44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0610 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3180  cadmium resistance transporter  99.28 
 
 		 197 aa  268  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00474254  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0610  cadmium resistance transporter  100 
 
 		 139 aa  267  5e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0350  cadmium resistance transporter  76.26 
 
 		 199 aa  200  6e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2868  cadmium resistance transporter  79.43 
 
 		 201 aa  191  4e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3642  cadmium resistance transporter  79.58 
 
 		 202 aa  187  5e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3241  cadmium resistance transporter  81.29 
 
 		 199 aa  186  7e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5745  cadmium resistance transporter  79.14 
 
 		 199 aa  185  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25750  predicted permease, cadmium resistance protein  71.22 
 
 		 198 aa  176  1e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25690  predicted permease, cadmium resistance protein  75.71 
 
 		 200 aa  175  2e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20660  predicted permease, cadmium resistance protein  75 
 
 		 200 aa  174  3e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2205  cadmium resistance transporter  71.22 
 
 		 198 aa  158  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2659  cadmium resistance transporter  69.34 
 
 		 196 aa  150  7e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4661  quaternary amine transporter  53.03 
 
 		 198 aa  133  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0897553 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3211  permease cadmium resistance protein-like protein  46.76 
 
 		 255 aa  113  7.999999999999999e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0284266  normal  0.131465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5227  cadmium resistance transporter  46.6 
 
 		 218 aa  94  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.580258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4310  cadmium resistance transporter  36.15 
 
 		 199 aa  87.4  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0103075  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4479  cadmium resistance transporter  36.15 
 
 		 199 aa  87.4  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4210  cadmium resistance transporter  36.15 
 
 		 199 aa  87.4  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2848  cadmium resistance transporter  39.19 
 
 		 212 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.551645 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2457  cadmium resistance transporter  34.62 
 
 		 208 aa  79  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000531137  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2497  quaternary ammonium compound-resistance protein, C-terminal  35.38 
 
 		 151 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000463679  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0853  cadmium resistance transporter  37.6 
 
 		 199 aa  76.6  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2696  putative transport protein  33.85 
 
 		 208 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000223261 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0347  cadmium resistance transporter  34.38 
 
 		 211 aa  74.3  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2849  cadmium resistance transporter  35.38 
 
 		 238 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0184  cadmium resistance transporter, putative  38.33 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2866  cadmium resistance transporter  34.29 
 
 		 249 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000609266  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1370  cadmium resistance family protein  32.31 
 
 		 205 aa  63.5  0.0000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.128389  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1438  cadmium resistance transporter CadD  26.52 
 
 		 204 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799585  normal  0.500244 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0699  cadmium resistance transporter, CadD family  36.26 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000313403  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4404  cadmium resistance transporter  33.33 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2796  cadmium resistance transporter CadD  33.88 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2753  cadmium resistance transporter CadD  33.88 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0956067  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4467  cadmium resistance transporter  33.8 
 
 		 232 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000272706  normal  0.331556 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2221  cadmium resistance family protein  32.77 
 
 		 205 aa  57.4  0.00000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.242988  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5023  cadmium resistance transporter  26.52 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257452  normal  0.407908 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4997  cadmium resistance transporter  30.51 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000622218  normal  0.209664 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4909  cadmium resistance transporter  36.14 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4473  cadmium resistance transporter  36.67 
 
 		 224 aa  53.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.879748 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4410  cadmium resistance transporter  36.67 
 
 		 224 aa  53.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4400  cadmium resistance transporter  26.92 
 
 		 214 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4463  cadmium resistance transporter  26.15 
 
 		 214 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00350576  normal  0.203926 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1265  cadmium resistance transporter, putative  30.86 
 
 		 206 aa  51.6  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00419797  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5025  cadmium resistance transporter  26.92 
 
 		 228 aa  50.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0241386  normal  0.862178 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>