More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4061 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_4061  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
499 aa  984    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8755  AMP-dependent synthetase and ligase  38.69 
 
 
502 aa  263  6e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.696232  normal  0.114841 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  30.51 
 
 
518 aa  243  5e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2768  AMP-dependent synthetase and ligase  34.77 
 
 
489 aa  218  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.997978  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  30.37 
 
 
513 aa  218  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  34.17 
 
 
525 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8762  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.74 
 
 
510 aa  217  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3655  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.27 
 
 
483 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.334351  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3728  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.27 
 
 
483 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.38736 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3767  AMP-dependent synthetase and ligase  34.96 
 
 
512 aa  215  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0143855  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3668  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.85 
 
 
483 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188298  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26260  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  33.12 
 
 
491 aa  209  9e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.420074  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2525  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.68 
 
 
478 aa  208  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.539052 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  31.66 
 
 
499 aa  207  4e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3475  AMP-dependent synthetase and ligase  33.78 
 
 
524 aa  207  5e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.440115  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  30.37 
 
 
520 aa  205  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0057  AMP-dependent synthetase and ligase  36.09 
 
 
487 aa  205  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  29.92 
 
 
566 aa  205  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0807  AMP-dependent synthetase and ligase  33.01 
 
 
551 aa  204  3e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.472076  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34080  AMP-binding domain protein  30.9 
 
 
552 aa  203  6e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.448325  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  31.55 
 
 
525 aa  203  7e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4133  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.06 
 
 
490 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.731956  normal  0.7945 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.2 
 
 
519 aa  200  5e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.61 
 
 
514 aa  200  5e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0371  AMP-dependent synthetase and ligase  31.74 
 
 
544 aa  199  9e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00566676  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2858  AMP-dependent synthetase and ligase  35.32 
 
 
485 aa  199  9e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4437  AMP-binding domain protein  31.76 
 
 
540 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4524  AMP-binding domain protein  31.76 
 
 
540 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.95 
 
 
512 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2492  malonyl-CoA synthase  33.4 
 
 
504 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.318474  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0610  AMP-binding domain protein  28.2 
 
 
570 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.920315  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  32.5 
 
 
1043 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4867  AMP-binding domain protein  31.95 
 
 
538 aa  197  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.223701  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4818  AMP-binding domain protein  31.76 
 
 
540 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1563  AMP-binding domain protein  31.37 
 
 
538 aa  197  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.716975 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0802  malonyl-CoA synthase  33.8 
 
 
510 aa  196  7e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.756606  normal  0.0286315 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.72 
 
 
524 aa  196  7e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1904  AMP-binding domain protein  29.52 
 
 
573 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0707  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.12 
 
 
518 aa  196  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.413153  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01070  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  32.01 
 
 
516 aa  195  2e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  29.85 
 
 
539 aa  195  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  28.89 
 
 
544 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0836  malonyl-CoA synthase  35.15 
 
 
510 aa  194  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.141452  normal  0.0577882 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2593  AMP-binding domain protein  29.76 
 
 
574 aa  194  4e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0876  malonyl-CoA synthase  35.36 
 
 
510 aa  193  5e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0768548 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0965  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.76 
 
 
518 aa  193  7e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1581  AMP-dependent synthetase and ligase  31.3 
 
 
518 aa  193  8e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0255292  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2660  AMP-dependent synthetase and ligase  33.2 
 
 
510 aa  192  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.161262 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2529  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.85 
 
 
590 aa  192  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.26444  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3306  AMP-binding domain protein  31.13 
 
 
576 aa  192  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3996  AMP-dependent synthetase and ligase  33.05 
 
 
523 aa  192  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.414143  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1467  AMP-binding domain protein  30.21 
 
 
578 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  33.95 
 
 
501 aa  191  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0099  AMP-binding domain protein  30.25 
 
 
575 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3937  AMP-binding domain protein  31.1 
 
 
539 aa  191  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104158  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  34.55 
 
 
503 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1052  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.56 
 
 
518 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0108  AMP-binding domain protein  30.06 
 
 
575 aa  190  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480818  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0582  AMP-binding domain protein  27.39 
 
 
587 aa  190  4e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.44238  normal  0.647319 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  30.18 
 
 
521 aa  190  4e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12527  AMP-binding domain protein  31.12 
 
 
547 aa  190  4e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0503764 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0171  AMP-dependent synthetase and ligase  31.18 
 
 
630 aa  190  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217721  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3316  AMP-dependent synthetase and ligase  30.59 
 
 
541 aa  190  5e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0779  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.92 
 
 
518 aa  190  5e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.746675  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3966  AMP-binding domain protein  31.15 
 
 
576 aa  190  5e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2796  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.08 
 
 
492 aa  190  5.999999999999999e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00173359  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4040  AMP-binding domain protein  31.15 
 
 
576 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2959  AMP-binding domain protein  31.15 
 
 
576 aa  190  7e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3018  AMP-binding domain protein  31.15 
 
 
576 aa  190  7e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3353  AMP-binding domain protein  31.15 
 
 
576 aa  190  7e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1672  AMP-dependent synthetase and ligase  33.74 
 
 
491 aa  189  7e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0961293 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0176  AMP-binding domain protein  31.15 
 
 
576 aa  189  7e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.970705  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3103  AMP-dependent synthetase and ligase  32.54 
 
 
550 aa  189  7e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8985  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1584  AMP-binding domain protein  31.15 
 
 
570 aa  190  7e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4694  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.8 
 
 
506 aa  189  7e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.107104  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5079  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.8 
 
 
506 aa  189  7e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.216799 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4780  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.8 
 
 
506 aa  189  7e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2947  AMP-binding domain protein  30.25 
 
 
575 aa  189  8e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.768033  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0108  AMP-binding domain protein  30.25 
 
 
575 aa  189  8e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.969616  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.17 
 
 
518 aa  189  9e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4872  AMP-binding domain protein  31.65 
 
 
549 aa  189  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1276  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.22 
 
 
590 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.011036  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1782  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.22 
 
 
590 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.177104  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1957  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.22 
 
 
590 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000391168  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1035  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.22 
 
 
590 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.526739  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2861  AMP-dependent synthetase and ligase  32.39 
 
 
508 aa  189  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.213595 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0131  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.22 
 
 
590 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0305097  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4408  AMP-dependent synthetase and ligase  32.02 
 
 
563 aa  189  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1803  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.22 
 
 
590 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.911304  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1764  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.22 
 
 
590 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0022418  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0108  AMP-binding domain protein  30.21 
 
 
575 aa  188  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4982  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  28.84 
 
 
482 aa  188  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2126  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.02 
 
 
546 aa  188  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0597043  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2790  malonyl-CoA synthase  34.11 
 
 
512 aa  188  2e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139685  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  33.46 
 
 
6768 aa  187  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  27.98 
 
 
566 aa  187  3e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.404945  normal  0.888891 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4878  AMP-dependent synthetase and ligase  30.71 
 
 
530 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0148671 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2158  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  32.1 
 
 
515 aa  187  4e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4403  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.17 
 
 
518 aa  187  4e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000650953 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1362  AMP-dependent synthetase and ligase  31.84 
 
 
542 aa  187  4e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00632075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>