23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_3140 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_3140  flagellin  100 
 
 
170 aa  339  8e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000925657  normal  0.0146559 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0963  flagellin  43.32 
 
 
189 aa  122  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.252752  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2396  flagellin  39.13 
 
 
197 aa  107  9.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.297369  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2391  flagellin  38.04 
 
 
197 aa  107  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1238  flagellin (flaB1-1)  60.47 
 
 
91 aa  103  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0364051 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3139  flagellin  40.33 
 
 
179 aa  101  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00225153  normal  0.0136531 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1348  flagellin  35.42 
 
 
202 aa  101  4e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.182161  normal  0.109167 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2395  flagellin  37.84 
 
 
196 aa  100  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.474236  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0962  flagellin  37.43 
 
 
192 aa  98.6  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.366379  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2398  flagellin  36.76 
 
 
196 aa  98.2  5e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.572844  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2392  flagellin  36.96 
 
 
196 aa  95.9  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1347  flagellin  36.02 
 
 
206 aa  95.5  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.320547  normal  0.210099 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0884  flagellin  37.99 
 
 
186 aa  90.5  9e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2399  flagellin  34.95 
 
 
200 aa  89.7  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.499101  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2393  flagellin  36.36 
 
 
186 aa  89.4  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2397  flagellin  33.52 
 
 
186 aa  87  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.210845  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0346  flagellin  38.24 
 
 
190 aa  81.6  0.000000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.32901  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1970  flagellin  32.4 
 
 
201 aa  72  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0347  flagellin  38.24 
 
 
186 aa  72  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1374  flagellin  32.93 
 
 
193 aa  52  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0133  flagellin  38.33 
 
 
310 aa  49.7  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1375  flagellin-like protein  57.41 
 
 
186 aa  45.8  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1330  flagellin-like protein  26.88 
 
 
302 aa  43.9  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.416332  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>