More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1299 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1299  glutamine amidotransferase, class-II  100 
 
 
302 aa  605  9.999999999999999e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0375941  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5510  glutamine amidotransferase, class-II  84.44 
 
 
302 aa  501  1e-141  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.623211  normal  0.154748 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5261  glutamine amidotransferase, class-II  74.5 
 
 
298 aa  455  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.228434 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4893  glutamine amidotransferase, class-II  74.17 
 
 
298 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4982  glutamine amidotransferase, class-II  74.17 
 
 
298 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4806  glutamine amidotransferase class-II  73.18 
 
 
298 aa  449  1e-125  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3524  glutamine amidotransferase class-II  54.79 
 
 
302 aa  315  5e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0234475 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2274  glutamine amidotransferase, class-II  43.71 
 
 
306 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0107042 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3467  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  44.04 
 
 
299 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.836717  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2583  glutamine amidotransferase, class-II protein  43.38 
 
 
306 aa  261  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0230258  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1870  putative glutamine amidotransferase  47.28 
 
 
308 aa  260  3e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117624  normal  0.828633 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2248  glutamine amidotransferase class-II  43.71 
 
 
301 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.280725 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6575  glutamine amidotransferase class-II  44.67 
 
 
302 aa  255  6e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0505165 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1942  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  47.06 
 
 
297 aa  251  9.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.738445 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1938  glutamine amidotransferase class-II  45.63 
 
 
311 aa  250  2e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.210707  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1346  glutamine amidotransferase, class-II  44.04 
 
 
299 aa  249  4e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1656  glutamine amidotransferase class-II  45.31 
 
 
311 aa  248  9e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.670859  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5749  amidophosphoribosyltransferase  42.44 
 
 
301 aa  246  3e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4695  glutamine amidotransferase class-II  43.93 
 
 
299 aa  246  3e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.903048 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1575  glutamine amidotransferase class-II  44.52 
 
 
316 aa  246  4e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3291  glutamine amidotransferase class-II  44.01 
 
 
301 aa  245  4.9999999999999997e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4810  glutamine amidotransferase class-II  46.73 
 
 
297 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.917981  hitchhiker  0.00206329 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6008  glutamine amidotransferase class-II  42.76 
 
 
301 aa  243  3e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362161  decreased coverage  0.00354269 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1699  glutamine amidotransferase class-II  44.7 
 
 
296 aa  242  5e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1138  glutamine amidotransferase, class-II  44.08 
 
 
298 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.16804 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2632  glutamine amidotransferase class-II  44.26 
 
 
299 aa  240  2e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5638  glutamine amidotransferase class-II  40.84 
 
 
301 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.52916  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3033  glutamine amidotransferase, class-II  41.2 
 
 
302 aa  235  9e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5919  glutamine amidotransferase class-II  42.19 
 
 
302 aa  231  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal  0.458284 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2499  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  42.3 
 
 
305 aa  226  3e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0705172  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0167  glutamine amidotransferase class-II  40.86 
 
 
302 aa  224  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0457  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  37.42 
 
 
298 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.598323  normal  0.402222 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22120  amidophosphoribosyltransferase  33.55 
 
 
480 aa  80.9  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.357347  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0468  amidophosphoribosyltransferase  28.74 
 
 
456 aa  79  0.00000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.350158  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1632  amidophosphoribosyltransferase  32.08 
 
 
469 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0439  amidophosphoribosyltransferase  29.34 
 
 
459 aa  77  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1419  amidophosphoribosyltransferase  28.95 
 
 
461 aa  76.3  0.0000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0127132  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2365  amidophosphoribosyltransferase  31.25 
 
 
474 aa  75.9  0.0000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0772  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  35 
 
 
608 aa  75.1  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.900207  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1013  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase isomerizing  37.37 
 
 
616 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00387111 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1224  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  35.14 
 
 
596 aa  74.3  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0396  amidophosphoribosyltransferase  28.74 
 
 
459 aa  73.9  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2179  amidophosphoribosyltransferase  29.65 
 
 
462 aa  73.9  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3280  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  32.35 
 
 
610 aa  73.2  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.333472  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1238  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  32.32 
 
 
613 aa  72  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.851914  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0309  amidophosphoribosyltransferase  29.7 
 
 
473 aa  71.6  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0507  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  42.27 
 
 
612 aa  72  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00435471 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1523  amidophosphoribosyltransferase  28.14 
 
 
459 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0119394  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0731  amidophosphoribosyltransferase  27.84 
 
 
478 aa  70.9  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0545  glutamine amidotransferase class-II  24.05 
 
 
369 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00405824 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1249  amidophosphoribosyltransferase  26.75 
 
 
488 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.917797  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4068  hypothetical protein  34.69 
 
 
603 aa  70.5  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.035977  normal  0.145106 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0536  glutamine amidotransferase class-II  27.1 
 
 
372 aa  70.5  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0980  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  30.71 
 
 
599 aa  70.9  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3499  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  42.27 
 
 
612 aa  70.9  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23190  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  36 
 
 
622 aa  70.9  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0529184  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0558  glutamine amidotransferase, class-II  23.31 
 
 
374 aa  70.9  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29300  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  39.47 
 
 
621 aa  70.5  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0522  glutamine amidotransferase, class-II  27.1 
 
 
395 aa  70.5  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3044  amidophosphoribosyltransferase  29.63 
 
 
478 aa  70.5  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1448  amidophosphoribosyltransferase  26.45 
 
 
474 aa  70.1  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2026  glutamine amidotransferase, class-II  25 
 
 
359 aa  70.1  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.805771  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2793  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  34.71 
 
 
609 aa  69.7  0.00000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2047  amidophosphoribosyltransferase  32.77 
 
 
465 aa  69.3  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.330153 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3049  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  33.12 
 
 
604 aa  69.3  0.00000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.749851  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3302  D-fructose-6-phosphate amidotransferase  40.2 
 
 
608 aa  69.3  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1766  amidophosphoribosyltransferase  33.7 
 
 
488 aa  69.3  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0501857 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0073  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  38.24 
 
 
609 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.653e-29 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0090  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  38.24 
 
 
609 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0489544  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2606  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  29.94 
 
 
608 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.659057  normal  0.799621 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3881  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  34.71 
 
 
610 aa  68.6  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3872  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  34.71 
 
 
610 aa  68.2  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0522  amidophosphoribosyltransferase  26.58 
 
 
465 aa  67.8  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1160  amidophosphoribosyltransferase  34.75 
 
 
503 aa  67.4  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.904998  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1342  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  33.53 
 
 
620 aa  68.2  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.372378  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0334  amidophosphoribosyltransferase  30.19 
 
 
462 aa  67.4  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.708549  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2658  amidophosphoribosyltransferase  34.04 
 
 
490 aa  67  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0323  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  27.56 
 
 
586 aa  67  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0218  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  33.09 
 
 
603 aa  67.4  0.0000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2741  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  41.94 
 
 
611 aa  67  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.214537 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1293  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  35.14 
 
 
606 aa  67  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.921081  normal  0.297971 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03126  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  40.21 
 
 
609 aa  67.4  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0727  amidophosphoribosyltransferase  32.43 
 
 
496 aa  67  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2095  amidophosphoribosyltransferase  32.88 
 
 
480 aa  67  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.778059 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0394  amidophosphoribosyltransferase  30.82 
 
 
470 aa  66.6  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0144451 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3498  amidophosphoribosyltransferase  29.81 
 
 
477 aa  66.6  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.349457  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0321  amidophosphoribosyltransferase  28.85 
 
 
461 aa  66.6  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3948  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  30.3 
 
 
611 aa  66.6  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.739647  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2165  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  33.33 
 
 
598 aa  66.6  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3554  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.78 
 
 
640 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5427  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  38.24 
 
 
611 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.15944  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2136  glutamine amidotransferase, class-II  24.41 
 
 
382 aa  66.2  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1366  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  32.87 
 
 
607 aa  65.9  0.0000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0425  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  30.6 
 
 
599 aa  65.9  0.0000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1147  amidophosphoribosyltransferase  26.63 
 
 
478 aa  65.9  0.0000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.218005  normal  0.314166 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0992  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  29.93 
 
 
599 aa  65.9  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.237004  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2611  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  33.58 
 
 
622 aa  65.9  0.0000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6350  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  35.34 
 
 
611 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03884  Glucosamine-fructose-6-phosphate aminotransferase  29.2 
 
 
610 aa  65.9  0.0000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0672  amidophosphoribosyltransferase  32.62 
 
 
475 aa  65.5  0.0000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.546073  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>