266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl419 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006055  Mfl419  thymidylate synthase  100 
 
 
288 aa  596  1e-169  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0183487  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1516  thymidylate synthase  55.31 
 
 
318 aa  337  1.9999999999999998e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1487  thymidylate synthase  55.31 
 
 
318 aa  337  1.9999999999999998e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.225159  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1003  thymidylate synthase  53.38 
 
 
318 aa  330  2e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67766  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1582  thymidylate synthase  53.38 
 
 
318 aa  330  2e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3105  thymidylate synthase  51.12 
 
 
318 aa  317  1e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.447667  hitchhiker  0.0000000000170345 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1639  thymidylate synthase  51.12 
 
 
318 aa  317  2e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00770076  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2219  thymidylate synthase  50.48 
 
 
318 aa  316  3e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.615313  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2082  thymidylate synthase  50.48 
 
 
318 aa  316  4e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314247  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2020  thymidylate synthase  50.48 
 
 
318 aa  316  4e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2236  thymidylate synthase  50.48 
 
 
318 aa  316  4e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.376946  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2263  thymidylate synthase  50.48 
 
 
318 aa  316  4e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45604e-29 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2266  thymidylate synthase  50.48 
 
 
318 aa  315  6e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0871479  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2348  thymidylate synthase  50.48 
 
 
318 aa  315  6e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000465459  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2020  thymidylate synthase  50.48 
 
 
318 aa  315  7e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2061  thymidylate synthase  50.16 
 
 
318 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691147  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0906  thymidylate synthase  55.1 
 
 
264 aa  311  5.999999999999999e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1050  thymidylate synthase  55.1 
 
 
264 aa  311  5.999999999999999e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2822  thymidylate synthase  53.06 
 
 
264 aa  307  1.0000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0100579  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2021  thymidylate synthase  53.4 
 
 
264 aa  306  2.0000000000000002e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2887  Thymidylate synthase  52.38 
 
 
264 aa  306  3e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.189852  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1289  thymidylate synthase  54.76 
 
 
264 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.994913  normal  0.497246 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2660  thymidylate synthase  52.38 
 
 
264 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.742104 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2802  thymidylate synthase  53.4 
 
 
264 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395384  normal  0.702269 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2543  thymidylate synthase  53.06 
 
 
264 aa  303  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.33393  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1422  thymidylate synthase  52.72 
 
 
264 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.54015 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2572  thymidylate synthase  51.7 
 
 
264 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.31562  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2782  Thymidylate synthase  51.7 
 
 
264 aa  301  7.000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0986115  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0350  thymidylate synthase  50.81 
 
 
277 aa  300  2e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.82099  normal  0.227002 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0600  Thymidylate synthase  50.34 
 
 
269 aa  298  7e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0736095 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3385  thymidylate synthase  50.68 
 
 
283 aa  298  9e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0593  thymidylate synthase  52.38 
 
 
264 aa  297  1e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.931359 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2832  thymidylate synthase  52.04 
 
 
264 aa  297  1e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1309  thymidylate synthase  52.38 
 
 
264 aa  297  1e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00097821  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1962  thymidylate synthase  50 
 
 
264 aa  296  2e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1592  thymidylate synthase  49.66 
 
 
264 aa  296  3e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00136284  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1751  thymidylate synthase  50.68 
 
 
264 aa  295  4e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0575891  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4213  thymidylate synthase  52.04 
 
 
264 aa  295  5e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2060  thymidylate synthase  51.02 
 
 
267 aa  294  1e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2040  thymidylate synthase  51.02 
 
 
264 aa  294  1e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00561284  normal  0.510775 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0830  thymidylate synthase  48.73 
 
 
318 aa  294  1e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0147447  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02675  thymidylate synthase  51.36 
 
 
264 aa  293  2e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0328967  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09380  thymidylate synthase  48.65 
 
 
264 aa  293  2e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.21237  normal  0.43537 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02636  hypothetical protein  51.36 
 
 
264 aa  293  2e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0282174  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2032  Thymidylate synthase  51 
 
 
271 aa  293  3e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00060457  hitchhiker  0.0000668058 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3147  thymidylate synthase  51.36 
 
 
264 aa  292  4e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00502438  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0864  Thymidylate synthase  51.36 
 
 
264 aa  292  4e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2974  thymidylate synthase  51.36 
 
 
264 aa  292  4e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0248193  normal  0.0110834 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3035  thymidylate synthase  51.36 
 
 
264 aa  292  4e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.14983  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4093  thymidylate synthase  51.36 
 
 
264 aa  292  4e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00531915  normal  0.186397 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5412  thymidylate synthase  49.83 
 
 
262 aa  292  5e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.113248  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3514  thymidylate synthase  50 
 
 
264 aa  291  6e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.34042  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2781  thymidylate synthase  50.68 
 
 
264 aa  291  6e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3821  thymidylate synthase  50.68 
 
 
264 aa  291  1e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0782248  normal  0.435378 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2973  thymidylate synthase  51.02 
 
 
264 aa  290  2e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.942182  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2448  thymidylate synthase  51.36 
 
 
264 aa  290  2e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.848435  normal  0.156064 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2351  thymidylate synthase  51.36 
 
 
264 aa  290  2e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.914614  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0436  thymidylate synthase  51.36 
 
 
264 aa  290  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.595283  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04480  thymidylate synthase  52.04 
 
 
264 aa  290  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0888  thymidylate synthase  51.02 
 
 
264 aa  290  2e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0769  thymidylate synthase  47.45 
 
 
320 aa  290  2e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2864  thymidylate synthase  47.95 
 
 
275 aa  289  4e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.292477 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3214  thymidylate synthase  51.02 
 
 
264 aa  289  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0238211 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3165  thymidylate synthase  51.02 
 
 
264 aa  289  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.623255  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3328  thymidylate synthase  51.02 
 
 
264 aa  289  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00937763 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3228  thymidylate synthase  51.02 
 
 
264 aa  289  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00434826 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3148  thymidylate synthase  51.02 
 
 
264 aa  289  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2027  thymidylate synthase  49.48 
 
 
285 aa  288  6e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.242999  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2927  thymidylate synthase  50.34 
 
 
264 aa  288  7e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3354  thymidylate synthase  51.02 
 
 
264 aa  288  7e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00819498 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4007  thymidylate synthase  51.02 
 
 
264 aa  288  7e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.997554  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0901  thymidylate synthase  51.7 
 
 
264 aa  288  9e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0984  thymidylate synthase  48.98 
 
 
264 aa  287  1e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00298799  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1036  thymidylate synthase  48.98 
 
 
264 aa  287  1e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2730  thymidylate synthase  51.02 
 
 
264 aa  287  1e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1471  thymidylate synthase  49.04 
 
 
283 aa  287  1e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0662  thymidylate synthase  50.68 
 
 
264 aa  287  1e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1091  thymidylate synthase  48.3 
 
 
264 aa  287  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0270966 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3269  thymidylate synthase  50.68 
 
 
264 aa  287  2e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0325419  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3195  thymidylate synthase  50.34 
 
 
264 aa  287  2e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.640259  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3266  thymidylate synthase  51.02 
 
 
264 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.394281  normal  0.266288 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0699  thymidylate synthase  47.96 
 
 
264 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.312797  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0371  thymidylate synthase  47.28 
 
 
264 aa  286  2.9999999999999996e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.634386  normal  0.315482 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3238  thymidylate synthase  48.98 
 
 
264 aa  286  4e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.488211  normal  0.397559 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48170  thymidylate synthase  51.02 
 
 
264 aa  285  4e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3396  thymidylate synthase  49.32 
 
 
264 aa  285  5.999999999999999e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0862662  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1355  thymidylate synthase  51.02 
 
 
264 aa  285  8e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0892428  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1399  thymidylate synthase  51.02 
 
 
264 aa  284  1.0000000000000001e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2036  thymidylate synthase  50 
 
 
264 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2331  thymidylate synthase  47.99 
 
 
286 aa  284  1.0000000000000001e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.226871 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1729  thymidylate synthase  47.88 
 
 
277 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04649  thymidylate synthase  49.32 
 
 
264 aa  283  2.0000000000000002e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0874843  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3014  thymidylate synthase  48.98 
 
 
264 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2861  thymidylate synthase  50.68 
 
 
264 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.390329  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2943  thymidylate synthase  50.68 
 
 
264 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0433853  normal  0.782101 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0907  thymidylate synthase  49.32 
 
 
264 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.639895  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1904  thymidylate synthase  46.69 
 
 
272 aa  282  4.0000000000000003e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6100  thymidylate synthase  50.34 
 
 
264 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.50271  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0867  thymidylate synthase  51.02 
 
 
264 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.126958 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4525  thymidylate synthase  48.64 
 
 
264 aa  282  5.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.659361 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>