25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3595 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3595  TM2 domain-containing protein  100 
 
 
161 aa  310  5.999999999999999e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.687188  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11631  hypothetical protein  66.67 
 
 
146 aa  114  7.999999999999999e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0708972 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3046  TM2 domain-containing protein  74.19 
 
 
127 aa  113  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3105  TM2 domain-containing protein  74.19 
 
 
127 aa  113  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3062  TM2 domain-containing protein  74.19 
 
 
127 aa  113  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0882033  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2820  TM2 domain-containing protein  63.35 
 
 
143 aa  102  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.256448  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3666  TM2 domain containing protein  52.94 
 
 
160 aa  99.4  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4904  TM2 domain-containing protein  50.52 
 
 
176 aa  92.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.097022  hitchhiker  0.00581278 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1899  TM2 domain-containing protein  53.12 
 
 
155 aa  82.8  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.47053  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2315  hypothetical protein  40.23 
 
 
146 aa  79.3  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5432  protein of unknown function DUF1707  42.55 
 
 
194 aa  71.2  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00776452  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1913  TM2 domain-containing protein  48.31 
 
 
131 aa  68.2  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.114845  hitchhiker  0.00105597 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1922  TM2 domain-containing protein  45.68 
 
 
137 aa  63.9  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.134509 
 
 
-
 
NC_002936  DET0230  TM2 domain-containing protein  39.78 
 
 
107 aa  53.1  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0254008  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0125  TM2 domain-containing protein  41.98 
 
 
107 aa  50.8  0.000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_204  hypothetical protein  40.74 
 
 
107 aa  50.4  0.000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0734  hypothetical protein  45.45 
 
 
1821 aa  50.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0591  TM2 domain containing protein  38.27 
 
 
133 aa  47.8  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000337836  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25400  protein of unknown function (DUF1707)  41.25 
 
 
166 aa  47.4  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.7287 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1541  TM2 domain containing protein  37.5 
 
 
133 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273114  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35490  predicted membrane protein  32.69 
 
 
212 aa  45.4  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0602  TM2 domain protein  32.18 
 
 
109 aa  43.1  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23650  predicted membrane protein  35.71 
 
 
336 aa  43.1  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.360975 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0822  TM2 domain containing protein  29.47 
 
 
161 aa  42  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.966716  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0604  TM2 domain protein  24.34 
 
 
190 aa  41.2  0.006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>