27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3088 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3447  hypothetical protein  71.37 
 
 
538 aa  664    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276502  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3088  hypothetical protein  100 
 
 
564 aa  1090    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.90417  normal  0.34536 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2022  hypothetical protein  32.66 
 
 
588 aa  193  7e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.195816  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4851  hypothetical protein  41.64 
 
 
473 aa  144  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1110  hypothetical protein  30.47 
 
 
501 aa  84  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0049  hypothetical protein  26.56 
 
 
627 aa  80.1  0.00000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.124758 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3284  protein of unknown function DUF1023  30.51 
 
 
569 aa  77.8  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101168  normal  0.024568 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1665  hypothetical protein  31.1 
 
 
609 aa  74.7  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.671206  normal  0.521419 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2878  hypothetical protein  28.74 
 
 
441 aa  70.5  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0874024  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2678  hypothetical protein  28.84 
 
 
507 aa  66.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0838169 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1812  hypothetical protein  29.25 
 
 
590 aa  64.7  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2874  hypothetical protein  27.13 
 
 
525 aa  64.7  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4801  hypothetical protein  28.84 
 
 
526 aa  63.5  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19530  Alpha/beta hydrolase of unknown function (DUF1023)  26.55 
 
 
533 aa  63.2  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.208558  normal  0.423038 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0412  hypothetical protein  28 
 
 
545 aa  58.9  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6862  protein of unknown function DUF1023  30.92 
 
 
654 aa  56.6  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0667  hypothetical protein  28.31 
 
 
594 aa  55.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.144802  normal  0.533045 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0437  protein of unknown function DUF1023  32.06 
 
 
393 aa  53.9  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12116  hypothetical protein  28.24 
 
 
656 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000797505  normal  0.720195 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6229  hypothetical protein  29.93 
 
 
619 aa  51.2  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0558  hypothetical protein  28.57 
 
 
368 aa  50.8  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0260  protein of unknown function DUF1023  26.14 
 
 
554 aa  49.7  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.160803 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07790  Alpha/beta hydrolase of unknown function (DUF1023)  25.14 
 
 
561 aa  48.9  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.110321 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2509  protein of unknown function DUF1023  26.67 
 
 
516 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0670827  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1233  hypothetical protein  24.51 
 
 
563 aa  45.4  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0088  hypothetical protein  26.81 
 
 
470 aa  44.7  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.210436  normal  0.176118 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0652  protein of unknown function DUF1023  30.32 
 
 
355 aa  43.5  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.870166 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>