368526  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1080  peptide ABC transporter, permease protein  43.41 
 
 
281 aa  191  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0826305  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3233  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  39.86 
 
 
300 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3971  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.86 
 
 
300 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.22 
 
 
304 aa  188  8e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.91 
 
 
300 aa  188  8e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
311 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.732722 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2914  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.75 
 
 
289 aa  186  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4178  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.34 
 
 
311 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.428406  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3250  dipeptide ABC transporter, permease protein DppC, putative  40.86 
 
 
301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193894  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1253  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.27 
 
 
305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.95778  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3886  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  41.61 
 
 
301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3369  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.15 
 
 
301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3865  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.77 
 
 
307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0137  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.47 
 
 
300 aa  182  7e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.02 
 
 
294 aa  181  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881682  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4042  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
307 aa  181  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3840  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.47 
 
 
298 aa  181  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00781305  normal  0.217965 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1250  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.56 
 
 
301 aa  181  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.70134 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2704  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.77 
 
 
301 aa  180  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1183  putative permease of ABC transporter  38.27 
 
 
301 aa  180  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.056047  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2922  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.08 
 
 
285 aa  180  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4054  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.31 
 
 
305 aa  180  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.58779  normal  0.456296 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.47 
 
 
298 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0407535  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4400  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.7 
 
 
299 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111328  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4111  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.7 
 
 
299 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.553979  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3674  oligopeptide ABC transporter, permease  37.27 
 
 
279 aa  179  4e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0467802 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0162  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.96 
 
 
322 aa  179  7e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1857  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.38 
 
 
283 aa  178  7e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4006  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.7 
 
 
304 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.65 
 
 
286 aa  177  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.15122  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1584  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.34 
 
 
302 aa  177  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0374  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.79 
 
 
300 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.284254  normal  0.579699 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0488  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.69 
 
 
303 aa  176  5e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3831  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.22 
 
 
308 aa  175  6e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.810845 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5440  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.02 
 
 
310 aa  175  9e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00362913 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6303  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.08 
 
 
304 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0805  ABC dipeptide transporter, inner membrane subunit DppC  39.13 
 
 
300 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3266  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.4 
 
 
298 aa  174  9.999999999999999e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2463  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.13 
 
 
300 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.342595  normal  0.319214 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2716  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39 
 
 
301 aa  174  9.999999999999999e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1103  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
277 aa  175  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0331  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.67 
 
 
302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.878588  normal  0.0471149 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1251  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  41.6 
 
 
304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1340  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.98 
 
 
469 aa  174  1.9999999999999998e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2848  ABC transporter permease protein  40.7 
 
 
276 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.59 
 
 
287 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2162  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.47 
 
 
298 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00686598  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.81 
 
 
303 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.551804 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1880  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.25 
 
 
300 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.44403  normal  0.296986 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01443  D-ala-D-ala transporter subunit  40.38 
 
 
298 aa  172  5e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.45304  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1674  ATP-dependent peptide transporter membrane subunit  40.38 
 
 
298 aa  172  5e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01455  hypothetical protein  40.38 
 
 
298 aa  172  5e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.47297  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3847  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.07 
 
 
297 aa  172  5e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2349  ATP-dependent peptide transporter membrane subunit  39.5 
 
 
295 aa  172  5e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.67 
 
 
299 aa  172  5.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5712  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.98 
 
 
304 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.043674 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3775  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.98 
 
 
304 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.887785  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4593  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.98 
 
 
304 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0666762  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1688  ATP-dependent peptide transporter membrane subunit  40 
 
 
298 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.175944  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1529  dipeptide ABC transporter, permease protein  38.18 
 
 
302 aa  172  6.999999999999999e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.936429  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2172  ATP-dependent peptide transporter membrane subunit  40.38 
 
 
298 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1570  ATP-dependent peptide transporter membrane subunit  40.08 
 
 
298 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2530  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.8 
 
 
286 aa  171  9e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3090  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.09 
 
 
310 aa  171  9e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0927  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.86 
 
 
284 aa  171  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0968091  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1276  ABC transporter, permease protein  43.21 
 
 
313 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.485839  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2559  putative dipeptide transport system permease protein  43.21 
 
 
313 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1390  ABC transporter, permease protein  43.21 
 
 
313 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.028004  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2053  peptide ABC transporter permease  40.48 
 
 
303 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.942235  normal  0.455607 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.65 
 
 
312 aa  171  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1952  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.27 
 
 
302 aa  171  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.288153  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0520  ABC transporter, permease protein  43.21 
 
 
313 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.747108  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.75 
 
 
304 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.637669  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1694  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.86 
 
 
300 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397277  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5291  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  42.02 
 
 
282 aa  171  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1309  ABC transporter, permease protein  43.21 
 
 
313 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0351291  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1048  ABC transporter, permease protein  43.21 
 
 
313 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0249  ABC transporter, permease protein  43.21 
 
 
313 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04500  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  38.58 
 
 
278 aa  171  2e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.688401  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2097  ATP-dependent peptide transporter membrane subunit  40 
 
 
298 aa  171  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.93 
 
 
287 aa  170  2e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.92 
 
 
304 aa  170  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292743  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.62 
 
 
304 aa  170  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.581816  normal  0.108458 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0112  dipeptide transporter  39.85 
 
 
304 aa  169  4e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1504  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.67 
 
 
289 aa  169  6e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.109416  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.55 
 
 
287 aa  169  7e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000642732  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.77 
 
 
305 aa  169  7e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3535  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.98 
 
 
300 aa  167  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.641847 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>