More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4006 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4006  biotin synthase  100 
 
 		 335 aa  683    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4375  biotin synthase  100 
 
 		 335 aa  683    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4487  biotin synthase  96.48 
 
 		 341 aa  637    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.487965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6069  biotin synthase  85.19 
 
 		 333 aa  551  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.498375  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5411  biotin synthase  80.06 
 
 		 332 aa  531  1e-150  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.706844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5067  biotin synthase  80.71 
 
 		 337 aa  519  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0518791 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0419  biotin synthase  69.28 
 
 		 320 aa  443  1e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.22535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3108  biotin synthase  63.72 
 
 		 328 aa  427  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0655  biotin synthase  65.81 
 
 		 345 aa  423  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.477951  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14871  biotin synthase  65.81 
 
 		 345 aa  423  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.598492 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0535  biotin synthase  64.92 
 
 		 320 aa  410  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.464062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1632  biotin synthase  65.27 
 
 		 331 aa  405  1.0000000000000001e-112  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0149  biotin synthase  67.55 
 
 		 330 aa  403  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.464836 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10931  biotin synthase  61.86 
 
 		 332 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.894621  normal  0.366171 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09961  biotin synthase  60.38 
 
 		 335 aa  396  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.853518 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2405  biotin synthase  60.97 
 
 		 330 aa  395  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1394  biotin synthase  64.72 
 
 		 333 aa  395  1e-109  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4088  biotin synthase  59.42 
 
 		 352 aa  394  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.629007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4840  biotin synthase  58.1 
 
 		 352 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.738334 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06500  biotin synthase  58.2 
 
 		 352 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00342267  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0362  biotin synthase  58.1 
 
 		 352 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.309451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0600  biotin synthase  58.07 
 
 		 352 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11991  biotin synthase  58.28 
 
 		 335 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.496147  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1104  biotin synthase  58.65 
 
 		 335 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.915369  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2286  biotin synthase  61.17 
 
 		 331 aa  390  1e-107  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0215942 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3457  biotin synthase  58.33 
 
 		 364 aa  390  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000294325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0392  biotin synthase  58.1 
 
 		 352 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.92095  normal  0.311291 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0388  biotin synthase  57.78 
 
 		 352 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.402949  normal  0.564151 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0860  biotin synthase  55.56 
 
 		 350 aa  385  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0801  biotin synthase  56.63 
 
 		 363 aa  385  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0103  biotin synthase  60.31 
 
 		 322 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0757617  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4687  biotin synthase  58.41 
 
 		 352 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.747716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5176  biotin synthase  57.78 
 
 		 351 aa  385  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00545091  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3077  biotin synthase  59.52 
 
 		 336 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.784786  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2017  biotin synthase  59.52 
 
 		 339 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0388  biotin synthase  59.52 
 
 		 339 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0337  biotin synthase  59.52 
 
 		 339 aa  386  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1410  biotin synthase  58.04 
 
 		 375 aa  387  1e-106  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000875332  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05980  Biotin synthase  57.1 
 
 		 351 aa  385  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0117  biotin synthase  62.01 
 
 		 359 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0125  biotin synthase  61.69 
 
 		 362 aa  385  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2269  biotin synthase  59.52 
 
 		 339 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0409  biotin synthase  59.52 
 
 		 336 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0266  biotin synthase protein  61.69 
 
 		 360 aa  384  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0494  biotin synthetase  57.14 
 
 		 352 aa  381  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0570  biotin synthase  59.21 
 
 		 339 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.965755  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4030  biotin synthase  60.06 
 
 		 345 aa  382  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.959642 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2756  biotin synthase  56.37 
 
 		 352 aa  383  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3139  biotin synthase  57.46 
 
 		 350 aa  382  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00181497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2466  biotin synthase  59.48 
 
 		 337 aa  383  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0190546 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1125  biotin synthetase  58.73 
 
 		 333 aa  379  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0131  biotin synthase  59.81 
 
 		 340 aa  378  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0630  biotin synthase  57.14 
 
 		 350 aa  381  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000166613  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0170  biotin synthase  60.46 
 
 		 351 aa  380  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3396  biotin synthase  64.19 
 
 		 336 aa  379  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.301102  normal  0.739802 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0444  biotin synthase  60.78 
 
 		 361 aa  379  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12001  biotin synthase  59.67 
 
 		 314 aa  378  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.678797  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2557  biotin synthase  56.62 
 
 		 369 aa  378  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000730416  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2101  biotin synthase  57.5 
 
 		 345 aa  375  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0923  biotin synthase  58.2 
 
 		 346 aa  374  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0506953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4266  biotin synthase  60.13 
 
 		 360 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0569769 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02211  Biotin synthase  56.01 
 
 		 374 aa  375  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02695  Biotin synthase  56.31 
 
 		 362 aa  377  1e-103  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.175174  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1536  biotin synthase  60.84 
 
 		 326 aa  375  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00742  biotin synthase  58.2 
 
 		 346 aa  374  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000391904  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2867  biotin synthase  58.2 
 
 		 346 aa  374  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0449634  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0828  biotin synthase  58.2 
 
 		 346 aa  374  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000258207  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2740  biotin synthase  56.79 
 
 		 350 aa  371  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0798  biotin synthase  58.2 
 
 		 346 aa  374  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000218975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2868  biotin synthase  58.2 
 
 		 346 aa  374  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0428479  normal  0.0299932 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00759  hypothetical protein  58.2 
 
 		 346 aa  374  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00062155  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0838  biotin synthase  58.2 
 
 		 346 aa  374  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000158311  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2359  biotin synthase  57.64 
 
 		 350 aa  372  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000401407 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2431  biotin synthase  57.64 
 
 		 350 aa  372  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0409194 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2519  biotin synthase  57.64 
 
 		 350 aa  372  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000351956 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2577  biotin synthase  58.52 
 
 		 346 aa  374  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000942413  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0036  biotin synthase  56.56 
 
 		 368 aa  368  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003871  biotin synthase  54.43 
 
 		 350 aa  368  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11841  biotin synthase  57.69 
 
 		 335 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.47971  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1580  biotin synthase  57.91 
 
 		 344 aa  369  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01807  biotin synthase  54.43 
 
 		 356 aa  369  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1438  biotin synthase  56.97 
 
 		 354 aa  369  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.26133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1719  biotin synthase  58.92 
 
 		 350 aa  369  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0119643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2345  biotin synthase  56.69 
 
 		 350 aa  366  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.996605  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1425  biotin synthase  56.59 
 
 		 345 aa  365  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2844  biotin synthase  56.59 
 
 		 345 aa  366  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1311  biotin synthase  57.56 
 
 		 345 aa  368  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.641744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2931  biotin synthase  56.59 
 
 		 345 aa  365  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1475  biotin synthase  57.96 
 
 		 350 aa  366  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2983  biotin synthase  60 
 
 		 339 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2776  biotin synthase  56.69 
 
 		 354 aa  366  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000782916  normal  0.0347779 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0858  biotin synthase  57.19 
 
 		 346 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.353933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0889  biotin synthase  56.86 
 
 		 346 aa  364  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1795  biotin synthase  56.37 
 
 		 350 aa  364  1e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.46319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2527  biotin synthase  56.37 
 
 		 350 aa  364  1e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0179577 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0371  biotin synthase  58.59 
 
 		 339 aa  364  1e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.478786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0944  biotin synthase  56.86 
 
 		 346 aa  364  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.451063  normal  0.921824 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0921  biotin synthase  56.86 
 
 		 346 aa  364  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1758  biotin synthase  56.37 
 
 		 350 aa  364  1e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1751  biotin synthase  56.37 
 
 		 350 aa  364  1e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>