More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0283 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_0264  hypothetical protein  100 
 
 
256 aa  492  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.720653 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0273  hypothetical protein  100 
 
 
256 aa  492  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0283  hypothetical protein  100 
 
 
256 aa  492  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.23346 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2506  hypothetical protein  90.84 
 
 
269 aa  435  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.423121 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2849  hypothetical protein  88.14 
 
 
270 aa  431  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4540  hypothetical protein  87.01 
 
 
270 aa  430  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.113009 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3686  hypothetical protein  86.06 
 
 
270 aa  424  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.86718  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3746  hypothetical protein  86.06 
 
 
270 aa  421  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.507857  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3673  hypothetical protein  86.06 
 
 
270 aa  421  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4152  hypothetical protein  90.84 
 
 
269 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13535  integral membrane protein YrbE4a  72.47 
 
 
254 aa  353  1e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000148357 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5204  hypothetical protein  72.34 
 
 
237 aa  343  2e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.217332 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4619  hypothetical protein  68.92 
 
 
254 aa  342  4e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4707  hypothetical protein  68.92 
 
 
254 aa  342  4e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1554  hypothetical protein  72.34 
 
 
237 aa  340  1e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5002  hypothetical protein  69.08 
 
 
254 aa  339  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3952  protein of unknown function DUF140  71.03 
 
 
254 aa  338  4e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1522  hypothetical protein  62.6 
 
 
271 aa  326  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1545  hypothetical protein  62.6 
 
 
271 aa  326  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4172  hypothetical protein  63.97 
 
 
257 aa  323  2e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4190  hypothetical protein  65.32 
 
 
255 aa  320  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.731627  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4401  hypothetical protein  64.37 
 
 
250 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2099  hypothetical protein  60.73 
 
 
255 aa  310  2e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10168  integral membrane protein YrbE1a  61.42 
 
 
265 aa  308  6.999999999999999e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1625  hypothetical protein  60.32 
 
 
266 aa  306  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1650  hypothetical protein  60.32 
 
 
266 aa  306  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4606  hypothetical protein  60.24 
 
 
255 aa  307  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.809194  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1676  hypothetical protein  60.32 
 
 
266 aa  306  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.277826  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0498  hypothetical protein  60.32 
 
 
269 aa  306  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0382697  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0654  hypothetical protein  59.92 
 
 
269 aa  303  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0633475  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0713  hypothetical protein  61.81 
 
 
265 aa  300  2e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0132  hypothetical protein  61.81 
 
 
265 aa  300  2e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.99032  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10598  integral membrane protein YrbE2a  61.26 
 
 
265 aa  298  4e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3984  hypothetical protein  58.3 
 
 
257 aa  296  2e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0361  hypothetical protein  59.11 
 
 
256 aa  295  5e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0106  hypothetical protein  61.66 
 
 
265 aa  275  7e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.963801 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0116  hypothetical protein  61.66 
 
 
265 aa  275  7e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.239683  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0125  hypothetical protein  61.66 
 
 
265 aa  275  7e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.288689  normal  0.150892 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0920  hypothetical protein  65.18 
 
 
255 aa  260  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.403471 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4348  protein of unknown function DUF140  52.08 
 
 
285 aa  245  4e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03700  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component  52.08 
 
 
250 aa  243  1.9999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.270229  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6634  protein of unknown function DUF140  50 
 
 
260 aa  235  5.0000000000000005e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451559  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1128  protein of unknown function DUF140  50.41 
 
 
268 aa  227  1e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0701  hypothetical protein  47.76 
 
 
261 aa  224  1e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0856  hypothetical protein  44.35 
 
 
253 aa  223  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.792912 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2250  protein of unknown function DUF140  50.82 
 
 
267 aa  222  4e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09380  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component  48.17 
 
 
267 aa  213  2.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3830  protein of unknown function DUF140  42.92 
 
 
267 aa  186  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0520  protein of unknown function DUF140  44.17 
 
 
262 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2826  hypothetical protein  46.75 
 
 
257 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2988  protein of unknown function DUF140  43.24 
 
 
285 aa  182  6e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3025  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents permease component-like protein  40 
 
 
269 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.753078  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0957  hypothetical protein  36.29 
 
 
281 aa  155  4e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0012  hypothetical protein  38.16 
 
 
312 aa  154  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261504  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1246  protein of unknown function DUF140  42.53 
 
 
285 aa  154  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.869523  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11995  integral membrane protein YrbE3a  55.88 
 
 
141 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4170  protein of unknown function DUF140  40.44 
 
 
285 aa  145  6e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1221  protein of unknown function DUF140  39.79 
 
 
349 aa  134  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11994  integral membrane protein YrbE3a  55.96 
 
 
132 aa  124  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3789  protein of unknown function DUF140  34.3 
 
 
272 aa  124  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  33.33 
 
 
256 aa  122  8e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1620  protein of unknown function DUF140  35.75 
 
 
246 aa  116  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.346599  normal  0.915848 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5634  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents permease component-like protein  58.72 
 
 
206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.639594  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4314  hypothetical protein  31.44 
 
 
252 aa  107  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.450744  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0708  protein of unknown function DUF140  35.59 
 
 
272 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356543  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  30.2 
 
 
270 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0852  protein of unknown function DUF140  29.39 
 
 
267 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0347867 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1816  hypothetical protein  29.01 
 
 
267 aa  105  6e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1863  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  30.04 
 
 
251 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0833  hypothetical protein  35.94 
 
 
297 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2082  protein of unknown function DUF140  29.18 
 
 
251 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1720  hypothetical protein  31.5 
 
 
366 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.176851  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2809  ABC transporter, inner membrane subunit  34.34 
 
 
366 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.59078  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1997  protein of unknown function DUF140  29.18 
 
 
251 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1489  hypothetical protein  34.34 
 
 
366 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.453578 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1976  hypothetical protein  28 
 
 
250 aa  99.4  5e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45767  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  27.69 
 
 
261 aa  99  6e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2986  ABC transporter, permease  30.47 
 
 
263 aa  98.6  9e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0327  hypothetical protein  30.67 
 
 
258 aa  97.8  1e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.650486  normal  0.733671 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4625  hypothetical protein  33.93 
 
 
376 aa  97.4  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.306336  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4068  protein of unknown function DUF140  30.88 
 
 
263 aa  96.3  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0208  protein of unknown function DUF140  25.98 
 
 
268 aa  96.3  4e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00143644  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4107  protein of unknown function DUF140  30.88 
 
 
263 aa  96.3  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0705  protein of unknown function DUF140  28.46 
 
 
269 aa  95.5  8e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.316668  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0159  protein of unknown function DUF140  30.63 
 
 
266 aa  95.5  8e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.821509 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1812  protein of unknown function DUF140  32.88 
 
 
271 aa  94.7  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.402733 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2734  protein of unknown function DUF140  32.97 
 
 
258 aa  94  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1505  protein of unknown function DUF140  28.75 
 
 
430 aa  93.6  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2450  hypothetical protein  29.34 
 
 
266 aa  93.6  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1524  hypothetical protein  32.73 
 
 
261 aa  93.6  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0162884  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3706  hypothetical protein  34.76 
 
 
258 aa  93.2  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.311916  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1507  protein of unknown function DUF140  33.33 
 
 
258 aa  93.2  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.621937 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2317  hypothetical protein  32.67 
 
 
364 aa  92.8  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1978  normal  0.392221 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3314  protein of unknown function DUF140  29.65 
 
 
245 aa  92.4  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  hitchhiker  0.000176122 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2890  hypothetical protein  27.6 
 
 
258 aa  92.4  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5283  protein of unknown function DUF140  30.6 
 
 
264 aa  92.4  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2742  hypothetical protein  30.73 
 
 
365 aa  92  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0803519 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  32.76 
 
 
257 aa  91.7  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  27.13 
 
 
256 aa  91.3  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3208  hypothetical protein  32.88 
 
 
256 aa  91.3  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>