54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1673 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1673  chorismate mutase  100 
 
 
189 aa  377  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337949  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5080  chorismate mutase  85.35 
 
 
175 aa  275  2e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2737  chorismate mutase  51.87 
 
 
188 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2781  chorismate mutase  51.87 
 
 
188 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2767  chorismate mutase  54.35 
 
 
139 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209555  normal  0.986005 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11913  chorismate mutase  44.57 
 
 
199 aa  145  3e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1464  chorismate mutase  37.2 
 
 
185 aa  79.3  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4818  chorismate mutase  31.55 
 
 
185 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0967  chorismate mutase  32.3 
 
 
197 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000119037  normal  0.243977 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0529  chorismate mutase  31.68 
 
 
197 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0728632  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1007  chorismate mutase  31.68 
 
 
197 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000012767  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4115  chorismate mutase  32.3 
 
 
197 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000003876  normal  0.458785 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0879  chorismate mutase  32.3 
 
 
197 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.512068  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0867  chorismate mutase  31.94 
 
 
197 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00756442  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04710  chorismate mutase  33.56 
 
 
155 aa  67  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.836293 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0357  chorismate mutase  30.72 
 
 
185 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1596  chorismate mutase  32.6 
 
 
202 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000122178  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3039  chorismate mutase  35.29 
 
 
205 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000151521  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0480  chorismate mutase  35.29 
 
 
197 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.769814  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2635  chorismate mutase  35.29 
 
 
189 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1006  chorismate mutase  35.29 
 
 
189 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2939  chorismate mutase  35.29 
 
 
189 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000062955  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3005  chorismate mutase  35.29 
 
 
189 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.148314  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0141  chorismate mutase  35.29 
 
 
189 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.909183  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0422  chorismate mutase  24.72 
 
 
191 aa  65.5  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0678  chorismate mutase  35.61 
 
 
207 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.826511 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03115  chorismate mutase  31.89 
 
 
177 aa  65.1  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0483  chorismate mutase  24.86 
 
 
191 aa  65.1  0.0000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2391  chorismate mutase  32.3 
 
 
196 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3544  chorismate mutase  33.12 
 
 
202 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4860  chorismate mutase  29.02 
 
 
199 aa  62  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.89966 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0915  chorismate mutase  29.35 
 
 
198 aa  62  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3783  chorismate mutase  29.02 
 
 
199 aa  62  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3076  chorismate mutase  30 
 
 
198 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.359714  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7813  chorismate mutase  31.52 
 
 
182 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1570  chorismate mutase  26.47 
 
 
234 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0840576  hitchhiker  0.0000751534 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68480  chorismate mutase  27.66 
 
 
185 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.188897 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1358  chorismate mutase  29.85 
 
 
181 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000159467  normal  0.435171 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1374  chorismate mutase  29.85 
 
 
181 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000188427  hitchhiker  0.000120257 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5099  chorismate mutase  30.15 
 
 
178 aa  52  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1390  chorismate mutase  29.63 
 
 
181 aa  51.2  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00284187  normal  0.322204 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2093  chorismate mutase  29.85 
 
 
181 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00333633  hitchhiker  0.000000577582 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3314  chorismate mutase  28.97 
 
 
199 aa  49.7  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1912  chorismate mutase  29.1 
 
 
181 aa  48.5  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125735  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5928  chorismate mutase  30.5 
 
 
185 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.318368  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5910  chorismate mutase  28.93 
 
 
198 aa  47  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4921  chorismate mutase, putative  33.33 
 
 
180 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  35.82 
 
 
358 aa  44.7  0.0009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.82 
 
 
358 aa  43.9  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1764  chorismate mutase  30.77 
 
 
163 aa  44.3  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0189067  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  35.82 
 
 
358 aa  44.3  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2074  chorismate mutase  36.84 
 
 
176 aa  43.9  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3495  chorismate mutase  29.73 
 
 
176 aa  43.5  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0235  chorismate mutase/prephenate dehydratase  22.58 
 
 
391 aa  41.6  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>