37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3952 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3952  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
116 aa  231  3e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0731  MarR family transcriptional regulator  71.55 
 
 
116 aa  173  9e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2180  transcriptional regulator, putative  71.55 
 
 
116 aa  171  2.9999999999999996e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.846727  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2092  putative transcriptional regulator  70.69 
 
 
116 aa  169  7.999999999999999e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.696757  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0296  hypothetical protein  58.77 
 
 
116 aa  132  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.128484  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0139  MarR family transcriptional regulator  56.76 
 
 
117 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3360  MarR family transcriptional regulator  64.04 
 
 
114 aa  127  6e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.592364  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0243  MarR family transcriptional regulator  56.25 
 
 
123 aa  121  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4486  transcriptional regulator, MarR family  60.34 
 
 
116 aa  114  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4197  transcriptional regulator, MarR family  60.34 
 
 
116 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0251  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 
136 aa  91.7  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.493522  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0418  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 
129 aa  87.8  5e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000420026  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0097  MarR family transcriptional regulator  50.52 
 
 
109 aa  86.3  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.427273  normal  0.972576 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0429  MarR family transcriptional regulator  40.57 
 
 
133 aa  73.2  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0931  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
168 aa  49.3  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2823  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3956  MarR family transcriptional regulator  28.92 
 
 
148 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4196  MarR family transcriptional regulator  30.12 
 
 
182 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4259  transcriptional regulator, MarR family  30.12 
 
 
148 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4235  transcriptional regulator, MarR family  30.12 
 
 
148 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1001  transcriptional regulator, MarR family  30.12 
 
 
148 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4149  transcriptional regulator, MarR family  30.12 
 
 
148 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4348  MarR family transcriptional regulator  30.12 
 
 
148 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3880  MarR family transcriptional regulator  30.12 
 
 
148 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230852  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3866  MarR family transcriptional regulator  30.12 
 
 
148 aa  45.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0257058  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4033  MarR family transcriptional regulator  30.12 
 
 
148 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1316  transcriptional regulator, MarR family  33.78 
 
 
153 aa  43.1  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.061965 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7584  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1028  MarR family transcriptional regulator  28.16 
 
 
167 aa  42.7  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0619  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 
156 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6090  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 
155 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441137  normal  0.170401 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01154  transcriptional regulator MarR family  35.71 
 
 
146 aa  41.6  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.819197  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1236  transcriptional regulator, TrmB  35.56 
 
 
153 aa  41.2  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.475364 
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  29.75 
 
 
153 aa  40.8  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0706  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 
145 aa  40  0.01  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.928225  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0625  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 
145 aa  40  0.01  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.427597  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>